RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 PLCH2O75038 1416 aa26.42■■□□□ 1.82
SH3BP2-215ENST00000510074 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
SH3BP2-215ENST00000510074 HECW1Q76N89 1606 aa26.39■■□□□ 1.81
SH3BP2-215ENST00000510074 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.38■■□□□ 1.81
SH3BP2-215ENST00000510074 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-215ENST00000510074 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-215ENST00000510074 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
SH3BP2-215ENST00000510074 ATP10AO60312 1499 aa26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-215ENST00000510074 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
SH3BP2-215ENST00000510074 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.34■■□□□ 1.81
SH3BP2-215ENST00000510074 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2-215ENST00000510074 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.31■■□□□ 1.8
SH3BP2-215ENST00000510074 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-215ENST00000510074 AFAP1Q8N556 730 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-215ENST00000510074 FMN1Q68DA7 1419 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-215ENST00000510074 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-215ENST00000510074 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-215ENST00000510074 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-215ENST00000510074 CLIP1P30622 1438 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-215ENST00000510074 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-215ENST00000510074 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-215ENST00000510074 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-215ENST00000510074 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-215ENST00000510074 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-215ENST00000510074 KIF14Q15058 1648 aa26.14■■□□□ 1.77
SH3BP2-215ENST00000510074 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-215ENST00000510074 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-215ENST00000510074 KDM5CP41229 1560 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-215ENST00000510074 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP2-215ENST00000510074 STRCQ7RTU9 1775 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP2-215ENST00000510074 ILDR2Q71H61 639 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-215ENST00000510074 PTPRTO14522 1441 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-215ENST00000510074 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-215ENST00000510074 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-215ENST00000510074 SOCS7O14512 581 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2-215ENST00000510074 REREQ9P2R6 1566 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
SH3BP2-215ENST00000510074 AGLP35573 1532 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-215ENST00000510074 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-215ENST00000510074 ABCA6Q8N139 1617 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-215ENST00000510074 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-215ENST00000510074 C3P01024 1663 aa25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-215ENST00000510074 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-215ENST00000510074 ABCC1P33527 1531 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-215ENST00000510074 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-215ENST00000510074 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-215ENST00000510074 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-215ENST00000510074 ZMYM3Q14202 1370 aa25.9■■□□□ 1.74
SH3BP2-215ENST00000510074 PREX2Q70Z35 1606 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-215ENST00000510074 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.746e-9■□□□□ 10
SH3BP2-215ENST00000510074 NCOA1Q15788 1441 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-215ENST00000510074 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-215ENST00000510074 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-215ENST00000510074 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-215ENST00000510074 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-215ENST00000510074 NPATQ14207 1427 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-215ENST00000510074 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-215ENST00000510074 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-215ENST00000510074 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-215ENST00000510074 GGT6Q6P531 493 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-215ENST00000510074 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-215ENST00000510074 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP2-215ENST00000510074 PKD2Q13563 968 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BP2-215ENST00000510074 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.79■■□□□ 1.72
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
SH3BP2-215ENST00000510074 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2-215ENST00000510074 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BP2-215ENST00000510074 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SH3BP2-215ENST00000510074 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-215ENST00000510074 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2-215ENST00000510074 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BP2-215ENST00000510074 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-215ENST00000510074 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-215ENST00000510074 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-215ENST00000510074 MROH2AA6NES4 1674 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-215ENST00000510074 A2MP01023 1474 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BP2-215ENST00000510074 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BP2-215ENST00000510074 ATP7AQ04656 1500 aa25.69■■□□□ 1.7
SH3BP2-215ENST00000510074 PTPRKQ15262 1439 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP2-215ENST00000510074 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
SH3BP2-215ENST00000510074 PLA2R1Q13018 1463 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP2-215ENST00000510074 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-215ENST00000510074 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-215ENST00000510074 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SH3BP2-215ENST00000510074 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-215ENST00000510074 PLXNC1O60486 1568 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-215ENST00000510074 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP2-215ENST00000510074 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-215ENST00000510074 PIP4K2BP78356 416 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-215ENST00000510074 TOM1O60784 492 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2-215ENST00000510074 KIF3BO15066 747 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
SH3BP2-215ENST00000510074 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
SH3BP2-215ENST00000510074 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2-215ENST00000510074 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2-215ENST00000510074 HSPA1LP34931 641 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-215ENST00000510074 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-215ENST00000510074 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.4 ms