RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508870.5

NREP-216, Transcript of neuronal regeneration related protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene NREP, Length 540 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREP-216ENST00000508870 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.11■■■■■ 4.33
NREP-216ENST00000508870 HECW1Q76N89 1606 aa42.1■■■■■ 4.33
NREP-216ENST00000508870 PLCH2O75038 1416 aa42.1■■■■■ 4.33
NREP-216ENST00000508870 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.06■■■■■ 4.32
NREP-216ENST00000508870 FMN1Q68DA7 1419 aa42.02■■■■■ 4.32
NREP-216ENST00000508870 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.98■■■■■ 4.31
NREP-216ENST00000508870 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.97■■■■■ 4.31
NREP-216ENST00000508870 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
NREP-216ENST00000508870 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.93■■■■■ 4.3
NREP-216ENST00000508870 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.93■■■■■ 4.3
NREP-216ENST00000508870 ATP10AO60312 1499 aa41.91■■■■■ 4.3
NREP-216ENST00000508870 KIF14Q15058 1648 aa41.91■■■■■ 4.3
NREP-216ENST00000508870 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.87■■■■■ 4.29
NREP-216ENST00000508870 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.84■■■■■ 4.29
NREP-216ENST00000508870 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
NREP-216ENST00000508870 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.83■■■■■ 4.29
NREP-216ENST00000508870 AFAP1Q8N556 730 aa41.81■■■■■ 4.28
NREP-216ENST00000508870 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.8■■■■■ 4.28
NREP-216ENST00000508870 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
NREP-216ENST00000508870 CLIP1P30622 1438 aa41.78■■■■■ 4.28
NREP-216ENST00000508870 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.78■■■■■ 4.28
NREP-216ENST00000508870 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.77■■■■■ 4.28
NREP-216ENST00000508870 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.71■■■■■ 4.27
NREP-216ENST00000508870 CERKQ8TCT0 537 aa41.68■■■■■ 4.26
NREP-216ENST00000508870 KDM5CP41229 1560 aa41.67■■■■■ 4.26
NREP-216ENST00000508870 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.64■■■■■ 4.26
NREP-216ENST00000508870 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.61■■■■■ 4.25
NREP-216ENST00000508870 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa41.6■■■■■ 4.25
NREP-216ENST00000508870 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.54■■■■■ 4.24
NREP-216ENST00000508870 ABCA6Q8N139 1617 aa41.54■■■■■ 4.24
NREP-216ENST00000508870 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.52■■■■■ 4.24
NREP-216ENST00000508870 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.52■■■■■ 4.24
NREP-216ENST00000508870 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.52■■■■■ 4.24
NREP-216ENST00000508870 PREX2Q70Z35 1606 aa41.51■■■■■ 4.23
NREP-216ENST00000508870 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.5■■■■■ 4.23
NREP-216ENST00000508870 ABCC1P33527 1531 aa41.49■■■■■ 4.23
NREP-216ENST00000508870 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
NREP-216ENST00000508870 REREQ9P2R6 1566 aa41.47■■■■■ 4.23
NREP-216ENST00000508870 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.44■■■■■ 4.22
NREP-216ENST00000508870 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.44■■■■■ 4.22
NREP-216ENST00000508870 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
NREP-216ENST00000508870 STRCQ7RTU9 1775 aa41.42■■■■■ 4.22
NREP-216ENST00000508870 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
NREP-216ENST00000508870 C3P01024 1663 aa41.39■■■■■ 4.22
NREP-216ENST00000508870 AGLP35573 1532 aa41.37■■■■■ 4.21
NREP-216ENST00000508870 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa41.36■■■■■ 4.21
NREP-216ENST00000508870 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.35■■■■■ 4.21
NREP-216ENST00000508870 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.3■■■■■ 4.2
NREP-216ENST00000508870 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.25■■■■■ 4.19
NREP-216ENST00000508870 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.25■■■■■ 4.19
NREP-216ENST00000508870 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.23■■■■■ 4.19
NREP-216ENST00000508870 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.23■■■■■ 4.19
NREP-216ENST00000508870 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
NREP-216ENST00000508870 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
NREP-216ENST00000508870 PTPRTO14522 1441 aa41.2■■■■■ 4.19
NREP-216ENST00000508870 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
NREP-216ENST00000508870 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
NREP-216ENST00000508870 ZMYM3Q14202 1370 aa41.11■■■■■ 4.17
NREP-216ENST00000508870 NCOA1Q15788 1441 aa41.1■■■■■ 4.17
NREP-216ENST00000508870 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.1■■■■■ 4.17
NREP-216ENST00000508870 ATP7AQ04656 1500 aa41.08■■■■■ 4.17
NREP-216ENST00000508870 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.07■■■■■ 4.16
NREP-216ENST00000508870 NPATQ14207 1427 aa41.04■■■■■ 4.16
NREP-216ENST00000508870 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.04■■■■■ 4.16
NREP-216ENST00000508870 MROH2AA6NES4 1674 aa41.04■■■■■ 4.16
NREP-216ENST00000508870 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.04■■■■■ 4.16
NREP-216ENST00000508870 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.03■■■■■ 4.16
NREP-216ENST00000508870 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.02■■■■■ 4.16
NREP-216ENST00000508870 GGT6Q6P531 493 aa41.02■■■■■ 4.16
NREP-216ENST00000508870 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.01■■■■■ 4.16
NREP-216ENST00000508870 A2MP01023 1474 aa41.01■■■■■ 4.16
NREP-216ENST00000508870 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
NREP-216ENST00000508870 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
NREP-216ENST00000508870 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.98■■■■■ 4.15
NREP-216ENST00000508870 PLXNC1O60486 1568 aa40.95■■■■■ 4.15
NREP-216ENST00000508870 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.15
NREP-216ENST00000508870 ILDR2Q71H61 639 aa40.93■■■■■ 4.14
NREP-216ENST00000508870 PTPRKQ15262 1439 aa40.87■■■■■ 4.13
NREP-216ENST00000508870 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.86■■■■■ 4.13
NREP-216ENST00000508870 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
NREP-216ENST00000508870 TIAM1Q13009 1591 aa40.84■■■■■ 4.13
NREP-216ENST00000508870 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.83■■■■■ 4.13
NREP-216ENST00000508870 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
NREP-216ENST00000508870 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.81■■■■■ 4.12
NREP-216ENST00000508870 PKD2Q13563 968 aa40.79■■■■■ 4.12
NREP-216ENST00000508870 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
NREP-216ENST00000508870 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.78■■■■■ 4.12
NREP-216ENST00000508870 MBD5Q9P267 1494 aa40.77■■■■■ 4.12
NREP-216ENST00000508870 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.76■■■■■ 4.12
NREP-216ENST00000508870 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.76■■■■■ 4.12
NREP-216ENST00000508870 PLA2R1Q13018 1463 aa40.76■■■■■ 4.12
NREP-216ENST00000508870 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.72■■■■■ 4.11
NREP-216ENST00000508870 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
NREP-216ENST00000508870 CEP162Q5TB80 1403 aa40.7■■■■■ 4.11
NREP-216ENST00000508870 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
NREP-216ENST00000508870 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.68■■■■■ 4.1
NREP-216ENST00000508870 SOCS7O14512 581 aa40.68■■■■■ 4.1
NREP-216ENST00000508870 KIF3BO15066 747 aa40.67■■■■■ 4.1
NREP-216ENST00000508870 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.64■■■■■ 4.1
NREP-216ENST00000508870 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms