RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.6■■■■□ 3.61
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.57■■■■□ 3.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.56■■■■□ 3.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.54■■■■□ 3.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.54■■■■□ 3.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.53■■■■□ 3.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.53■■■■□ 3.6
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.5■■■■□ 3.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEP162Q5TB80 1403 aa37.46■■■■□ 3.59
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PREX2Q70Z35 1606 aa37.44■■■■□ 3.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTPRMP28827 1452 aa37.44■■■■□ 3.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.43■■■■□ 3.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AFAP1Q8N556 730 aa37.43■■■■□ 3.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.42■■■■□ 3.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.42■■■■□ 3.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MADDQ8WXG6 1647 aa37.41■■■■□ 3.58
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.38■■■■□ 3.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP10AO60312 1499 aa37.37■■■■□ 3.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.36■■■■□ 3.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MLECQ14165 292 aa37.35■■■■□ 3.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.35■■■■□ 3.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.34■■■■□ 3.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KDM5CP41229 1560 aa37.32■■■■□ 3.56
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.31■■■■□ 3.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCC1P33527 1531 aa37.31■■■■□ 3.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.28■■■■□ 3.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.27■■■■□ 3.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.26■■■■□ 3.56
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.25■■■■□ 3.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.24■■■■□ 3.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.21■■■■□ 3.55
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.18■■■■□ 3.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.18■■■■□ 3.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.17■■■■□ 3.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.16■■■■□ 3.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.16■■■■□ 3.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCA6Q8N139 1617 aa37.14■■■■□ 3.54
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.13■■■■□ 3.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.09■■■■□ 3.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.09■■■■□ 3.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 REREQ9P2R6 1566 aa37.08■■■■□ 3.53
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.07■■■■□ 3.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TIAM1Q13009 1591 aa37.06■■■■□ 3.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.04■■■■□ 3.52
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.01■■■■□ 3.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AGLP35573 1532 aa36.99■■■■□ 3.51
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 NCOA2Q15596 1464 aa36.95■■■■□ 3.51
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSPA2P54652 639 aa36.9■■■■□ 3.5
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 A2MP01023 1474 aa36.82■■■■□ 3.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.79■■■■□ 3.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP3K1Q13233 1512 aa36.79■■■■□ 3.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.78■■■■□ 3.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C3P01024 1663 aa36.77■■■■□ 3.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.76■■■■□ 3.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.74■■■■□ 3.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.74■■■■□ 3.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.74■■■■□ 3.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLXNC1O60486 1568 aa36.74■■■■□ 3.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APLP2Q06481 763 aa36.73■■■■□ 3.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.73■■■■□ 3.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GGT6Q6P531 493 aa36.71■■■■□ 3.47
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.69■■■■□ 3.46
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSPY10P0CW01 314 aa36.65■■■■□ 3.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZMYM3Q14202 1370 aa36.64■■■■□ 3.46
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MROH2AA6NES4 1674 aa36.63■■■■□ 3.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.61■■■■□ 3.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.59■■■■□ 3.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.58■■■■□ 3.45
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MIA2Q96PC5 1412 aa36.56■■■■□ 3.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF3BO15066 747 aa36.55■■■■□ 3.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPATQ14207 1427 aa36.52■■■■□ 3.44
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.47■■■■□ 3.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STRCQ7RTU9 1775 aa36.45■■■■□ 3.43
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXO41Q8TF61 875 aa36.43■■■■□ 3.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.42■■■■□ 3.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTPRKQ15262 1439 aa36.42■■■■□ 3.42
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.38■■■■□ 3.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.36■■■■□ 3.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.34■■■■□ 3.41
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.32■■■■□ 3.4
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.31■■■■□ 3.4
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