RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 HFM1A2PYH4 1435 aa15.89■□□□□ 0.13
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SH3BP2-209ENST00000504450 ATP10BO94823 1461 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-209ENST00000504450 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-209ENST00000504450 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-209ENST00000504450 AKNAQ7Z591 1439 aa15.84■□□□□ 0.13
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SH3BP2-209ENST00000504450 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP2-209ENST00000504450 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.79■□□□□ 0.12
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.79■□□□□ 0.12
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SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
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SH3BP2-209ENST00000504450 CD109Q6YHK3 1445 aa15.74■□□□□ 0.11
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SH3BP2-209ENST00000504450 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP2-209ENST00000504450 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.72■□□□□ 0.11
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SH3BP2-209ENST00000504450 NCOA1Q15788 1441 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.63■□□□□ 0.09
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SH3BP2-209ENST00000504450 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-209ENST00000504450 MBD5Q9P267 1494 aa15.59■□□□□ 0.09
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SH3BP2-209ENST00000504450 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.57■□□□□ 0.08
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SH3BP2-209ENST00000504450 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 TONSLQ96HA7 1378 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.53■□□□□ 0.08
SH3BP2-209ENST00000504450 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
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SH3BP2-209ENST00000504450 PKD2Q13563 968 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 FANCAO15360 1455 aa15.39■□□□□ 0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 ABCC1P33527 1531 aa15.38■□□□□ 0.05
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SH3BP2-209ENST00000504450 MLECQ14165 292 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.35■□□□□ 0.05
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