RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.56■■■□□ 2.32
TM2D1-211ENST00000496465 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.55■■■□□ 2.32
TM2D1-211ENST00000496465 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.54■■■□□ 2.32
TM2D1-211ENST00000496465 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.52■■■□□ 2.32
TM2D1-211ENST00000496465 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.52■■■□□ 2.32
TM2D1-211ENST00000496465 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.5■■■□□ 2.31
TM2D1-211ENST00000496465 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
TM2D1-211ENST00000496465 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.48■■■□□ 2.31
TM2D1-211ENST00000496465 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.47■■■□□ 2.31
TM2D1-211ENST00000496465 PREX2Q70Z35 1606 aa29.47■■■□□ 2.31
TM2D1-211ENST00000496465 PTPRMP28827 1452 aa29.45■■■□□ 2.31
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TM2D1-211ENST00000496465 MADDQ8WXG6 1647 aa29.45■■■□□ 2.3
TM2D1-211ENST00000496465 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.43■■■□□ 2.3
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.42■■■□□ 2.3
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TM2D1-211ENST00000496465 CEP162Q5TB80 1403 aa29.37■■■□□ 2.29
TM2D1-211ENST00000496465 ATP10AO60312 1499 aa29.36■■■□□ 2.29
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TM2D1-211ENST00000496465 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.32■■■□□ 2.28
TM2D1-211ENST00000496465 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.31■■■□□ 2.28
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TM2D1-211ENST00000496465 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.28■■■□□ 2.28
TM2D1-211ENST00000496465 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.27■■■□□ 2.28
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TM2D1-211ENST00000496465 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.26■■■□□ 2.27
TM2D1-211ENST00000496465 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.25■■■□□ 2.27
TM2D1-211ENST00000496465 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.24■■■□□ 2.27
TM2D1-211ENST00000496465 REREQ9P2R6 1566 aa29.24■■■□□ 2.27
TM2D1-211ENST00000496465 ABCA6Q8N139 1617 aa29.23■■■□□ 2.27
TM2D1-211ENST00000496465 MLECQ14165 292 aa29.2■■■□□ 2.26
TM2D1-211ENST00000496465 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.2■■■□□ 2.26
TM2D1-211ENST00000496465 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.2■■■□□ 2.26
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TM2D1-211ENST00000496465 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.18■■■□□ 2.26
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
TM2D1-211ENST00000496465 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.16■■■□□ 2.26
TM2D1-211ENST00000496465 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.16■■■□□ 2.26
TM2D1-211ENST00000496465 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
TM2D1-211ENST00000496465 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.14■■■□□ 2.26
TM2D1-211ENST00000496465 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.14■■■□□ 2.26
TM2D1-211ENST00000496465 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.14■■■□□ 2.26
TM2D1-211ENST00000496465 TIAM1Q13009 1591 aa29.13■■■□□ 2.25
TM2D1-211ENST00000496465 AGLP35573 1532 aa29.13■■■□□ 2.25
TM2D1-211ENST00000496465 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.09■■■□□ 2.25
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TM2D1-211ENST00000496465 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.05■■■□□ 2.24
TM2D1-211ENST00000496465 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
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TM2D1-211ENST00000496465 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
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TM2D1-211ENST00000496465 PLXNC1O60486 1568 aa28.95■■■□□ 2.22
TM2D1-211ENST00000496465 MAP3K1Q13233 1512 aa28.94■■■□□ 2.22
TM2D1-211ENST00000496465 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.93■■■□□ 2.22
TM2D1-211ENST00000496465 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.93■■■□□ 2.22
TM2D1-211ENST00000496465 HSPA2P54652 639 aa28.92■■■□□ 2.22
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TM2D1-211ENST00000496465 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.89■■■□□ 2.22
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TM2D1-211ENST00000496465 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.82■■■□□ 2.2
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TM2D1-211ENST00000496465 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.74■■■□□ 2.19
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TM2D1-211ENST00000496465 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.71■■■□□ 2.19
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TM2D1-211ENST00000496465 TSPY4P0CV99 314 aa28.68■■■□□ 2.18
TM2D1-211ENST00000496465 TSPY10P0CW01 314 aa28.68■■■□□ 2.18
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TM2D1-211ENST00000496465 PTPRKQ15262 1439 aa28.63■■■□□ 2.17
TM2D1-211ENST00000496465 FBXO41Q8TF61 875 aa28.63■■■□□ 2.17
TM2D1-211ENST00000496465 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.63■■■□□ 2.17
TM2D1-211ENST00000496465 KIF3BO15066 747 aa28.62■■■□□ 2.17
TM2D1-211ENST00000496465 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.62■■■□□ 2.17
TM2D1-211ENST00000496465 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.6■■■□□ 2.17
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
TM2D1-211ENST00000496465 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.57■■■□□ 2.16
TM2D1-211ENST00000496465 NCOA1Q15788 1441 aa28.56■■■□□ 2.16
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