RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493715.1

CHTF18-212, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 691 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-212ENST00000493715 HECW1Q76N89 1606 aa22.71■■□□□ 1.23
CHTF18-212ENST00000493715 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.67■■□□□ 1.22
CHTF18-212ENST00000493715 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.66■■□□□ 1.22
CHTF18-212ENST00000493715 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.65■■□□□ 1.22
CHTF18-212ENST00000493715 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.63■■□□□ 1.21
CHTF18-212ENST00000493715 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.63■■□□□ 1.21
CHTF18-212ENST00000493715 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CHTF18-212ENST00000493715 ATP10AO60312 1499 aa22.62■■□□□ 1.21
CHTF18-212ENST00000493715 PLCH2O75038 1416 aa22.62■■□□□ 1.21
CHTF18-212ENST00000493715 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.58■■□□□ 1.21
CHTF18-212ENST00000493715 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CHTF18-212ENST00000493715 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.57■■□□□ 1.2
CHTF18-212ENST00000493715 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.56■■□□□ 1.2
CHTF18-212ENST00000493715 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.54■■□□□ 1.2
CHTF18-212ENST00000493715 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.54■■□□□ 1.2
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.53■■□□□ 1.2
CHTF18-212ENST00000493715 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CHTF18-212ENST00000493715 STRCQ7RTU9 1775 aa22.51■■□□□ 1.19
CHTF18-212ENST00000493715 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CHTF18-212ENST00000493715 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CHTF18-212ENST00000493715 KIF14Q15058 1648 aa22.49■■□□□ 1.19
CHTF18-212ENST00000493715 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.48■■□□□ 1.19
CHTF18-212ENST00000493715 FMN1Q68DA7 1419 aa22.48■■□□□ 1.19
CHTF18-212ENST00000493715 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.47■■□□□ 1.19
CHTF18-212ENST00000493715 KDM5CP41229 1560 aa22.47■■□□□ 1.19
CHTF18-212ENST00000493715 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.47■■□□□ 1.19
CHTF18-212ENST00000493715 SOCS7O14512 581 aa22.45■■□□□ 1.18
CHTF18-212ENST00000493715 ILDR2Q71H61 639 aa22.45■■□□□ 1.18
CHTF18-212ENST00000493715 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CHTF18-212ENST00000493715 REREQ9P2R6 1566 aa22.43■■□□□ 1.18
CHTF18-212ENST00000493715 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.43■■□□□ 1.18
CHTF18-212ENST00000493715 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.42■■□□□ 1.18
CHTF18-212ENST00000493715 CLIP1P30622 1438 aa22.42■■□□□ 1.18
CHTF18-212ENST00000493715 PTPRTO14522 1441 aa22.41■■□□□ 1.18
CHTF18-212ENST00000493715 AFAP1Q8N556 730 aa22.41■■□□□ 1.18
CHTF18-212ENST00000493715 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CHTF18-212ENST00000493715 C3P01024 1663 aa22.41■■□□□ 1.18
CHTF18-212ENST00000493715 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CHTF18-212ENST00000493715 ABCA6Q8N139 1617 aa22.39■■□□□ 1.17
CHTF18-212ENST00000493715 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.36■■□□□ 1.17
CHTF18-212ENST00000493715 AGLP35573 1532 aa22.35■■□□□ 1.17
CHTF18-212ENST00000493715 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.34■■□□□ 1.17
CHTF18-212ENST00000493715 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.34■■□□□ 1.17
CHTF18-212ENST00000493715 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.33■■□□□ 1.17
CHTF18-212ENST00000493715 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.31■■□□□ 1.16
CHTF18-212ENST00000493715 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.31■■□□□ 1.16
CHTF18-212ENST00000493715 PREX2Q70Z35 1606 aa22.31■■□□□ 1.16
CHTF18-212ENST00000493715 ABCC1P33527 1531 aa22.31■■□□□ 1.16
CHTF18-212ENST00000493715 NCOA1Q15788 1441 aa22.3■■□□□ 1.16
CHTF18-212ENST00000493715 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.3■■□□□ 1.16
CHTF18-212ENST00000493715 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.28■■□□□ 1.16
CHTF18-212ENST00000493715 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.25■■□□□ 1.15
CHTF18-212ENST00000493715 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.24■■□□□ 1.15
CHTF18-212ENST00000493715 MROH2AA6NES4 1674 aa22.23■■□□□ 1.15
CHTF18-212ENST00000493715 NPATQ14207 1427 aa22.23■■□□□ 1.15
CHTF18-212ENST00000493715 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.22■■□□□ 1.15
CHTF18-212ENST00000493715 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.2■■□□□ 1.14
CHTF18-212ENST00000493715 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.18■■□□□ 1.14
CHTF18-212ENST00000493715 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.16■■□□□ 1.14
CHTF18-212ENST00000493715 ZMYM3Q14202 1370 aa22.15■■□□□ 1.14
CHTF18-212ENST00000493715 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.13■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.13■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.13■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.12■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.12■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 PLA2R1Q13018 1463 aa22.12■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 PKD2Q13563 968 aa22.1■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 ATP7AQ04656 1500 aa22.09■■□□□ 1.13
CHTF18-212ENST00000493715 PLXNC1O60486 1568 aa22.07■■□□□ 1.12
CHTF18-212ENST00000493715 CEP162Q5TB80 1403 aa22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-212ENST00000493715 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CHTF18-212ENST00000493715 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-212ENST00000493715 A2MP01023 1474 aa22.05■■□□□ 1.12
CHTF18-212ENST00000493715 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-212ENST00000493715 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-212ENST00000493715 PTPRKQ15262 1439 aa22.04■■□□□ 1.12
CHTF18-212ENST00000493715 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
CHTF18-212ENST00000493715 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-212ENST00000493715 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.02■■□□□ 1.12
CHTF18-212ENST00000493715 GGT6Q6P531 493 aa22■■□□□ 1.11
CHTF18-212ENST00000493715 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-212ENST00000493715 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CHTF18-212ENST00000493715 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-212ENST00000493715 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CHTF18-212ENST00000493715 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.96■■□□□ 1.11
CHTF18-212ENST00000493715 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.96■■□□□ 1.11
CHTF18-212ENST00000493715 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CHTF18-212ENST00000493715 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CHTF18-212ENST00000493715 CPS1P31327 1500 aa21.93■■□□□ 1.1
CHTF18-212ENST00000493715 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CHTF18-212ENST00000493715 TOM1O60784 492 aa21.91■■□□□ 1.1
CHTF18-212ENST00000493715 HSPA1LP34931 641 aa21.9■■□□□ 1.1
CHTF18-212ENST00000493715 PIP4K2BP78356 416 aa21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms