RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492135.5

NOP56-216, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOP56, Length 1,143 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-216ENST00000492135 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.72■■□□□ 1.23
NOP56-216ENST00000492135 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
NOP56-216ENST00000492135 ADGRL1O94910 1474 aa22.69■■□□□ 1.22
NOP56-216ENST00000492135 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.69■■□□□ 1.22
NOP56-216ENST00000492135 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
NOP56-216ENST00000492135 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.66■■□□□ 1.22
NOP56-216ENST00000492135 MAP3K1Q13233 1512 aa22.65■■□□□ 1.22
NOP56-216ENST00000492135 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.64■■□□□ 1.21
NOP56-216ENST00000492135 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.63■■□□□ 1.21
NOP56-216ENST00000492135 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP56-216ENST00000492135 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
NOP56-216ENST00000492135 ABCC1P33527 1531 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP56-216ENST00000492135 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP56-216ENST00000492135 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.61■■□□□ 1.21
NOP56-216ENST00000492135 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NOP56-216ENST00000492135 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.6■■□□□ 1.21
NOP56-216ENST00000492135 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.6■■□□□ 1.21
NOP56-216ENST00000492135 NCOA2Q15596 1464 aa22.6■■□□□ 1.21
NOP56-216ENST00000492135 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.57■■□□□ 1.2
NOP56-216ENST00000492135 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.57■■□□□ 1.2
NOP56-216ENST00000492135 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.56■■□□□ 1.2
NOP56-216ENST00000492135 KDM5CP41229 1560 aa22.55■■□□□ 1.2
NOP56-216ENST00000492135 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.55■■□□□ 1.2
NOP56-216ENST00000492135 AFAP1Q8N556 730 aa22.54■■□□□ 1.2
NOP56-216ENST00000492135 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NOP56-216ENST00000492135 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.54■■□□□ 1.2
NOP56-216ENST00000492135 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.53■■□□□ 1.2
NOP56-216ENST00000492135 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
NOP56-216ENST00000492135 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.52■■□□□ 1.2
NOP56-216ENST00000492135 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.52■■□□□ 1.2
NOP56-216ENST00000492135 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.52■■□□□ 1.2
NOP56-216ENST00000492135 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NOP56-216ENST00000492135 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.48■■□□□ 1.19
NOP56-216ENST00000492135 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
NOP56-216ENST00000492135 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.47■■□□□ 1.19
NOP56-216ENST00000492135 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.46■■□□□ 1.19
NOP56-216ENST00000492135 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.45■■□□□ 1.18
NOP56-216ENST00000492135 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.45■■□□□ 1.18
NOP56-216ENST00000492135 APLP2Q06481 763 aa22.44■■□□□ 1.18
NOP56-216ENST00000492135 ABCA6Q8N139 1617 aa22.44■■□□□ 1.18
NOP56-216ENST00000492135 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.43■■□□□ 1.18
NOP56-216ENST00000492135 MBD5Q9P267 1494 aa22.43■■□□□ 1.18
NOP56-216ENST00000492135 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.42■■□□□ 1.18
NOP56-216ENST00000492135 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.42■■□□□ 1.18
NOP56-216ENST00000492135 ATP10AO60312 1499 aa22.41■■□□□ 1.18
NOP56-216ENST00000492135 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
NOP56-216ENST00000492135 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.4■■□□□ 1.18
NOP56-216ENST00000492135 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.4■■□□□ 1.18
NOP56-216ENST00000492135 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.39■■□□□ 1.17
NOP56-216ENST00000492135 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
NOP56-216ENST00000492135 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
NOP56-216ENST00000492135 REREQ9P2R6 1566 aa22.35■■□□□ 1.17
NOP56-216ENST00000492135 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.35■■□□□ 1.17
NOP56-216ENST00000492135 ATP7AQ04656 1500 aa22.35■■□□□ 1.17
NOP56-216ENST00000492135 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
NOP56-216ENST00000492135 MIA2Q96PC5 1412 aa22.34■■□□□ 1.17
NOP56-216ENST00000492135 MADDQ8WXG6 1647 aa22.33■■□□□ 1.17
NOP56-216ENST00000492135 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.33■■□□□ 1.16
NOP56-216ENST00000492135 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.31■■□□□ 1.16
NOP56-216ENST00000492135 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.29■■□□□ 1.16
NOP56-216ENST00000492135 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.27■■□□□ 1.16
NOP56-216ENST00000492135 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
NOP56-216ENST00000492135 AGLP35573 1532 aa22.26■■□□□ 1.15
NOP56-216ENST00000492135 MLECQ14165 292 aa22.26■■□□□ 1.15
NOP56-216ENST00000492135 PLXNC1O60486 1568 aa22.25■■□□□ 1.15
NOP56-216ENST00000492135 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.25■■□□□ 1.15
NOP56-216ENST00000492135 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.25■■□□□ 1.15
NOP56-216ENST00000492135 PTPRMP28827 1452 aa22.24■■□□□ 1.15
NOP56-216ENST00000492135 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NOP56-216ENST00000492135 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.24■■□□□ 1.15
NOP56-216ENST00000492135 A2MP01023 1474 aa22.22■■□□□ 1.15
NOP56-216ENST00000492135 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.22■■□□□ 1.15
NOP56-216ENST00000492135 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NOP56-216ENST00000492135 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.21■■□□□ 1.15
NOP56-216ENST00000492135 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.2■■□□□ 1.14
NOP56-216ENST00000492135 ABCC5O15440 1437 aa22.18■■□□□ 1.14
NOP56-216ENST00000492135 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NOP56-216ENST00000492135 TSPY4P0CV99 314 aa22.15■■□□□ 1.14
NOP56-216ENST00000492135 TSPY10P0CW01 314 aa22.15■■□□□ 1.14
NOP56-216ENST00000492135 DAPK1P53355 1430 aa22.14■■□□□ 1.14
NOP56-216ENST00000492135 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NOP56-216ENST00000492135 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.12■■□□□ 1.13
NOP56-216ENST00000492135 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
NOP56-216ENST00000492135 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.07■■□□□ 1.12
NOP56-216ENST00000492135 C3P01024 1663 aa22.07■■□□□ 1.12
NOP56-216ENST00000492135 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
NOP56-216ENST00000492135 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
NOP56-216ENST00000492135 GGT6Q6P531 493 aa22.04■■□□□ 1.12
NOP56-216ENST00000492135 KIF3BO15066 747 aa22.03■■□□□ 1.12
NOP56-216ENST00000492135 MROH2AA6NES4 1674 aa22.03■■□□□ 1.12
NOP56-216ENST00000492135 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-216ENST00000492135 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-216ENST00000492135 PTPRKQ15262 1439 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-216ENST00000492135 KIF15Q9NS87 1388 aa22.01■■□□□ 1.11
NOP56-216ENST00000492135 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.01■■□□□ 1.11
NOP56-216ENST00000492135 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NOP56-216ENST00000492135 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NOP56-216ENST00000492135 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22■■□□□ 1.11
NOP56-216ENST00000492135 ADGRL2O95490 1459 aa22■■□□□ 1.11
NOP56-216ENST00000492135 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.98■■□□□ 1.11
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