RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491246.4

FBXW5-208, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 5, human

TSL 5

Gene FBXW5, Length 785 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXW5-208	ENST00000491246	PTPRM	P28827	1452 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FBXW5-208	ENST00000491246	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FBXW5-208	ENST00000491246	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
FBXW5-208	ENST00000491246	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		32.59	■■■□□ 2.81
FBXW5-208	ENST00000491246	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.58	■■■□□ 2.81
FBXW5-208	ENST00000491246	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.55	■■■□□ 2.8
FBXW5-208	ENST00000491246	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
FBXW5-208	ENST00000491246	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.54	■■■□□ 2.8
FBXW5-208	ENST00000491246	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
FBXW5-208	ENST00000491246	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.5	■■■□□ 2.79
FBXW5-208	ENST00000491246	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.49	■■■□□ 2.79
FBXW5-208	ENST00000491246	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.48	■■■□□ 2.79
FBXW5-208	ENST00000491246	KDM5C	P41229	1560 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FBXW5-208	ENST00000491246	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FBXW5-208	ENST00000491246	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.45	■■■□□ 2.78
FBXW5-208	ENST00000491246	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
FBXW5-208	ENST00000491246	ATP10A	O60312	1499 aa		32.43	■■■□□ 2.78
FBXW5-208	ENST00000491246	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.41	■■■□□ 2.78
FBXW5-208	ENST00000491246	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.39	■■■□□ 2.78
FBXW5-208	ENST00000491246	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FBXW5-208	ENST00000491246	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FBXW5-208	ENST00000491246	ABCC1	P33527	1531 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FBXW5-208	ENST00000491246	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.34	■■■□□ 2.77
FBXW5-208	ENST00000491246	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.33	■■■□□ 2.77
FBXW5-208	ENST00000491246	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.32	■■■□□ 2.76
FBXW5-208	ENST00000491246	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.3	■■■□□ 2.76
FBXW5-208	ENST00000491246	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.29	■■■□□ 2.76
FBXW5-208	ENST00000491246	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.26	■■■□□ 2.75
FBXW5-208	ENST00000491246	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.24	■■■□□ 2.75
FBXW5-208	ENST00000491246	AGL	P35573	1532 aa		32.21	■■■□□ 2.75
FBXW5-208	ENST00000491246	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.2	■■■□□ 2.75
FBXW5-208	ENST00000491246	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FBXW5-208	ENST00000491246	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.17	■■■□□ 2.74
FBXW5-208	ENST00000491246	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
FBXW5-208	ENST00000491246	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
FBXW5-208	ENST00000491246	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.16	■■■□□ 2.74
FBXW5-208	ENST00000491246	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.15	■■■□□ 2.74
FBXW5-208	ENST00000491246	MLEC	Q14165	292 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FBXW5-208	ENST00000491246	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FBXW5-208	ENST00000491246	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.14	■■■□□ 2.74
FBXW5-208	ENST00000491246	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.12	■■■□□ 2.73
FBXW5-208	ENST00000491246	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FBXW5-208	ENST00000491246	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.11	■■■□□ 2.73
FBXW5-208	ENST00000491246	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FBXW5-208	ENST00000491246	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.1	■■■□□ 2.73
FBXW5-208	ENST00000491246	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FBXW5-208	ENST00000491246	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.08	■■■□□ 2.73
FBXW5-208	ENST00000491246	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
FBXW5-208	ENST00000491246	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.02	■■■□□ 2.72
FBXW5-208	ENST00000491246	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXW5-208	ENST00000491246	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
FBXW5-208	ENST00000491246	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
FBXW5-208	ENST00000491246	ATP7A	Q04656	1500 aa		31.99	■■■□□ 2.71
FBXW5-208	ENST00000491246	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
FBXW5-208	ENST00000491246	C3	P01024	1663 aa		31.95	■■■□□ 2.71
FBXW5-208	ENST00000491246	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.95	■■■□□ 2.7
FBXW5-208	ENST00000491246	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
FBXW5-208	ENST00000491246	PLXNC1	O60486	1568 aa		31.94	■■■□□ 2.7
FBXW5-208	ENST00000491246	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.93	■■■□□ 2.7
FBXW5-208	ENST00000491246	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.92	■■■□□ 2.7
FBXW5-208	ENST00000491246	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
FBXW5-208	ENST00000491246	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	31.91	■■■□□ 2.7
FBXW5-208	ENST00000491246	HSPA2	P54652	639 aa		31.91	■■■□□ 2.7
FBXW5-208	ENST00000491246	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		31.9	■■■□□ 2.7
FBXW5-208	ENST00000491246	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
FBXW5-208	ENST00000491246	A2M	P01023	1474 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FBXW5-208	ENST00000491246	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		31.86	■■■□□ 2.69
FBXW5-208	ENST00000491246	MBD5	Q9P267	1494 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FBXW5-208	ENST00000491246	NPAT	Q14207	1427 aa		31.84	■■■□□ 2.69
FBXW5-208	ENST00000491246	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.83	■■■□□ 2.69
FBXW5-208	ENST00000491246	NCOA2	Q15596	1464 aa		31.82	■■■□□ 2.68
FBXW5-208	ENST00000491246	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXW5-208	ENST00000491246	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		31.81	■■■□□ 2.68
FBXW5-208	ENST00000491246	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		31.8	■■■□□ 2.68
FBXW5-208	ENST00000491246	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FBXW5-208	ENST00000491246	STRC	Q7RTU9	1775 aa		31.77	■■■□□ 2.68
FBXW5-208	ENST00000491246	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FBXW5-208	ENST00000491246	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FBXW5-208	ENST00000491246	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
FBXW5-208	ENST00000491246	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		31.72	■■■□□ 2.67
FBXW5-208	ENST00000491246	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.72	■■■□□ 2.67
FBXW5-208	ENST00000491246	ZMYM3	Q14202	1370 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FBXW5-208	ENST00000491246	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FBXW5-208	ENST00000491246	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
FBXW5-208	ENST00000491246	PTPRT	O14522	1441 aa		31.68	■■■□□ 2.66
FBXW5-208	ENST00000491246	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
FBXW5-208	ENST00000491246	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
FBXW5-208	ENST00000491246	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.62	■■■□□ 2.65
FBXW5-208	ENST00000491246	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.61	■■■□□ 2.65
FBXW5-208	ENST00000491246	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.59	■■■□□ 2.65
FBXW5-208	ENST00000491246	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		31.59	■■■□□ 2.65
FBXW5-208	ENST00000491246	GGT6	Q6P531	493 aa		31.59	■■■□□ 2.65
FBXW5-208	ENST00000491246	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.58	■■■□□ 2.65
FBXW5-208	ENST00000491246	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.58	■■■□□ 2.65
FBXW5-208	ENST00000491246	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		31.56	■■■□□ 2.64
FBXW5-208	ENST00000491246	PLA2R1	Q13018	1463 aa		31.55	■■■□□ 2.64
FBXW5-208	ENST00000491246	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.54	■■■□□ 2.64
FBXW5-208	ENST00000491246	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.54	■■■□□ 2.64
FBXW5-208	ENST00000491246	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		31.54	■■■□□ 2.64
FBXW5-208	ENST00000491246	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.53	■■■□□ 2.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms