RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485896.5

C1orf35-205, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf35, Length 1,429 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-205ENST00000485896 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.96■■■□□ 2.87
C1orf35-205ENST00000485896 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
C1orf35-205ENST00000485896 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.94■■■□□ 2.86
C1orf35-205ENST00000485896 RICTORQ6R327 1708 aa32.92■■■□□ 2.86
C1orf35-205ENST00000485896 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.9■■■□□ 2.86
C1orf35-205ENST00000485896 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
C1orf35-205ENST00000485896 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.85■■■□□ 2.85
C1orf35-205ENST00000485896 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.84■■■□□ 2.85
C1orf35-205ENST00000485896 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.82■■■□□ 2.84
C1orf35-205ENST00000485896 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.82■■■□□ 2.84
C1orf35-205ENST00000485896 MAP3K1Q13233 1512 aa32.8■■■□□ 2.84
C1orf35-205ENST00000485896 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
C1orf35-205ENST00000485896 ABCC1P33527 1531 aa32.78■■■□□ 2.84
C1orf35-205ENST00000485896 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.78■■■□□ 2.84
C1orf35-205ENST00000485896 NCOA2Q15596 1464 aa32.78■■■□□ 2.84
C1orf35-205ENST00000485896 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
C1orf35-205ENST00000485896 APLP2Q06481 763 aa32.76■■■□□ 2.83
C1orf35-205ENST00000485896 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.76■■■□□ 2.83
C1orf35-205ENST00000485896 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.75■■■□□ 2.83
C1orf35-205ENST00000485896 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.74■■■□□ 2.83
C1orf35-205ENST00000485896 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.74■■■□□ 2.83
C1orf35-205ENST00000485896 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.73■■■□□ 2.83
C1orf35-205ENST00000485896 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.73■■■□□ 2.83
C1orf35-205ENST00000485896 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.71■■■□□ 2.83
C1orf35-205ENST00000485896 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.71■■■□□ 2.83
C1orf35-205ENST00000485896 AFAP1Q8N556 730 aa32.7■■■□□ 2.83
C1orf35-205ENST00000485896 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.69■■■□□ 2.82
C1orf35-205ENST00000485896 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
C1orf35-205ENST00000485896 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.68■■■□□ 2.82
C1orf35-205ENST00000485896 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.68■■■□□ 2.82
C1orf35-205ENST00000485896 KDM5CP41229 1560 aa32.67■■■□□ 2.82
C1orf35-205ENST00000485896 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.67■■■□□ 2.82
C1orf35-205ENST00000485896 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
C1orf35-205ENST00000485896 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.62■■■□□ 2.81
C1orf35-205ENST00000485896 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.62■■■□□ 2.81
C1orf35-205ENST00000485896 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.62■■■□□ 2.81
C1orf35-205ENST00000485896 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.61■■■□□ 2.81
C1orf35-205ENST00000485896 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.58■■■□□ 2.81
C1orf35-205ENST00000485896 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
C1orf35-205ENST00000485896 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.54■■■□□ 2.8
C1orf35-205ENST00000485896 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.53■■■□□ 2.8
C1orf35-205ENST00000485896 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.52■■■□□ 2.8
C1orf35-205ENST00000485896 ATP10AO60312 1499 aa32.51■■■□□ 2.8
C1orf35-205ENST00000485896 ABCA6Q8N139 1617 aa32.5■■■□□ 2.79
C1orf35-205ENST00000485896 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.5■■■□□ 2.79
C1orf35-205ENST00000485896 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.49■■■□□ 2.79
C1orf35-205ENST00000485896 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.49■■■□□ 2.79
C1orf35-205ENST00000485896 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.49■■■□□ 2.79
C1orf35-205ENST00000485896 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
C1orf35-205ENST00000485896 MBD5Q9P267 1494 aa32.48■■■□□ 2.79
C1orf35-205ENST00000485896 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.46■■■□□ 2.79
C1orf35-205ENST00000485896 ATP7AQ04656 1500 aa32.42■■■□□ 2.78
C1orf35-205ENST00000485896 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.42■■■□□ 2.78
C1orf35-205ENST00000485896 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.42■■■□□ 2.78
C1orf35-205ENST00000485896 MIA2Q96PC5 1412 aa32.41■■■□□ 2.78
C1orf35-205ENST00000485896 CCDC141Q6ZP82 1450 aa32.39■■■□□ 2.78
C1orf35-205ENST00000485896 MLECQ14165 292 aa32.38■■■□□ 2.77
C1orf35-205ENST00000485896 MADDQ8WXG6 1647 aa32.37■■■□□ 2.77
C1orf35-205ENST00000485896 REREQ9P2R6 1566 aa32.36■■■□□ 2.77
C1orf35-205ENST00000485896 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.34■■■□□ 2.77
C1orf35-205ENST00000485896 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.32■■■□□ 2.76
C1orf35-205ENST00000485896 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.32■■■□□ 2.76
C1orf35-205ENST00000485896 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.3■■■□□ 2.76
C1orf35-205ENST00000485896 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
C1orf35-205ENST00000485896 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
C1orf35-205ENST00000485896 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.28■■■□□ 2.76
C1orf35-205ENST00000485896 PTPRMP28827 1452 aa32.26■■■□□ 2.75
C1orf35-205ENST00000485896 AGLP35573 1532 aa32.26■■■□□ 2.75
C1orf35-205ENST00000485896 A2MP01023 1474 aa32.25■■■□□ 2.75
C1orf35-205ENST00000485896 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.25■■■□□ 2.75
C1orf35-205ENST00000485896 TSPY4P0CV99 314 aa32.25■■■□□ 2.75
C1orf35-205ENST00000485896 TSPY10P0CW01 314 aa32.25■■■□□ 2.75
C1orf35-205ENST00000485896 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.24■■■□□ 2.75
C1orf35-205ENST00000485896 PLXNC1O60486 1568 aa32.22■■■□□ 2.75
C1orf35-205ENST00000485896 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.21■■■□□ 2.75
C1orf35-205ENST00000485896 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.17■■■□□ 2.74
C1orf35-205ENST00000485896 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.16■■■□□ 2.74
C1orf35-205ENST00000485896 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.15■■■□□ 2.74
C1orf35-205ENST00000485896 ABCC5O15440 1437 aa32.13■■■□□ 2.73
C1orf35-205ENST00000485896 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
C1orf35-205ENST00000485896 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
C1orf35-205ENST00000485896 DAPK1P53355 1430 aa32.12■■■□□ 2.73
C1orf35-205ENST00000485896 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
C1orf35-205ENST00000485896 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.09■■■□□ 2.73
C1orf35-205ENST00000485896 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
C1orf35-205ENST00000485896 GGT6Q6P531 493 aa32.05■■■□□ 2.72
C1orf35-205ENST00000485896 KIF3BO15066 747 aa32.01■■■□□ 2.72
C1orf35-205ENST00000485896 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.01■■■□□ 2.72
C1orf35-205ENST00000485896 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
C1orf35-205ENST00000485896 KIF15Q9NS87 1388 aa31.98■■■□□ 2.71
C1orf35-205ENST00000485896 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.98■■■□□ 2.71
C1orf35-205ENST00000485896 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.97■■■□□ 2.71
C1orf35-205ENST00000485896 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
C1orf35-205ENST00000485896 C3P01024 1663 aa31.96■■■□□ 2.71
C1orf35-205ENST00000485896 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.95■■■□□ 2.71
C1orf35-205ENST00000485896 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.93■■■□□ 2.7
C1orf35-205ENST00000485896 MROH2AA6NES4 1674 aa31.91■■■□□ 2.7
C1orf35-205ENST00000485896 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
C1orf35-205ENST00000485896 NCOA1Q15788 1441 aa31.88■■■□□ 2.69
C1orf35-205ENST00000485896 ADGRL2O95490 1459 aa31.87■■■□□ 2.69
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