RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481348.5

ABCD4-210, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,177 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-210ENST00000481348 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.74■■□□□ 1.07
ABCD4-210ENST00000481348 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.73■■□□□ 1.07
ABCD4-210ENST00000481348 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.71■■□□□ 1.07
ABCD4-210ENST00000481348 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.71■■□□□ 1.07
ABCD4-210ENST00000481348 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.71■■□□□ 1.07
ABCD4-210ENST00000481348 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.7■■□□□ 1.07
ABCD4-210ENST00000481348 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.7■■□□□ 1.06
ABCD4-210ENST00000481348 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.69■■□□□ 1.06
ABCD4-210ENST00000481348 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.67■■□□□ 1.06
ABCD4-210ENST00000481348 PTPRMP28827 1452 aa21.65■■□□□ 1.06
ABCD4-210ENST00000481348 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.65■■□□□ 1.06
ABCD4-210ENST00000481348 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.65■■□□□ 1.06
ABCD4-210ENST00000481348 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.62■■□□□ 1.05
ABCD4-210ENST00000481348 PREX2Q70Z35 1606 aa21.62■■□□□ 1.05
ABCD4-210ENST00000481348 AFAP1Q8N556 730 aa21.61■■□□□ 1.05
ABCD4-210ENST00000481348 MADDQ8WXG6 1647 aa21.61■■□□□ 1.05
ABCD4-210ENST00000481348 ATP10AO60312 1499 aa21.59■■□□□ 1.05
ABCD4-210ENST00000481348 CEP162Q5TB80 1403 aa21.59■■□□□ 1.05
ABCD4-210ENST00000481348 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.58■■□□□ 1.05
ABCD4-210ENST00000481348 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.58■■□□□ 1.04
ABCD4-210ENST00000481348 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.58■■□□□ 1.04
ABCD4-210ENST00000481348 KDM5CP41229 1560 aa21.57■■□□□ 1.04
ABCD4-210ENST00000481348 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-210ENST00000481348 MLECQ14165 292 aa21.56■■□□□ 1.04
ABCD4-210ENST00000481348 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-210ENST00000481348 ABCC1P33527 1531 aa21.55■■□□□ 1.04
ABCD4-210ENST00000481348 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.54■■□□□ 1.04
ABCD4-210ENST00000481348 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
ABCD4-210ENST00000481348 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.53■■□□□ 1.04
ABCD4-210ENST00000481348 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
ABCD4-210ENST00000481348 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.53■■□□□ 1.04
ABCD4-210ENST00000481348 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.51■■□□□ 1.03
ABCD4-210ENST00000481348 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.51■■□□□ 1.03
ABCD4-210ENST00000481348 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.51■■□□□ 1.03
ABCD4-210ENST00000481348 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.49■■□□□ 1.03
ABCD4-210ENST00000481348 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ABCD4-210ENST00000481348 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-210ENST00000481348 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.48■■□□□ 1.03
ABCD4-210ENST00000481348 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-210ENST00000481348 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.47■■□□□ 1.03
ABCD4-210ENST00000481348 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-210ENST00000481348 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.45■■□□□ 1.02
ABCD4-210ENST00000481348 REREQ9P2R6 1566 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-210ENST00000481348 ABCA6Q8N139 1617 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-210ENST00000481348 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.43■■□□□ 1.02
ABCD4-210ENST00000481348 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.43■■□□□ 1.02
ABCD4-210ENST00000481348 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.43■■□□□ 1.02
ABCD4-210ENST00000481348 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-210ENST00000481348 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-210ENST00000481348 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-210ENST00000481348 AGLP35573 1532 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-210ENST00000481348 TIAM1Q13009 1591 aa21.38■■□□□ 1.01
ABCD4-210ENST00000481348 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.37■■□□□ 1.01
ABCD4-210ENST00000481348 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ABCD4-210ENST00000481348 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
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ABCD4-210ENST00000481348 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
ABCD4-210ENST00000481348 ATP7AQ04656 1500 aa21.32■■□□□ 1
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ABCD4-210ENST00000481348 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
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ABCD4-210ENST00000481348 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.26■□□□□ 0.99
ABCD4-210ENST00000481348 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.26■□□□□ 0.99
ABCD4-210ENST00000481348 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
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ABCD4-210ENST00000481348 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.25■□□□□ 0.99
ABCD4-210ENST00000481348 C3P01024 1663 aa21.24■□□□□ 0.99
ABCD4-210ENST00000481348 MAP3K1Q13233 1512 aa21.24■□□□□ 0.99
ABCD4-210ENST00000481348 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.23■□□□□ 0.99
ABCD4-210ENST00000481348 PLXNC1O60486 1568 aa21.23■□□□□ 0.99
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ABCD4-210ENST00000481348 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
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ABCD4-210ENST00000481348 GGT6Q6P531 493 aa21.19■□□□□ 0.98
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ABCD4-210ENST00000481348 APLP2Q06481 763 aa21.17■□□□□ 0.98
ABCD4-210ENST00000481348 MROH2AA6NES4 1674 aa21.17■□□□□ 0.98
ABCD4-210ENST00000481348 TSPY4P0CV99 314 aa21.16■□□□□ 0.98
ABCD4-210ENST00000481348 TSPY10P0CW01 314 aa21.16■□□□□ 0.98
ABCD4-210ENST00000481348 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.16■□□□□ 0.98
ABCD4-210ENST00000481348 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
ABCD4-210ENST00000481348 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.14■□□□□ 0.98
ABCD4-210ENST00000481348 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
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ABCD4-210ENST00000481348 KIF3BO15066 747 aa21.1■□□□□ 0.97
ABCD4-210ENST00000481348 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.1■□□□□ 0.97
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ABCD4-210ENST00000481348 STRCQ7RTU9 1775 aa21.08■□□□□ 0.96
ABCD4-210ENST00000481348 PTPRKQ15262 1439 aa21.05■□□□□ 0.96
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ABCD4-210ENST00000481348 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.99■□□□□ 0.95
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