RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473191.1

USP40-212, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 3

Gene USP40, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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USP40-212ENST00000473191 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.31■■□□□ 1.8
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USP40-212ENST00000473191 TSPY10P0CW01 314 aa26.27■■□□□ 1.8
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USP40-212ENST00000473191 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.23■■□□□ 1.79
USP40-212ENST00000473191 NCOA1Q15788 1441 aa26.22■■□□□ 1.79
USP40-212ENST00000473191 APLP2Q06481 763 aa26.21■■□□□ 1.79
USP40-212ENST00000473191 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
USP40-212ENST00000473191 CERKQ8TCT0 537 aa26.21■■□□□ 1.79
USP40-212ENST00000473191 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.19■■□□□ 1.78
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