RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471981.1

SFT2D2-203, Transcript of SFT2 domain containing 2, humanhuman

TSL 5

Gene SFT2D2, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2-203ENST00000471981 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.49■■■■■ 4.07
SFT2D2-203ENST00000471981 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.48■■■■■ 4.07
SFT2D2-203ENST00000471981 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.47■■■■■ 4.07
SFT2D2-203ENST00000471981 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.46■■■■■ 4.07
SFT2D2-203ENST00000471981 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.45■■■■■ 4.07
SFT2D2-203ENST00000471981 KIF14Q15058 1648 aa40.44■■■■■ 4.06
SFT2D2-203ENST00000471981 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
SFT2D2-203ENST00000471981 CLIP1P30622 1438 aa40.41■■■■■ 4.06
SFT2D2-203ENST00000471981 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.37■■■■■ 4.05
SFT2D2-203ENST00000471981 ATP10AO60312 1499 aa40.35■■■■■ 4.05
SFT2D2-203ENST00000471981 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.33■■■■■ 4.05
SFT2D2-203ENST00000471981 FBXO41Q8TF61 875 aa40.33■■■■■ 4.05
SFT2D2-203ENST00000471981 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.32■■■■■ 4.05
SFT2D2-203ENST00000471981 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.31■■■■■ 4.04
SFT2D2-203ENST00000471981 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.3■■■■■ 4.04
SFT2D2-203ENST00000471981 MLECQ14165 292 aa40.25■■■■■ 4.03
SFT2D2-203ENST00000471981 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.25■■■■■ 4.03
SFT2D2-203ENST00000471981 KDM5CP41229 1560 aa40.24■■■■■ 4.03
SFT2D2-203ENST00000471981 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.24■■■■■ 4.03
SFT2D2-203ENST00000471981 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.24■■■■■ 4.03
SFT2D2-203ENST00000471981 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.2■■■■■ 4.03
SFT2D2-203ENST00000471981 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.18■■■■■ 4.02
SFT2D2-203ENST00000471981 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.14■■■■■ 4.02
SFT2D2-203ENST00000471981 HSPA2P54652 639 aa40.13■■■■■ 4.01
SFT2D2-203ENST00000471981 AFAP1Q8N556 730 aa40.13■■■■■ 4.01
SFT2D2-203ENST00000471981 PREX2Q70Z35 1606 aa40.12■■■■■ 4.01
SFT2D2-203ENST00000471981 REREQ9P2R6 1566 aa40.11■■■■■ 4.01
SFT2D2-203ENST00000471981 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.09■■■■■ 4.01
SFT2D2-203ENST00000471981 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.08■■■■■ 4.01
SFT2D2-203ENST00000471981 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.07■■■■■ 4.01
SFT2D2-203ENST00000471981 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.05■■■■■ 4
SFT2D2-203ENST00000471981 ABCC1P33527 1531 aa40.05■■■■■ 4
SFT2D2-203ENST00000471981 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.05■■■■■ 4
SFT2D2-203ENST00000471981 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.99■■■■□ 3.99
SFT2D2-203ENST00000471981 ABCA6Q8N139 1617 aa39.98■■■■□ 3.99
SFT2D2-203ENST00000471981 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
SFT2D2-203ENST00000471981 AGLP35573 1532 aa39.96■■■■□ 3.99
SFT2D2-203ENST00000471981 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.96■■■■□ 3.99
SFT2D2-203ENST00000471981 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.95■■■■□ 3.99
SFT2D2-203ENST00000471981 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
SFT2D2-203ENST00000471981 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.89■■■■□ 3.98
SFT2D2-203ENST00000471981 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
SFT2D2-203ENST00000471981 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.85■■■■□ 3.97
SFT2D2-203ENST00000471981 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.83■■■■□ 3.97
SFT2D2-203ENST00000471981 CERKQ8TCT0 537 aa39.81■■■■□ 3.96
SFT2D2-203ENST00000471981 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.8■■■■□ 3.96
SFT2D2-203ENST00000471981 C3P01024 1663 aa39.8■■■■□ 3.96
SFT2D2-203ENST00000471981 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.79■■■■□ 3.96
SFT2D2-203ENST00000471981 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.79■■■■□ 3.96
SFT2D2-203ENST00000471981 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
SFT2D2-203ENST00000471981 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.75■■■■□ 3.95
SFT2D2-203ENST00000471981 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.74■■■■□ 3.95
SFT2D2-203ENST00000471981 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.73■■■■□ 3.95
SFT2D2-203ENST00000471981 STRCQ7RTU9 1775 aa39.72■■■■□ 3.95
SFT2D2-203ENST00000471981 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
SFT2D2-203ENST00000471981 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.68■■■■□ 3.94
SFT2D2-203ENST00000471981 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
SFT2D2-203ENST00000471981 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.65■■■■□ 3.94
SFT2D2-203ENST00000471981 MROH2AA6NES4 1674 aa39.64■■■■□ 3.94
SFT2D2-203ENST00000471981 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.63■■■■□ 3.93
SFT2D2-203ENST00000471981 ATP7AQ04656 1500 aa39.63■■■■□ 3.93
SFT2D2-203ENST00000471981 PTPRTO14522 1441 aa39.61■■■■□ 3.93
SFT2D2-203ENST00000471981 NPATQ14207 1427 aa39.6■■■■□ 3.93
SFT2D2-203ENST00000471981 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.59■■■■□ 3.93
SFT2D2-203ENST00000471981 PLXNC1O60486 1568 aa39.55■■■■□ 3.92
SFT2D2-203ENST00000471981 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
SFT2D2-203ENST00000471981 A2MP01023 1474 aa39.54■■■■□ 3.92
SFT2D2-203ENST00000471981 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.53■■■■□ 3.92
SFT2D2-203ENST00000471981 ZMYM3Q14202 1370 aa39.51■■■■□ 3.92
SFT2D2-203ENST00000471981 NCOA1Q15788 1441 aa39.48■■■■□ 3.91
SFT2D2-203ENST00000471981 TIAM1Q13009 1591 aa39.46■■■■□ 3.91
SFT2D2-203ENST00000471981 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.45■■■■□ 3.91
SFT2D2-203ENST00000471981 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.45■■■■□ 3.91
SFT2D2-203ENST00000471981 CEP162Q5TB80 1403 aa39.44■■■■□ 3.9
SFT2D2-203ENST00000471981 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
SFT2D2-203ENST00000471981 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.39■■■■□ 3.9
SFT2D2-203ENST00000471981 MBD5Q9P267 1494 aa39.38■■■■□ 3.9
SFT2D2-203ENST00000471981 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.38■■■■□ 3.89
SFT2D2-203ENST00000471981 GGT6Q6P531 493 aa39.35■■■■□ 3.89
SFT2D2-203ENST00000471981 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
SFT2D2-203ENST00000471981 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
SFT2D2-203ENST00000471981 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.33■■■■□ 3.89
SFT2D2-203ENST00000471981 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.32■■■■□ 3.88
SFT2D2-203ENST00000471981 PTPRKQ15262 1439 aa39.31■■■■□ 3.88
SFT2D2-203ENST00000471981 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.31■■■■□ 3.88
SFT2D2-203ENST00000471981 PLA2R1Q13018 1463 aa39.29■■■■□ 3.88
SFT2D2-203ENST00000471981 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
SFT2D2-203ENST00000471981 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
SFT2D2-203ENST00000471981 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.26■■■■□ 3.88
SFT2D2-203ENST00000471981 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.24■■■■□ 3.87
SFT2D2-203ENST00000471981 PKD2Q13563 968 aa39.24■■■■□ 3.87
SFT2D2-203ENST00000471981 NCOA2Q15596 1464 aa39.23■■■■□ 3.87
SFT2D2-203ENST00000471981 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.21■■■■□ 3.87
SFT2D2-203ENST00000471981 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.18■■■■□ 3.86
SFT2D2-203ENST00000471981 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
SFT2D2-203ENST00000471981 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.16■■■■□ 3.86
SFT2D2-203ENST00000471981 A2ML1A8K2U0 1454 aa39.13■■■■□ 3.85
SFT2D2-203ENST00000471981 KIF3BO15066 747 aa39.1■■■■□ 3.85
SFT2D2-203ENST00000471981 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.1■■■■□ 3.85
SFT2D2-203ENST00000471981 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.09■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.8 ms