RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469223.5

HDAC6-217, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC6, Length 796 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-217ENST00000469223 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HDAC6-217ENST00000469223 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HDAC6-217ENST00000469223 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.05■■□□□ 1.12
HDAC6-217ENST00000469223 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
HDAC6-217ENST00000469223 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HDAC6-217ENST00000469223 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.12
HDAC6-217ENST00000469223 PTPRTO14522 1441 aa22.03■■□□□ 1.12
HDAC6-217ENST00000469223 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HDAC6-217ENST00000469223 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HDAC6-217ENST00000469223 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.99■■□□□ 1.11
HDAC6-217ENST00000469223 C3P01024 1663 aa21.99■■□□□ 1.11
HDAC6-217ENST00000469223 PRXQ9BXM0 1461 aa21.99■■□□□ 1.11
HDAC6-217ENST00000469223 ATP10AO60312 1499 aa21.95■■□□□ 1.1
HDAC6-217ENST00000469223 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
HDAC6-217ENST00000469223 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.89■■□□□ 1.1
HDAC6-217ENST00000469223 NCOA1Q15788 1441 aa21.89■■□□□ 1.09
HDAC6-217ENST00000469223 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.88■■□□□ 1.09
HDAC6-217ENST00000469223 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.85■■□□□ 1.09
HDAC6-217ENST00000469223 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.84■■□□□ 1.09
HDAC6-217ENST00000469223 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.82■■□□□ 1.08
HDAC6-217ENST00000469223 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.82■■□□□ 1.08
HDAC6-217ENST00000469223 ABCA6Q8N139 1617 aa21.81■■□□□ 1.08
HDAC6-217ENST00000469223 KDM5CP41229 1560 aa21.81■■□□□ 1.08
HDAC6-217ENST00000469223 REREQ9P2R6 1566 aa21.8■■□□□ 1.08
HDAC6-217ENST00000469223 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HDAC6-217ENST00000469223 PLCH2O75038 1416 aa21.79■■□□□ 1.08
HDAC6-217ENST00000469223 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HDAC6-217ENST00000469223 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.77■■□□□ 1.08
HDAC6-217ENST00000469223 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HDAC6-217ENST00000469223 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.75■■□□□ 1.07
HDAC6-217ENST00000469223 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
HDAC6-217ENST00000469223 KIF14Q15058 1648 aa21.71■■□□□ 1.07
HDAC6-217ENST00000469223 AGLP35573 1532 aa21.7■■□□□ 1.07
HDAC6-217ENST00000469223 MROH2AA6NES4 1674 aa21.7■■□□□ 1.06
HDAC6-217ENST00000469223 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.69■■□□□ 1.06
HDAC6-217ENST00000469223 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
HDAC6-217ENST00000469223 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.67■■□□□ 1.06
HDAC6-217ENST00000469223 HSPA1LP34931 641 aa21.65■■□□□ 1.06
HDAC6-217ENST00000469223 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
HDAC6-217ENST00000469223 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.64■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.64■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.64■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.63■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.63■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 AFAP1Q8N556 730 aa21.62■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 NPATQ14207 1427 aa21.62■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.61■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 PLA2R1Q13018 1463 aa21.6■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.6■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.6■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
HDAC6-217ENST00000469223 PIP4K2BP78356 416 aa21.57■■□□□ 1.04
HDAC6-217ENST00000469223 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HDAC6-217ENST00000469223 ABCC1P33527 1531 aa21.56■■□□□ 1.04
HDAC6-217ENST00000469223 PREX2Q70Z35 1606 aa21.55■■□□□ 1.04
HDAC6-217ENST00000469223 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.5■■□□□ 1.03
HDAC6-217ENST00000469223 PKD2Q13563 968 aa21.5■■□□□ 1.03
HDAC6-217ENST00000469223 CPS1P31327 1500 aa21.5■■□□□ 1.03
HDAC6-217ENST00000469223 ALKQ9UM73 1620 aa21.49■■□□□ 1.03
HDAC6-217ENST00000469223 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.49■■□□□ 1.03
HDAC6-217ENST00000469223 ZMYM3Q14202 1370 aa21.47■■□□□ 1.03
HDAC6-217ENST00000469223 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
HDAC6-217ENST00000469223 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.46■■□□□ 1.03
HDAC6-217ENST00000469223 TOM1O60784 492 aa21.45■■□□□ 1.02
HDAC6-217ENST00000469223 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.45■■□□□ 1.02
HDAC6-217ENST00000469223 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HDAC6-217ENST00000469223 CLIP1P30622 1438 aa21.43■■□□□ 1.02
HDAC6-217ENST00000469223 PTPRKQ15262 1439 aa21.43■■□□□ 1.02
HDAC6-217ENST00000469223 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.42■■□□□ 1.02
HDAC6-217ENST00000469223 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.42■■□□□ 1.02
HDAC6-217ENST00000469223 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.41■■□□□ 1.02
HDAC6-217ENST00000469223 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HDAC6-217ENST00000469223 PLXNC1O60486 1568 aa21.4■■□□□ 1.02
HDAC6-217ENST00000469223 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.39■■□□□ 1.01
HDAC6-217ENST00000469223 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.39■■□□□ 1.01
HDAC6-217ENST00000469223 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HDAC6-217ENST00000469223 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HDAC6-217ENST00000469223 FMN1Q68DA7 1419 aa21.36■■□□□ 1.01
HDAC6-217ENST00000469223 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HDAC6-217ENST00000469223 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.34■■□□□ 1.01
HDAC6-217ENST00000469223 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
HDAC6-217ENST00000469223 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HDAC6-217ENST00000469223 ATP7AQ04656 1500 aa21.34■■□□□ 1.01
HDAC6-217ENST00000469223 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.32■■□□□ 1
HDAC6-217ENST00000469223 SYNMO15061 1565 aa21.29■■□□□ 1
HDAC6-217ENST00000469223 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HDAC6-217ENST00000469223 EEA1Q15075 1411 aa21.28■■□□□ 1
HDAC6-217ENST00000469223 A2MP01023 1474 aa21.26■□□□□ 0.99
HDAC6-217ENST00000469223 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.26■□□□□ 0.99
HDAC6-217ENST00000469223 IQGAP1P46940 1657 aa21.26■□□□□ 0.99
HDAC6-217ENST00000469223 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.26■□□□□ 0.99
HDAC6-217ENST00000469223 DEPDC5O75140 1603 aa21.24■□□□□ 0.99
HDAC6-217ENST00000469223 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
HDAC6-217ENST00000469223 GGT6Q6P531 493 aa21.21■□□□□ 0.99
HDAC6-217ENST00000469223 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.2■□□□□ 0.98
HDAC6-217ENST00000469223 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
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