RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462311.1

KMT5A-206, Transcript of lysine methyltransferase 5A, human

TSL 5

Gene KMT5A, Length 747 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KMT5A-206	ENST00000462311	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	33.99	■■■■□ 3.03
KMT5A-206	ENST00000462311	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	33.98	■■■■□ 3.03
KMT5A-206	ENST00000462311	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.95	■■■■□ 3.03
KMT5A-206	ENST00000462311	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		33.95	■■■■□ 3.03
KMT5A-206	ENST00000462311	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.95	■■■■□ 3.03
KMT5A-206	ENST00000462311	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		33.92	■■■■□ 3.02
KMT5A-206	ENST00000462311	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.9	■■■■□ 3.02
KMT5A-206	ENST00000462311	KIF14	Q15058	1648 aa		33.89	■■■■□ 3.02
KMT5A-206	ENST00000462311	MLEC	Q14165	292 aa		33.86	■■■■□ 3.01
KMT5A-206	ENST00000462311	ATP10A	O60312	1499 aa		33.85	■■■■□ 3.01
KMT5A-206	ENST00000462311	FBXO41	Q8TF61	875 aa		33.84	■■■■□ 3.01
KMT5A-206	ENST00000462311	CLIP1	P30622	1438 aa		33.83	■■■■□ 3.01
KMT5A-206	ENST00000462311	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.83	■■■■□ 3.01
KMT5A-206	ENST00000462311	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.81	■■■■□ 3
KMT5A-206	ENST00000462311	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.8	■■■■□ 3
KMT5A-206	ENST00000462311	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.79	■■■■□ 3
KMT5A-206	ENST00000462311	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.78	■■■■□ 3
KMT5A-206	ENST00000462311	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.77	■■■■□ 3
KMT5A-206	ENST00000462311	HSPA2	P54652	639 aa		33.77	■■■■□ 3
KMT5A-206	ENST00000462311	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.75	■■■□□ 2.99
KMT5A-206	ENST00000462311	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.75	■■■□□ 2.99
KMT5A-206	ENST00000462311	KDM5C	P41229	1560 aa		33.72	■■■□□ 2.99
KMT5A-206	ENST00000462311	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		33.72	■■■□□ 2.99
KMT5A-206	ENST00000462311	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.69	■■■□□ 2.98
KMT5A-206	ENST00000462311	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.68	■■■□□ 2.98
KMT5A-206	ENST00000462311	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.63	■■■□□ 2.97
KMT5A-206	ENST00000462311	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.62	■■■□□ 2.97
KMT5A-206	ENST00000462311	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.61	■■■□□ 2.97
KMT5A-206	ENST00000462311	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.61	■■■□□ 2.97
KMT5A-206	ENST00000462311	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
KMT5A-206	ENST00000462311	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.59	■■■□□ 2.97
KMT5A-206	ENST00000462311	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.58	■■■□□ 2.97
KMT5A-206	ENST00000462311	ABCC1	P33527	1531 aa		33.58	■■■□□ 2.97
KMT5A-206	ENST00000462311	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.55	■■■□□ 2.96
KMT5A-206	ENST00000462311	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		33.55	■■■□□ 2.96
KMT5A-206	ENST00000462311	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.54	■■■□□ 2.96
KMT5A-206	ENST00000462311	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
KMT5A-206	ENST00000462311	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.52	■■■□□ 2.96
KMT5A-206	ENST00000462311	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.51	■■■□□ 2.96
KMT5A-206	ENST00000462311	AGL	P35573	1532 aa		33.5	■■■□□ 2.95
KMT5A-206	ENST00000462311	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.44	■■■□□ 2.94
KMT5A-206	ENST00000462311	CERK	Q8TCT0	537 aa		33.44	■■■□□ 2.94
KMT5A-206	ENST00000462311	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.43	■■■□□ 2.94
KMT5A-206	ENST00000462311	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
KMT5A-206	ENST00000462311	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
KMT5A-206	ENST00000462311	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
KMT5A-206	ENST00000462311	C3	P01024	1663 aa		33.38	■■■□□ 2.93
KMT5A-206	ENST00000462311	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.38	■■■□□ 2.93
KMT5A-206	ENST00000462311	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.36	■■■□□ 2.93
KMT5A-206	ENST00000462311	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.35	■■■□□ 2.93
KMT5A-206	ENST00000462311	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.34	■■■□□ 2.93
KMT5A-206	ENST00000462311	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.33	■■■□□ 2.93
KMT5A-206	ENST00000462311	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.93
KMT5A-206	ENST00000462311	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		33.32	■■■□□ 2.92
KMT5A-206	ENST00000462311	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.31	■■■□□ 2.92
KMT5A-206	ENST00000462311	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.3	■■■□□ 2.92
KMT5A-206	ENST00000462311	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.28	■■■□□ 2.92
KMT5A-206	ENST00000462311	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.27	■■■□□ 2.92
KMT5A-206	ENST00000462311	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.25	■■■□□ 2.91
KMT5A-206	ENST00000462311	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.23	■■■□□ 2.91
KMT5A-206	ENST00000462311	PTPRT	O14522	1441 aa		33.21	■■■□□ 2.91
KMT5A-206	ENST00000462311	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
KMT5A-206	ENST00000462311	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
KMT5A-206	ENST00000462311	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.19	■■■□□ 2.9
KMT5A-206	ENST00000462311	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.18	■■■□□ 2.9
KMT5A-206	ENST00000462311	NPAT	Q14207	1427 aa		33.18	■■■□□ 2.9
KMT5A-206	ENST00000462311	A2M	P01023	1474 aa		33.17	■■■□□ 2.9
KMT5A-206	ENST00000462311	PLXNC1	O60486	1568 aa		33.16	■■■□□ 2.9
KMT5A-206	ENST00000462311	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.12	■■■□□ 2.89
KMT5A-206	ENST00000462311	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
KMT5A-206	ENST00000462311	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.12	■■■□□ 2.89
KMT5A-206	ENST00000462311	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.1	■■■□□ 2.89
KMT5A-206	ENST00000462311	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.07	■■■□□ 2.88
KMT5A-206	ENST00000462311	GGT6	Q6P531	493 aa		33.07	■■■□□ 2.88
KMT5A-206	ENST00000462311	CEP162	Q5TB80	1403 aa		33.07	■■■□□ 2.88
KMT5A-206	ENST00000462311	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88
KMT5A-206	ENST00000462311	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		33.04	■■■□□ 2.88
KMT5A-206	ENST00000462311	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		33.04	■■■□□ 2.88
KMT5A-206	ENST00000462311	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.03	■■■□□ 2.88
KMT5A-206	ENST00000462311	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.02	■■■□□ 2.88
KMT5A-206	ENST00000462311	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		33.01	■■■□□ 2.87
KMT5A-206	ENST00000462311	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.01	■■■□□ 2.87
KMT5A-206	ENST00000462311	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.95	■■■□□ 2.86
KMT5A-206	ENST00000462311	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.86
KMT5A-206	ENST00000462311	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.95	■■■□□ 2.86
KMT5A-206	ENST00000462311	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
KMT5A-206	ENST00000462311	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.93	■■■□□ 2.86
KMT5A-206	ENST00000462311	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.92	■■■□□ 2.86
KMT5A-206	ENST00000462311	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.91	■■■□□ 2.86
KMT5A-206	ENST00000462311	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
KMT5A-206	ENST00000462311	PKD2	Q13563	968 aa		32.9	■■■□□ 2.86
KMT5A-206	ENST00000462311	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.89	■■■□□ 2.86
KMT5A-206	ENST00000462311	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.89	■■■□□ 2.86
KMT5A-206	ENST00000462311	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.86	■■■□□ 2.85
KMT5A-206	ENST00000462311	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
KMT5A-206	ENST00000462311	KIF3B	O15066	747 aa		32.84	■■■□□ 2.85
KMT5A-206	ENST00000462311	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
KMT5A-206	ENST00000462311	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.81	■■■□□ 2.84
KMT5A-206	ENST00000462311	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.77	■■■□□ 2.84
KMT5A-206	ENST00000462311	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.76	■■■□□ 2.84

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