RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446877.5

PMS1-214, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 4

Gene PMS1, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-214ENST00000446877 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
PMS1-214ENST00000446877 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
PMS1-214ENST00000446877 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.37■■■■■ 4.05
PMS1-214ENST00000446877 FMN1Q68DA7 1419 aa40.36■■■■■ 4.05
PMS1-214ENST00000446877 HSPA2P54652 639 aa40.34■■■■■ 4.05
PMS1-214ENST00000446877 HECW1Q76N89 1606 aa40.29■■■■■ 4.04
PMS1-214ENST00000446877 ATP10AO60312 1499 aa40.22■■■■■ 4.03
PMS1-214ENST00000446877 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.21■■■■■ 4.03
PMS1-214ENST00000446877 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.16■■■■■ 4.02
PMS1-214ENST00000446877 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.16■■■■■ 4.02
PMS1-214ENST00000446877 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.15■■■■■ 4.02
PMS1-214ENST00000446877 CLIP1P30622 1438 aa40.13■■■■■ 4.01
PMS1-214ENST00000446877 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
PMS1-214ENST00000446877 AFAP1Q8N556 730 aa40.11■■■■■ 4.01
PMS1-214ENST00000446877 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.09■■■■■ 4.01
PMS1-214ENST00000446877 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.09■■■■■ 4.01
PMS1-214ENST00000446877 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.07■■■■■ 4.01
PMS1-214ENST00000446877 KIF14Q15058 1648 aa40.07■■■■■ 4.01
PMS1-214ENST00000446877 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.07■■■■■ 4.01
PMS1-214ENST00000446877 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.07■■■■■ 4
PMS1-214ENST00000446877 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.06■■■■■ 4
PMS1-214ENST00000446877 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
PMS1-214ENST00000446877 CERKQ8TCT0 537 aa40.02■■■■■ 4
PMS1-214ENST00000446877 KDM5CP41229 1560 aa39.92■■■■□ 3.98
PMS1-214ENST00000446877 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.91■■■■□ 3.98
PMS1-214ENST00000446877 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.9■■■■□ 3.98
PMS1-214ENST00000446877 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.86■■■■□ 3.97
PMS1-214ENST00000446877 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.84■■■■□ 3.97
PMS1-214ENST00000446877 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.84■■■■□ 3.97
PMS1-214ENST00000446877 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.83■■■■□ 3.97
PMS1-214ENST00000446877 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.83■■■■□ 3.97
PMS1-214ENST00000446877 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.81■■■■□ 3.96
PMS1-214ENST00000446877 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.81■■■■□ 3.96
PMS1-214ENST00000446877 REREQ9P2R6 1566 aa39.78■■■■□ 3.96
PMS1-214ENST00000446877 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.76■■■■□ 3.96
PMS1-214ENST00000446877 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.75■■■■□ 3.95
PMS1-214ENST00000446877 ABCC1P33527 1531 aa39.72■■■■□ 3.95
PMS1-214ENST00000446877 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
PMS1-214ENST00000446877 PREX2Q70Z35 1606 aa39.72■■■■□ 3.95
PMS1-214ENST00000446877 ABCA6Q8N139 1617 aa39.71■■■■□ 3.95
PMS1-214ENST00000446877 AGLP35573 1532 aa39.7■■■■□ 3.95
PMS1-214ENST00000446877 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
PMS1-214ENST00000446877 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.63■■■■□ 3.93
PMS1-214ENST00000446877 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.62■■■■□ 3.93
PMS1-214ENST00000446877 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.6■■■■□ 3.93
PMS1-214ENST00000446877 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.6■■■■□ 3.93
PMS1-214ENST00000446877 STRCQ7RTU9 1775 aa39.59■■■■□ 3.93
PMS1-214ENST00000446877 PTPRTO14522 1441 aa39.57■■■■□ 3.93
PMS1-214ENST00000446877 C3P01024 1663 aa39.57■■■■□ 3.92
PMS1-214ENST00000446877 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.56■■■■□ 3.924e-6■■■■□ 23.6
PMS1-214ENST00000446877 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.54■■■■□ 3.92
PMS1-214ENST00000446877 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
PMS1-214ENST00000446877 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.52■■■■□ 3.92
PMS1-214ENST00000446877 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
PMS1-214ENST00000446877 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.5■■■■□ 3.91
PMS1-214ENST00000446877 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.46■■■■□ 3.91
PMS1-214ENST00000446877 ZMYM3Q14202 1370 aa39.46■■■■□ 3.91
PMS1-214ENST00000446877 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.46■■■■□ 3.91
PMS1-214ENST00000446877 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.44■■■■□ 3.9
PMS1-214ENST00000446877 NPATQ14207 1427 aa39.43■■■■□ 3.9
PMS1-214ENST00000446877 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.43■■■■□ 3.9
PMS1-214ENST00000446877 NCOA1Q15788 1441 aa39.41■■■■□ 3.9
PMS1-214ENST00000446877 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.39■■■■□ 3.9
PMS1-214ENST00000446877 DISP3Q9P2K9 1392 aa39.37■■■■□ 3.89
PMS1-214ENST00000446877 GGT6Q6P531 493 aa39.36■■■■□ 3.89
PMS1-214ENST00000446877 ATP7AQ04656 1500 aa39.35■■■■□ 3.89
PMS1-214ENST00000446877 A2MP01023 1474 aa39.34■■■■□ 3.89
PMS1-214ENST00000446877 MROH2AA6NES4 1674 aa39.3■■■■□ 3.88
PMS1-214ENST00000446877 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
PMS1-214ENST00000446877 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.29■■■■□ 3.88
PMS1-214ENST00000446877 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.29■■■■□ 3.88
PMS1-214ENST00000446877 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.28■■■■□ 3.88
PMS1-214ENST00000446877 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.28■■■■□ 3.88
PMS1-214ENST00000446877 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
PMS1-214ENST00000446877 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
PMS1-214ENST00000446877 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.23■■■■□ 3.87
PMS1-214ENST00000446877 PLXNC1O60486 1568 aa39.22■■■■□ 3.87
PMS1-214ENST00000446877 PKD2Q13563 968 aa39.22■■■■□ 3.87
PMS1-214ENST00000446877 PTPRKQ15262 1439 aa39.2■■■■□ 3.87
PMS1-214ENST00000446877 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.18■■■■□ 3.86
PMS1-214ENST00000446877 ILDR2Q71H61 639 aa39.17■■■■□ 3.86
PMS1-214ENST00000446877 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
PMS1-214ENST00000446877 PLA2R1Q13018 1463 aa39.12■■■■□ 3.85
PMS1-214ENST00000446877 MBD5Q9P267 1494 aa39.11■■■■□ 3.85
PMS1-214ENST00000446877 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.1■■■■□ 3.85
PMS1-214ENST00000446877 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.09■■■■□ 3.85
PMS1-214ENST00000446877 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.08■■■■□ 3.85
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PMS1-214ENST00000446877 TIAM1Q13009 1591 aa39.07■■■■□ 3.84
PMS1-214ENST00000446877 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.07■■■■□ 3.84
PMS1-214ENST00000446877 SOCS7O14512 581 aa39.06■■■■□ 3.84
PMS1-214ENST00000446877 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.06■■■■□ 3.84
PMS1-214ENST00000446877 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
PMS1-214ENST00000446877 KIF3BO15066 747 aa39.03■■■■□ 3.84
PMS1-214ENST00000446877 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
PMS1-214ENST00000446877 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.01■■■■□ 3.84
PMS1-214ENST00000446877 A2ML1A8K2U0 1454 aa38.98■■■■□ 3.83
PMS1-214ENST00000446877 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa38.97■■■■□ 3.83
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