RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442720.5

SGO1-209, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 2,266 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-209ENST00000442720 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
SGO1-209ENST00000442720 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
SGO1-209ENST00000442720 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.55■■■□□ 2
SGO1-209ENST00000442720 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.52■■■□□ 2
SGO1-209ENST00000442720 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.52■■■□□ 2
SGO1-209ENST00000442720 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
SGO1-209ENST00000442720 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
SGO1-209ENST00000442720 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.5■■□□□ 1.99
SGO1-209ENST00000442720 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
SGO1-209ENST00000442720 ABCA8O94911 1581 aa27.48■■□□□ 1.99
SGO1-209ENST00000442720 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.47■■□□□ 1.99
SGO1-209ENST00000442720 KIF14Q15058 1648 aa27.46■■□□□ 1.99
SGO1-209ENST00000442720 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.43■■□□□ 1.98
SGO1-209ENST00000442720 ATP10BO94823 1461 aa27.4■■□□□ 1.98
SGO1-209ENST00000442720 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.38■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 FOXD1Q16676 465 aa27.36■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 KCNH8Q96L42 1107 aa27.36■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 NCOA1Q15788 1441 aa27.35■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.35■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 ADGRL2O95490 1459 aa27.33■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.33■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 PTPRGP23470 1445 aa27.32■■□□□ 1.96
SGO1-209ENST00000442720 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.32■■□□□ 1.96
SGO1-209ENST00000442720 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.31■■□□□ 1.96
SGO1-209ENST00000442720 ANP32CO43423 234 aa27.31■■□□□ 1.96
SGO1-209ENST00000442720 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.31■■□□□ 1.96
SGO1-209ENST00000442720 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
SGO1-209ENST00000442720 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.28■■□□□ 1.96
SGO1-209ENST00000442720 CHD1O14646 1710 aa27.28■■□□□ 1.96
SGO1-209ENST00000442720 CCER2I3L3R5 266 aa27.28■■□□□ 1.96
SGO1-209ENST00000442720 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
SGO1-209ENST00000442720 PZPP20742 1482 aa27.25■■□□□ 1.95
SGO1-209ENST00000442720 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.95
SGO1-209ENST00000442720 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.2■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.18■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.17■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 SHROOM2Q13796 1616 aa27.17■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.15■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.15■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 TSPY4P0CV99 314 aa27.15■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 TSPY10P0CW01 314 aa27.15■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.13■■□□□ 1.93
SGO1-209ENST00000442720 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.13■■□□□ 1.93
SGO1-209ENST00000442720 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.11■■□□□ 1.93
SGO1-209ENST00000442720 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
SGO1-209ENST00000442720 PKD2Q13563 968 aa27.1■■□□□ 1.93
SGO1-209ENST00000442720 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.07■■□□□ 1.92
SGO1-209ENST00000442720 MBD5Q9P267 1494 aa27.06■■□□□ 1.92
SGO1-209ENST00000442720 PREX2Q70Z35 1606 aa27.06■■□□□ 1.92
SGO1-209ENST00000442720 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.04■■□□□ 1.92
SGO1-209ENST00000442720 NUP155O75694 1391 aa27.04■■□□□ 1.92
SGO1-209ENST00000442720 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SGO1-209ENST00000442720 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.04■■□□□ 1.92
SGO1-209ENST00000442720 KIF15Q9NS87 1388 aa27.01■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.01■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.01■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 ABCC2Q92887 1545 aa27■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 CCDC7Q96M83 1385 aa27■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.98■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.98■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.94■■□□□ 1.9
SGO1-209ENST00000442720 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.93■■□□□ 1.9
SGO1-209ENST00000442720 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SGO1-209ENST00000442720 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.9■■□□□ 1.9
SGO1-209ENST00000442720 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.89■■□□□ 1.9
SGO1-209ENST00000442720 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.89■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.88■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.86■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.86■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.85■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.84■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.83■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.82■■□□□ 1.88
SGO1-209ENST00000442720 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SGO1-209ENST00000442720 USP47Q96K76 1375 aa26.81■■□□□ 1.88
SGO1-209ENST00000442720 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SGO1-209ENST00000442720 PLCH2O75038 1416 aa26.78■■□□□ 1.88
SGO1-209ENST00000442720 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.78■■□□□ 1.88
SGO1-209ENST00000442720 PLXNC1O60486 1568 aa26.77■■□□□ 1.88
SGO1-209ENST00000442720 KDM5CP41229 1560 aa26.77■■□□□ 1.88
SGO1-209ENST00000442720 UNC13BO14795 1591 aa26.76■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.74■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 FKBP8Q14318 412 aa26.73■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.73■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.72■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.71■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.7■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.7■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 NEFLP07196 543 aa26.69■■□□□ 1.86
SGO1-209ENST00000442720 CCDC184Q52MB2 194 aa26.69■■□□□ 1.86
SGO1-209ENST00000442720 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.861e-8■■■■■ 27.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms