RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 GRIN2AQ12879 1464 aa20.57■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.57■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 DISP1Q96F81 1524 aa20.56■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.55■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 FOXD1Q16676 465 aa20.53■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 MIA2Q96PC5 1412 aa20.53■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA0556O60303 1618 aa20.53■□□□□ 0.88
TOP3B-206ENST00000436282 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.5■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.5■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 AKNAQ7Z591 1439 aa20.48■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC184Q52MB2 194 aa20.48■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 KDM6BO15054 1643 aa20.47■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 NCOA1Q15788 1441 aa20.47■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.47■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 JPH4Q96JJ6 628 aa20.46■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC7Q96M83 1385 aa20.45■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.44■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.44■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 DAPK1P53355 1430 aa20.43■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 SYNJ2O15056 1496 aa20.43■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 ABCC5O15440 1437 aa20.42■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 CEP170Q5SW79 1584 aa20.41■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.41■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 MRS2Q9HD23 443 aa20.41■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.4■□□□□ 0.86
TOP3B-206ENST00000436282 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TOP3B-206ENST00000436282 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.39■□□□□ 0.85
TOP3B-206ENST00000436282 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
TOP3B-206ENST00000436282 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TOP3B-206ENST00000436282 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.38■□□□□ 0.85
TOP3B-206ENST00000436282 ROCK1Q13464 1354 aa20.34■□□□□ 0.85
TOP3B-206ENST00000436282 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.32■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.31■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.31■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 NUP160Q12769 1436 aa20.3■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.3■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.28■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 KIF14Q15058 1648 aa20.27■□□□□ 0.84
TOP3B-206ENST00000436282 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.23■□□□□ 0.83
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TOP3B-206ENST00000436282 NUDCQ9Y266 331 aa20.21■□□□□ 0.83
TOP3B-206ENST00000436282 PKD2Q13563 968 aa20.2■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 ATP10BO94823 1461 aa20.2■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.19■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.17■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 PZPP20742 1482 aa20.17■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRGP23470 1445 aa20.17■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 TSPY4P0CV99 314 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 TSPY10P0CW01 314 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.16■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 ABCA8O94911 1581 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 NBR1Q14596 966 aa20.14■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 MBD5Q9P267 1494 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.13■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 NUP155O75694 1391 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.12■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 ADGRL2O95490 1459 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.1■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 USP47Q96K76 1375 aa20.08■□□□□ 0.81
TOP3B-206ENST00000436282 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.07■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 KDM5CP41229 1560 aa20.07■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.06■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 KIF15Q9NS87 1388 aa20.04■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.04■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
TOP3B-206ENST00000436282 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms