RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424350.5

ANKRD54-206, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-206ENST00000424350 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
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ANKRD54-206ENST00000424350 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
ANKRD54-206ENST00000424350 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.37■■■□□ 2.13
ANKRD54-206ENST00000424350 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.36■■■□□ 2.13
ANKRD54-206ENST00000424350 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.36■■■□□ 2.13
ANKRD54-206ENST00000424350 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.35■■■□□ 2.13
ANKRD54-206ENST00000424350 ATP10AO60312 1499 aa28.33■■■□□ 2.13
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ANKRD54-206ENST00000424350 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD54-206ENST00000424350 PLCH2O75038 1416 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD54-206ENST00000424350 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.27■■■□□ 2.12
ANKRD54-206ENST00000424350 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.26■■■□□ 2.12
ANKRD54-206ENST00000424350 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
ANKRD54-206ENST00000424350 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.2■■■□□ 2.1
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ANKRD54-206ENST00000424350 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
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ANKRD54-206ENST00000424350 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD54-206ENST00000424350 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.1■■■□□ 2.09
ANKRD54-206ENST00000424350 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.1■■■□□ 2.09
ANKRD54-206ENST00000424350 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.08■■■□□ 2.09
ANKRD54-206ENST00000424350 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
ANKRD54-206ENST00000424350 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.06■■■□□ 2.08
ANKRD54-206ENST00000424350 KDM5CP41229 1560 aa28.06■■■□□ 2.08
ANKRD54-206ENST00000424350 EEA1Q15075 1411 aa28.04■■■□□ 2.08
ANKRD54-206ENST00000424350 C3P01024 1663 aa28.03■■■□□ 2.08
ANKRD54-206ENST00000424350 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.03■■■□□ 2.08
ANKRD54-206ENST00000424350 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
ANKRD54-206ENST00000424350 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.02■■■□□ 2.08
ANKRD54-206ENST00000424350 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
ANKRD54-206ENST00000424350 REREQ9P2R6 1566 aa28.01■■■□□ 2.07
ANKRD54-206ENST00000424350 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.01■■■□□ 2.07
ANKRD54-206ENST00000424350 NCOA1Q15788 1441 aa28■■■□□ 2.07
ANKRD54-206ENST00000424350 KIF14Q15058 1648 aa27.99■■■□□ 2.07
ANKRD54-206ENST00000424350 ABCA6Q8N139 1617 aa27.96■■■□□ 2.07
ANKRD54-206ENST00000424350 MLH3Q9UHC1 1453 aa27.95■■■□□ 2.07
ANKRD54-206ENST00000424350 AGLP35573 1532 aa27.94■■■□□ 2.06
ANKRD54-206ENST00000424350 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
ANKRD54-206ENST00000424350 FMN1Q68DA7 1419 aa27.92■■■□□ 2.06
ANKRD54-206ENST00000424350 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.9■■■□□ 2.06
ANKRD54-206ENST00000424350 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.9■■■□□ 2.06
ANKRD54-206ENST00000424350 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.89■■■□□ 2.05
ANKRD54-206ENST00000424350 CLIP1P30622 1438 aa27.88■■■□□ 2.05
ANKRD54-206ENST00000424350 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
ANKRD54-206ENST00000424350 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.86■■■□□ 2.05
ANKRD54-206ENST00000424350 NPATQ14207 1427 aa27.84■■■□□ 2.05
ANKRD54-206ENST00000424350 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.83■■■□□ 2.05
ANKRD54-206ENST00000424350 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.81■■■□□ 2.04
ANKRD54-206ENST00000424350 ABCC1P33527 1531 aa27.81■■■□□ 2.04
ANKRD54-206ENST00000424350 ZMYM3Q14202 1370 aa27.79■■■□□ 2.04
ANKRD54-206ENST00000424350 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.78■■■□□ 2.04
ANKRD54-206ENST00000424350 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
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ANKRD54-206ENST00000424350 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.75■■■□□ 2.03
ANKRD54-206ENST00000424350 PREX2Q70Z35 1606 aa27.75■■■□□ 2.03
ANKRD54-206ENST00000424350 PKD2Q13563 968 aa27.75■■■□□ 2.03
ANKRD54-206ENST00000424350 MROH2AA6NES4 1674 aa27.74■■■□□ 2.03
ANKRD54-206ENST00000424350 PLA2R1Q13018 1463 aa27.71■■■□□ 2.03
ANKRD54-206ENST00000424350 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.71■■■□□ 2.03
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ANKRD54-206ENST00000424350 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.66■■■□□ 2.02
ANKRD54-206ENST00000424350 HSPA1LP34931 641 aa27.66■■■□□ 2.02
ANKRD54-206ENST00000424350 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.66■■■□□ 2.02
ANKRD54-206ENST00000424350 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.64■■■□□ 2.02
ANKRD54-206ENST00000424350 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
ANKRD54-206ENST00000424350 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.01
ANKRD54-206ENST00000424350 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
ANKRD54-206ENST00000424350 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
ANKRD54-206ENST00000424350 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
ANKRD54-206ENST00000424350 PTPRKQ15262 1439 aa27.63■■■□□ 2.01
ANKRD54-206ENST00000424350 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
ANKRD54-206ENST00000424350 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
ANKRD54-206ENST00000424350 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
ANKRD54-206ENST00000424350 PIP4K2BP78356 416 aa27.61■■■□□ 2.01
ANKRD54-206ENST00000424350 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.6■■■□□ 2.01
ANKRD54-206ENST00000424350 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.58■■■□□ 2.01
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ANKRD54-206ENST00000424350 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.57■■■□□ 2
ANKRD54-206ENST00000424350 TOM1O60784 492 aa27.56■■■□□ 2
ANKRD54-206ENST00000424350 A2MP01023 1474 aa27.54■■■□□ 2
ANKRD54-206ENST00000424350 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.54■■■□□ 2
ANKRD54-206ENST00000424350 PLXNC1O60486 1568 aa27.53■■■□□ 2
ANKRD54-206ENST00000424350 ATP7AQ04656 1500 aa27.53■■■□□ 2
ANKRD54-206ENST00000424350 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
ANKRD54-206ENST00000424350 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.5■■□□□ 1.99
ANKRD54-206ENST00000424350 CPS1P31327 1500 aa27.48■■□□□ 1.99
ANKRD54-206ENST00000424350 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
ANKRD54-206ENST00000424350 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
ANKRD54-206ENST00000424350 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.47■■□□□ 1.99
ANKRD54-206ENST00000424350 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
ANKRD54-206ENST00000424350 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.45■■□□□ 1.99
ANKRD54-206ENST00000424350 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
ANKRD54-206ENST00000424350 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.43■■□□□ 1.98
ANKRD54-206ENST00000424350 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.4■■□□□ 1.98
ANKRD54-206ENST00000424350 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
ANKRD54-206ENST00000424350 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
ANKRD54-206ENST00000424350 TNRQ92752 1358 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD54-206ENST00000424350 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.36■■□□□ 1.97
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