RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421939.5

CDK9-202, Transcript of cyclin dependent kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene CDK9, Length 702 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9-202ENST00000421939 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
CDK9-202ENST00000421939 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.03■■■■■ 4.32
CDK9-202ENST00000421939 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.01■■■■■ 4.32
CDK9-202ENST00000421939 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.01■■■■■ 4.32
CDK9-202ENST00000421939 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42■■■■■ 4.31
CDK9-202ENST00000421939 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.99■■■■■ 4.31
CDK9-202ENST00000421939 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.98■■■■■ 4.31
CDK9-202ENST00000421939 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.97■■■■■ 4.31
CDK9-202ENST00000421939 TIAM1Q13009 1591 aa41.94■■■■■ 4.3
CDK9-202ENST00000421939 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.94■■■■■ 4.3
CDK9-202ENST00000421939 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
CDK9-202ENST00000421939 ABCC1P33527 1531 aa41.86■■■■■ 4.29
CDK9-202ENST00000421939 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.85■■■■■ 4.29
CDK9-202ENST00000421939 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.85■■■■■ 4.29
CDK9-202ENST00000421939 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.84■■■■■ 4.29
CDK9-202ENST00000421939 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.84■■■■■ 4.29
CDK9-202ENST00000421939 MAP3K1Q13233 1512 aa41.79■■■■■ 4.28
CDK9-202ENST00000421939 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.78■■■■■ 4.28
CDK9-202ENST00000421939 KDM5CP41229 1560 aa41.78■■■■■ 4.28
CDK9-202ENST00000421939 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
CDK9-202ENST00000421939 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.78■■■■■ 4.28
CDK9-202ENST00000421939 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.77■■■■■ 4.28
CDK9-202ENST00000421939 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.76■■■■■ 4.28
CDK9-202ENST00000421939 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.74■■■■■ 4.27
CDK9-202ENST00000421939 NCOA2Q15596 1464 aa41.72■■■■■ 4.27
CDK9-202ENST00000421939 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
CDK9-202ENST00000421939 AFAP1Q8N556 730 aa41.71■■■■■ 4.27
CDK9-202ENST00000421939 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
CDK9-202ENST00000421939 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.69■■■■■ 4.27
CDK9-202ENST00000421939 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.68■■■■■ 4.26
CDK9-202ENST00000421939 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.68■■■■■ 4.26
CDK9-202ENST00000421939 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.66■■■■■ 4.26
CDK9-202ENST00000421939 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
CDK9-202ENST00000421939 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.62■■■■■ 4.25
CDK9-202ENST00000421939 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.6■■■■■ 4.25
CDK9-202ENST00000421939 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.6■■■■■ 4.25
CDK9-202ENST00000421939 ATP10AO60312 1499 aa41.59■■■■■ 4.25
CDK9-202ENST00000421939 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
CDK9-202ENST00000421939 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.58■■■■■ 4.25
CDK9-202ENST00000421939 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.58■■■■■ 4.25
CDK9-202ENST00000421939 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.58■■■■■ 4.25
CDK9-202ENST00000421939 APLP2Q06481 763 aa41.55■■■■■ 4.24
CDK9-202ENST00000421939 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.54■■■■■ 4.24
CDK9-202ENST00000421939 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.54■■■■■ 4.24
CDK9-202ENST00000421939 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.53■■■■■ 4.24
CDK9-202ENST00000421939 ABCA6Q8N139 1617 aa41.53■■■■■ 4.24
CDK9-202ENST00000421939 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
CDK9-202ENST00000421939 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.49■■■■■ 4.23
CDK9-202ENST00000421939 REREQ9P2R6 1566 aa41.46■■■■■ 4.23
CDK9-202ENST00000421939 MADDQ8WXG6 1647 aa41.45■■■■■ 4.23
CDK9-202ENST00000421939 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.44■■■■■ 4.22
CDK9-202ENST00000421939 MBD5Q9P267 1494 aa41.43■■■■■ 4.22
CDK9-202ENST00000421939 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
CDK9-202ENST00000421939 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
CDK9-202ENST00000421939 ATP7AQ04656 1500 aa41.39■■■■■ 4.22
CDK9-202ENST00000421939 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.36■■■■■ 4.21
CDK9-202ENST00000421939 PTPRMP28827 1452 aa41.35■■■■■ 4.21
CDK9-202ENST00000421939 MLECQ14165 292 aa41.32■■■■■ 4.21
CDK9-202ENST00000421939 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.32■■■■■ 4.2
CDK9-202ENST00000421939 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
CDK9-202ENST00000421939 AGLP35573 1532 aa41.3■■■■■ 4.2
CDK9-202ENST00000421939 MIA2Q96PC5 1412 aa41.3■■■■■ 4.2
CDK9-202ENST00000421939 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.27■■■■■ 4.2
CDK9-202ENST00000421939 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa41.27■■■■■ 4.2
CDK9-202ENST00000421939 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.22■■■■■ 4.19
CDK9-202ENST00000421939 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.22■■■■■ 4.19
CDK9-202ENST00000421939 PLXNC1O60486 1568 aa41.2■■■■■ 4.19
CDK9-202ENST00000421939 A2MP01023 1474 aa41.18■■■■■ 4.18
CDK9-202ENST00000421939 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.17■■■■■ 4.18
CDK9-202ENST00000421939 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.12■■■■■ 4.17
CDK9-202ENST00000421939 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.1■■■■■ 4.17
CDK9-202ENST00000421939 TSPY4P0CV99 314 aa41.06■■■■■ 4.16
CDK9-202ENST00000421939 TSPY10P0CW01 314 aa41.06■■■■■ 4.16
CDK9-202ENST00000421939 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.05■■■■■ 4.16
CDK9-202ENST00000421939 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
CDK9-202ENST00000421939 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41■■■■■ 4.15
CDK9-202ENST00000421939 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
CDK9-202ENST00000421939 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.95■■■■■ 4.15
CDK9-202ENST00000421939 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.95■■■■■ 4.15
CDK9-202ENST00000421939 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
CDK9-202ENST00000421939 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.93■■■■■ 4.14
CDK9-202ENST00000421939 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
CDK9-202ENST00000421939 ABCC5O15440 1437 aa40.92■■■■■ 4.14
CDK9-202ENST00000421939 DAPK1P53355 1430 aa40.89■■■■■ 4.14
CDK9-202ENST00000421939 C3P01024 1663 aa40.88■■■■■ 4.13
CDK9-202ENST00000421939 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
CDK9-202ENST00000421939 MROH2AA6NES4 1674 aa40.86■■■■■ 4.13
CDK9-202ENST00000421939 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.86■■■■■ 4.13
CDK9-202ENST00000421939 GGT6Q6P531 493 aa40.85■■■■■ 4.13
CDK9-202ENST00000421939 KIF3BO15066 747 aa40.81■■■■■ 4.12
CDK9-202ENST00000421939 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
CDK9-202ENST00000421939 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.78■■■■■ 4.12
CDK9-202ENST00000421939 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
CDK9-202ENST00000421939 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.76■■■■■ 4.12
CDK9-202ENST00000421939 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.75■■■■■ 4.11
CDK9-202ENST00000421939 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
CDK9-202ENST00000421939 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
CDK9-202ENST00000421939 KIF15Q9NS87 1388 aa40.74■■■■■ 4.11
CDK9-202ENST00000421939 ZMYM3Q14202 1370 aa40.73■■■■■ 4.11
CDK9-202ENST00000421939 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.72■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.2 ms