RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 PLCH2O75038 1416 aa31.85■■■□□ 2.69
UBXN4-202ENST00000415164 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.85■■■□□ 2.69
UBXN4-202ENST00000415164 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
UBXN4-202ENST00000415164 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.8■■■□□ 2.68
UBXN4-202ENST00000415164 MAGI2Q86UL8 1455 aa31.78■■■□□ 2.68
UBXN4-202ENST00000415164 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.78■■■□□ 2.68
UBXN4-202ENST00000415164 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.76■■■□□ 2.67
UBXN4-202ENST00000415164 HSPA2P54652 639 aa31.75■■■□□ 2.67
UBXN4-202ENST00000415164 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.74■■■□□ 2.67
UBXN4-202ENST00000415164 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.74■■■□□ 2.67
UBXN4-202ENST00000415164 KIF14Q15058 1648 aa31.74■■■□□ 2.67
UBXN4-202ENST00000415164 FBXO41Q8TF61 875 aa31.72■■■□□ 2.67
UBXN4-202ENST00000415164 CLIP1P30622 1438 aa31.72■■■□□ 2.67
UBXN4-202ENST00000415164 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.7■■■□□ 2.67
UBXN4-202ENST00000415164 ATP10AO60312 1499 aa31.67■■■□□ 2.66
UBXN4-202ENST00000415164 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.66■■■□□ 2.66
UBXN4-202ENST00000415164 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.64■■■□□ 2.66
UBXN4-202ENST00000415164 AFAP1Q8N556 730 aa31.63■■■□□ 2.65
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.62■■■□□ 2.65
UBXN4-202ENST00000415164 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.58■■■□□ 2.65
UBXN4-202ENST00000415164 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.54■■■□□ 2.64
UBXN4-202ENST00000415164 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.52■■■□□ 2.64
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.52■■■□□ 2.64
UBXN4-202ENST00000415164 KDM5CP41229 1560 aa31.5■■■□□ 2.63
UBXN4-202ENST00000415164 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.46■■■□□ 2.63
UBXN4-202ENST00000415164 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.46■■■□□ 2.63
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.45■■■□□ 2.63
UBXN4-202ENST00000415164 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.44■■■□□ 2.62
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UBXN4-202ENST00000415164 PREX2Q70Z35 1606 aa31.44■■■□□ 2.62
UBXN4-202ENST00000415164 ABCC1P33527 1531 aa31.41■■■□□ 2.62
UBXN4-202ENST00000415164 ABCA6Q8N139 1617 aa31.41■■■□□ 2.62
UBXN4-202ENST00000415164 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.4■■■□□ 2.62
UBXN4-202ENST00000415164 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.39■■■□□ 2.62
UBXN4-202ENST00000415164 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.38■■■□□ 2.61
UBXN4-202ENST00000415164 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.36■■■□□ 2.61
UBXN4-202ENST00000415164 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.36■■■□□ 2.61
UBXN4-202ENST00000415164 CERKQ8TCT0 537 aa31.36■■■□□ 2.61
UBXN4-202ENST00000415164 REREQ9P2R6 1566 aa31.33■■■□□ 2.61
UBXN4-202ENST00000415164 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.31■■■□□ 2.6
UBXN4-202ENST00000415164 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.6
UBXN4-202ENST00000415164 AGLP35573 1532 aa31.26■■■□□ 2.59
UBXN4-202ENST00000415164 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.25■■■□□ 2.59
UBXN4-202ENST00000415164 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.25■■■□□ 2.59
UBXN4-202ENST00000415164 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.25■■■□□ 2.59
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UBXN4-202ENST00000415164 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
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UBXN4-202ENST00000415164 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.23■■■□□ 2.59
UBXN4-202ENST00000415164 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
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UBXN4-202ENST00000415164 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.19■■■□□ 2.58
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UBXN4-202ENST00000415164 STRCQ7RTU9 1775 aa31.16■■■□□ 2.58
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UBXN4-202ENST00000415164 GGT6Q6P531 493 aa31.08■■■□□ 2.57
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UBXN4-202ENST00000415164 ZMYM3Q14202 1370 aa31.06■■■□□ 2.56
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UBXN4-202ENST00000415164 PTPRTO14522 1441 aa31.05■■■□□ 2.56
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
UBXN4-202ENST00000415164 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
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UBXN4-202ENST00000415164 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.99■■■□□ 2.55
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UBXN4-202ENST00000415164 TIAM1Q13009 1591 aa30.98■■■□□ 2.55
UBXN4-202ENST00000415164 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.97■■■□□ 2.55
UBXN4-202ENST00000415164 PLXNC1O60486 1568 aa30.96■■■□□ 2.55
UBXN4-202ENST00000415164 CEP162Q5TB80 1403 aa30.96■■■□□ 2.55
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UBXN4-202ENST00000415164 MBD5Q9P267 1494 aa30.88■■■□□ 2.53
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UBXN4-202ENST00000415164 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.82■■■□□ 2.52
UBXN4-202ENST00000415164 NCOA2Q15596 1464 aa30.82■■■□□ 2.52
UBXN4-202ENST00000415164 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa30.81■■■□□ 2.52
UBXN4-202ENST00000415164 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
UBXN4-202ENST00000415164 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.8■■■□□ 2.52
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.8■■■□□ 2.52
UBXN4-202ENST00000415164 PKD2Q13563 968 aa30.79■■■□□ 2.52
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
UBXN4-202ENST00000415164 PLA2R1Q13018 1463 aa30.76■■■□□ 2.51
UBXN4-202ENST00000415164 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
UBXN4-202ENST00000415164 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30.73■■■□□ 2.51
UBXN4-202ENST00000415164 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.72■■■□□ 2.51
UBXN4-202ENST00000415164 TSPY4P0CV99 314 aa30.71■■■□□ 2.51
UBXN4-202ENST00000415164 TSPY10P0CW01 314 aa30.71■■■□□ 2.51
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