RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393985.7

CXorf40A-202, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,148 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-202ENST00000393985 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.53■■■□□ 2.16
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CXorf40A-202ENST00000393985 ADGRL1O94910 1474 aa28.51■■■□□ 2.15
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CXorf40A-202ENST00000393985 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
CXorf40A-202ENST00000393985 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.49■■■□□ 2.15
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CXorf40A-202ENST00000393985 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.42■■■□□ 2.14
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CXorf40A-202ENST00000393985 RAPGEF3O95398 923 aa28.39■■■□□ 2.14
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CXorf40A-202ENST00000393985 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.32■■■□□ 2.12
CXorf40A-202ENST00000393985 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CXorf40A-202ENST00000393985 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.31■■■□□ 2.12
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CXorf40A-202ENST00000393985 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.29■■■□□ 2.12
CXorf40A-202ENST00000393985 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.28■■■□□ 2.12
CXorf40A-202ENST00000393985 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
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CXorf40A-202ENST00000393985 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.22■■■□□ 2.11
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CXorf40A-202ENST00000393985 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.16■■■□□ 2.1
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CXorf40A-202ENST00000393985 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.16■■■□□ 2.1
CXorf40A-202ENST00000393985 AFAP1Q8N556 730 aa28.15■■■□□ 2.1
CXorf40A-202ENST00000393985 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.14■■■□□ 2.1
CXorf40A-202ENST00000393985 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.14■■■□□ 2.1
CXorf40A-202ENST00000393985 ABCA6Q8N139 1617 aa28.14■■■□□ 2.09
CXorf40A-202ENST00000393985 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CXorf40A-202ENST00000393985 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.12■■■□□ 2.09
CXorf40A-202ENST00000393985 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CXorf40A-202ENST00000393985 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.11■■■□□ 2.09
CXorf40A-202ENST00000393985 MIA2Q96PC5 1412 aa28.11■■■□□ 2.09
CXorf40A-202ENST00000393985 ATP10AO60312 1499 aa28.11■■■□□ 2.09
CXorf40A-202ENST00000393985 ATP7AQ04656 1500 aa28.1■■■□□ 2.09
CXorf40A-202ENST00000393985 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
CXorf40A-202ENST00000393985 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
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CXorf40A-202ENST00000393985 REREQ9P2R6 1566 aa28.08■■■□□ 2.09
CXorf40A-202ENST00000393985 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.08■■■□□ 2.09
CXorf40A-202ENST00000393985 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
CXorf40A-202ENST00000393985 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.06■■■□□ 2.08
CXorf40A-202ENST00000393985 MBD5Q9P267 1494 aa28.06■■■□□ 2.08
CXorf40A-202ENST00000393985 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.05■■■□□ 2.08
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CXorf40A-202ENST00000393985 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.03■■■□□ 2.08
CXorf40A-202ENST00000393985 RSPH4AQ5TD94 716 aa28■■■□□ 2.07
CXorf40A-202ENST00000393985 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.99■■■□□ 2.07
CXorf40A-202ENST00000393985 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.99■■■□□ 2.07
CXorf40A-202ENST00000393985 MADDQ8WXG6 1647 aa27.99■■■□□ 2.07
CXorf40A-202ENST00000393985 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.97■■■□□ 2.07
CXorf40A-202ENST00000393985 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.96■■■□□ 2.07
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CXorf40A-202ENST00000393985 AGLP35573 1532 aa27.94■■■□□ 2.06
CXorf40A-202ENST00000393985 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
CXorf40A-202ENST00000393985 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.93■■■□□ 2.06
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CXorf40A-202ENST00000393985 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CXorf40A-202ENST00000393985 A2MP01023 1474 aa27.89■■■□□ 2.06
CXorf40A-202ENST00000393985 TSPY4P0CV99 314 aa27.89■■■□□ 2.06
CXorf40A-202ENST00000393985 TSPY10P0CW01 314 aa27.89■■■□□ 2.06
CXorf40A-202ENST00000393985 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.86■■■□□ 2.05
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CXorf40A-202ENST00000393985 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
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CXorf40A-202ENST00000393985 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.71■■■□□ 2.03
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CXorf40A-202ENST00000393985 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.67■■■□□ 2.02
CXorf40A-202ENST00000393985 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CXorf40A-202ENST00000393985 KIF15Q9NS87 1388 aa27.66■■■□□ 2.02
CXorf40A-202ENST00000393985 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.65■■■□□ 2.02
CXorf40A-202ENST00000393985 ADGRL2O95490 1459 aa27.64■■■□□ 2.01
CXorf40A-202ENST00000393985 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.01
CXorf40A-202ENST00000393985 GGT6Q6P531 493 aa27.63■■■□□ 2.01
CXorf40A-202ENST00000393985 ERBINQ96RT1 1412 aa27.63■■■□□ 2.01
CXorf40A-202ENST00000393985 KIF3BO15066 747 aa27.62■■■□□ 2.01
CXorf40A-202ENST00000393985 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
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