RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390664.2

CHST6-202, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHST6, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST6-202ENST00000390664 NAIPQ13075 1403 aa33.72■■■□□ 2.99
CHST6-202ENST00000390664 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.71■■■□□ 2.99
CHST6-202ENST00000390664 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.7■■■□□ 2.99
CHST6-202ENST00000390664 AKNAQ7Z591 1439 aa33.7■■■□□ 2.99
CHST6-202ENST00000390664 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.7■■■□□ 2.98
CHST6-202ENST00000390664 ABCC5O15440 1437 aa33.68■■■□□ 2.98
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CHST6-202ENST00000390664 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
CHST6-202ENST00000390664 CROCC2H7BZ55 1655 aa33.67■■■□□ 2.98
CHST6-202ENST00000390664 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.66■■■□□ 2.98
CHST6-202ENST00000390664 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.61■■■□□ 2.97
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CHST6-202ENST00000390664 ROCK1Q13464 1354 aa33.59■■■□□ 2.97
CHST6-202ENST00000390664 MAPKBP1O60336 1514 aa33.58■■■□□ 2.97
CHST6-202ENST00000390664 KCNH8Q96L42 1107 aa33.57■■■□□ 2.97
CHST6-202ENST00000390664 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.57■■■□□ 2.96
CHST6-202ENST00000390664 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.55■■■□□ 2.96
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CHST6-202ENST00000390664 ADGRL2O95490 1459 aa33.48■■■□□ 2.95
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CHST6-202ENST00000390664 PLCH2O75038 1416 aa33.44■■■□□ 2.94
CHST6-202ENST00000390664 MBD5Q9P267 1494 aa33.44■■■□□ 2.94
CHST6-202ENST00000390664 ASXL2Q76L83 1435 aa33.43■■■□□ 2.94
CHST6-202ENST00000390664 NCOA1Q15788 1441 aa33.42■■■□□ 2.94
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CHST6-202ENST00000390664 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.41■■■□□ 2.94
CHST6-202ENST00000390664 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.4■■■□□ 2.94
CHST6-202ENST00000390664 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.4■■■□□ 2.94
CHST6-202ENST00000390664 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.39■■■□□ 2.94
CHST6-202ENST00000390664 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.39■■■□□ 2.94
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CHST6-202ENST00000390664 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.38■■■□□ 2.93
CHST6-202ENST00000390664 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.37■■■□□ 2.93
CHST6-202ENST00000390664 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.37■■■□□ 2.93
CHST6-202ENST00000390664 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.37■■■□□ 2.93
CHST6-202ENST00000390664 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.37■■■□□ 2.93
CHST6-202ENST00000390664 TSPY4P0CV99 314 aa33.34■■■□□ 2.93
CHST6-202ENST00000390664 TSPY10P0CW01 314 aa33.34■■■□□ 2.93
CHST6-202ENST00000390664 RSPH4AQ5TD94 716 aa33.33■■■□□ 2.93
CHST6-202ENST00000390664 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.33■■■□□ 2.93
CHST6-202ENST00000390664 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.93
CHST6-202ENST00000390664 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.3■■■□□ 2.92
CHST6-202ENST00000390664 TRIM52Q96A61 297 aa33.29■■■□□ 2.92
CHST6-202ENST00000390664 ABCC1P33527 1531 aa33.29■■■□□ 2.92
CHST6-202ENST00000390664 MAST1Q9Y2H9 1570 aa33.28■■■□□ 2.92
CHST6-202ENST00000390664 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.24■■■□□ 2.91
CHST6-202ENST00000390664 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.22■■■□□ 2.91
CHST6-202ENST00000390664 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.2■■■□□ 2.91
CHST6-202ENST00000390664 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.9
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CHST6-202ENST00000390664 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.19■■■□□ 2.9
CHST6-202ENST00000390664 FANCAO15360 1455 aa33.19■■■□□ 2.9
CHST6-202ENST00000390664 PLXNC1O60486 1568 aa33.16■■■□□ 2.9
CHST6-202ENST00000390664 NEUROD1Q13562 356 aa33.16■■■□□ 2.9
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CHST6-202ENST00000390664 CD109Q6YHK3 1445 aa33.04■■■□□ 2.88
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CHST6-202ENST00000390664 DUOX2Q9NRD8 1548 aa33.01■■■□□ 2.87
CHST6-202ENST00000390664 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33■■■□□ 2.87
CHST6-202ENST00000390664 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.98■■■□□ 2.87
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CHST6-202ENST00000390664 TONSLQ96HA7 1378 aa32.98■■■□□ 2.87
CHST6-202ENST00000390664 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.98■■■□□ 2.87
CHST6-202ENST00000390664 FOXD1Q16676 465 aa32.96■■■□□ 2.87
CHST6-202ENST00000390664 AFAP1Q8N556 730 aa32.96■■■□□ 2.87
CHST6-202ENST00000390664 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
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CHST6-202ENST00000390664 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.93■■■□□ 2.86
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CHST6-202ENST00000390664 GLI2P10070 1586 aa32.9■■■□□ 2.86
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CHST6-202ENST00000390664 NEO1Q92859 1461 aa32.84■■■□□ 2.85
CHST6-202ENST00000390664 DIP2BQ9P265 1576 aa32.83■■■□□ 2.85
CHST6-202ENST00000390664 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.82■■■□□ 2.85
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CHST6-202ENST00000390664 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.81■■■□□ 2.84
CHST6-202ENST00000390664 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.8■■■□□ 2.84
CHST6-202ENST00000390664 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.79■■■□□ 2.84
CHST6-202ENST00000390664 KDM5CP41229 1560 aa32.79■■■□□ 2.84
CHST6-202ENST00000390664 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.76■■■□□ 2.84
CHST6-202ENST00000390664 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.72■■■□□ 2.83
CHST6-202ENST00000390664 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.72■■■□□ 2.83
CHST6-202ENST00000390664 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
CHST6-202ENST00000390664 DEPDC5O75140 1603 aa32.71■■■□□ 2.83
CHST6-202ENST00000390664 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.7■■■□□ 2.83
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