RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384479.1

RNU6-790P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 790, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-790P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-790P-201ENST00000384479 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RNU6-790P-201ENST00000384479 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-790P-201ENST00000384479 C2orf72A6NCS6 295 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-790P-201ENST00000384479 FOXK1P85037 733 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-790P-201ENST00000384479 TMC2Q8TDI7 906 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-790P-201ENST00000384479 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-790P-201ENST00000384479 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-790P-201ENST00000384479 PDE4AP27815 886 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-790P-201ENST00000384479 PLCB2Q00722 1185 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-790P-201ENST00000384479 MFSD10Q14728 455 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC34A2O95436 690 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-790P-201ENST00000384479 CFAP44Q96MT7 982 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-790P-201ENST00000384479 DOK7Q18PE1 504 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-790P-201ENST00000384479 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-790P-201ENST00000384479 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-790P-201ENST00000384479 DSG2Q14126 1118 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-790P-201ENST00000384479 RIMBP2O15034 1052 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-790P-201ENST00000384479 ST18O60284 1047 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-790P-201ENST00000384479 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-790P-201ENST00000384479 PLPP6Q8IY26 295 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-790P-201ENST00000384479 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-790P-201ENST00000384479 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-790P-201ENST00000384479 CAMK2BQ13554 666 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-790P-201ENST00000384479 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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RNU6-790P-201ENST00000384479 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-790P-201ENST00000384479 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-790P-201ENST00000384479 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-790P-201ENST00000384479 OXER1Q8TDS5 423 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-790P-201ENST00000384479 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-790P-201ENST00000384479 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-790P-201ENST00000384479 TBC1D12O60347 775 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARSIQ5FYB1 569 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-790P-201ENST00000384479 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-790P-201ENST00000384479 POTEMA6NI47 508 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-790P-201ENST00000384479 E2F4Q16254 413 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-790P-201ENST00000384479 POTEGQ6S5H5 508 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-790P-201ENST00000384479 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-790P-201ENST00000384479 WDR70Q9NW82 654 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-790P-201ENST00000384479 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-790P-201ENST00000384479 EMP3P54852 163 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-790P-201ENST00000384479 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-790P-201ENST00000384479 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-790P-201ENST00000384479 MARVELD3Q96A59 401 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-790P-201ENST00000384479 NUDT7P0C024 238 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-790P-201ENST00000384479 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU6-790P-201ENST00000384479 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
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RNU6-790P-201ENST00000384479 P3H3Q8IVL6 736 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-790P-201ENST00000384479 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
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RNU6-790P-201ENST00000384479 PTGER2P43116 358 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-790P-201ENST00000384479 MAP3K9P80192 1104 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU6-790P-201ENST00000384479 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.05□□□□□ -1.28
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RNU6-790P-201ENST00000384479 POTEBQ6S5H4 581 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-790P-201ENST00000384479 LHX6Q9UPM6 363 aa7.04□□□□□ -1.28
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RNU6-790P-201ENST00000384479 FAM205CA6NFA0 338 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-790P-201ENST00000384479 KCNV2Q8TDN2 545 aa7.03□□□□□ -1.28
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RNU6-790P-201ENST00000384479 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
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RNU6-790P-201ENST00000384479 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-790P-201ENST00000384479 PHF14O94880 888 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-790P-201ENST00000384479 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-790P-201ENST00000384479 FBXW7Q969H0 707 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-790P-201ENST00000384479 EPAS1Q99814 870 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-790P-201ENST00000384479 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-790P-201ENST00000384479 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-790P-201ENST00000384479 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-790P-201ENST00000384479 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-790P-201ENST00000384479 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-790P-201ENST00000384479 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-790P-201ENST00000384479 ARHGAP33O14559 1287 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-790P-201ENST00000384479 TK2O00142 265 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-790P-201ENST00000384479 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-790P-201ENST00000384479 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-790P-201ENST00000384479 OSBPP22059 807 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-790P-201ENST00000384479 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-790P-201ENST00000384479 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLC24A1O60721 1099 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 PTPREP23469 700 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 DDX12PQ92771 950 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 KCNH8Q96L42 1107 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 NBR1Q14596 966 aa6.87□□□□□ -1.31
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