RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379565.7

RPS6KA3-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KA3, Length 7,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3-201ENST00000379565 GORABQ5T7V8 394 aa22.28■■□□□ 1.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 HSCBQ8IWL3 235 aa22.27■■□□□ 1.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.27■■□□□ 1.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 PDE4CQ08493 712 aa22.27■■□□□ 1.16
RPS6KA3-201ENST00000379565 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.26■■□□□ 1.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.26■■□□□ 1.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 KIF27Q86VH2 1401 aa22.25■■□□□ 1.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.24■■□□□ 1.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.23■■□□□ 1.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.22■■□□□ 1.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 CEP162Q5TB80 1403 aa22.21■■□□□ 1.15
RPS6KA3-201ENST00000379565 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.17■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 MSH5O43196 834 aa22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.146e-7■■□□□ 14.2
RPS6KA3-201ENST00000379565 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 VPS53Q5VIR6 699 aa22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 NUTM2FA1L443 756 aa22.14■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
RPS6KA3-201ENST00000379565 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA3-201ENST00000379565 EID1Q9Y6B2 187 aa22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA3-201ENST00000379565 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA3-201ENST00000379565 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RPS6KA3-201ENST00000379565 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KA3-201ENST00000379565 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA3-201ENST00000379565 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA3-201ENST00000379565 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA3-201ENST00000379565 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RPS6KA3-201ENST00000379565 STK31Q9BXU1 1019 aa22.09■■□□□ 1.13
RPS6KA3-201ENST00000379565 TOMM22Q9NS69 142 aa22.08■■□□□ 1.13
RPS6KA3-201ENST00000379565 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.08■■□□□ 1.12
RPS6KA3-201ENST00000379565 FOXD1Q16676 465 aa22.06■■□□□ 1.12
RPS6KA3-201ENST00000379565 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA3-201ENST00000379565 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.05■■□□□ 1.12
RPS6KA3-201ENST00000379565 PKD2Q13563 968 aa22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA3-201ENST00000379565 AMPHP49418 695 aa22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA3-201ENST00000379565 GPATCH3Q96I76 525 aa22.04■■□□□ 1.12
RPS6KA3-201ENST00000379565 MARCH6O60337 910 aa22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA3-201ENST00000379565 EEA1Q15075 1411 aa22.03■■□□□ 1.12
RPS6KA3-201ENST00000379565 CFAP44Q96MT7 982 aa22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA3-201ENST00000379565 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RPS6KA3-201ENST00000379565 EVA1CP58658 441 aa22■■□□□ 1.11
RPS6KA3-201ENST00000379565 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RPS6KA3-201ENST00000379565 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
RPS6KA3-201ENST00000379565 KLHL34Q8N239 644 aa21.99■■□□□ 1.11
RPS6KA3-201ENST00000379565 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.112e-7■■□□□ 13.7
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RPS6KA3-201ENST00000379565 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA3-201ENST00000379565 KIF3BO15066 747 aa21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA3-201ENST00000379565 WWC1Q8IX03 1113 aa21.98■■□□□ 1.11
RPS6KA3-201ENST00000379565 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RPS6KA3-201ENST00000379565 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RPS6KA3-201ENST00000379565 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RPS6KA3-201ENST00000379565 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
RPS6KA3-201ENST00000379565 RAD21O60216 631 aa21.96■■□□□ 1.11
RPS6KA3-201ENST00000379565 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.94■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.93■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.93■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.92■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 CUX2O14529 1486 aa21.92■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.92■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 TPM4P67936 248 aa21.92■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.91■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.91■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 CEP89Q96ST8 783 aa21.91■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.91■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.91■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
RPS6KA3-201ENST00000379565 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.88■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.87■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 NGEFQ8N5V2 710 aa21.87■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 FBXW7Q969H0 707 aa21.87■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 NUP155O75694 1391 aa21.87■■□□□ 1.09
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RPS6KA3-201ENST00000379565 HMMRO75330 724 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.86■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.85■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 PES1O00541 588 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 GBP4Q96PP9 640 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.84■■□□□ 1.09
RPS6KA3-201ENST00000379565 FBXO3Q9UK99 471 aa21.84■■□□□ 1.09
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