RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376180.7

ITGBL1-202, Transcript of integrin subunit beta like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGBL1, Length 2,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGBL1-202ENST00000376180 KIAA0556O60303 1618 aa26.81■■□□□ 1.88
ITGBL1-202ENST00000376180 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
ITGBL1-202ENST00000376180 DISP1Q96F81 1524 aa26.8■■□□□ 1.88
ITGBL1-202ENST00000376180 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.8■■□□□ 1.88
ITGBL1-202ENST00000376180 ABCC5O15440 1437 aa26.79■■□□□ 1.88
ITGBL1-202ENST00000376180 ROCK1Q13464 1354 aa26.79■■□□□ 1.88
ITGBL1-202ENST00000376180 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.78■■□□□ 1.88
ITGBL1-202ENST00000376180 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
ITGBL1-202ENST00000376180 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.78■■□□□ 1.88
ITGBL1-202ENST00000376180 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
ITGBL1-202ENST00000376180 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
ITGBL1-202ENST00000376180 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
ITGBL1-202ENST00000376180 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
ITGBL1-202ENST00000376180 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.75■■□□□ 1.87
ITGBL1-202ENST00000376180 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.75■■□□□ 1.87
ITGBL1-202ENST00000376180 NCOA1Q15788 1441 aa26.74■■□□□ 1.87
ITGBL1-202ENST00000376180 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.74■■□□□ 1.87
ITGBL1-202ENST00000376180 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.74■■□□□ 1.87
ITGBL1-202ENST00000376180 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.73■■□□□ 1.87
ITGBL1-202ENST00000376180 CCDC184Q52MB2 194 aa26.73■■□□□ 1.87
ITGBL1-202ENST00000376180 IFT140Q96RY7 1462 aa26.73■■□□□ 1.87
ITGBL1-202ENST00000376180 CCDC7Q96M83 1385 aa26.72■■□□□ 1.87
ITGBL1-202ENST00000376180 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
ITGBL1-202ENST00000376180 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
ITGBL1-202ENST00000376180 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
ITGBL1-202ENST00000376180 GRIN2AQ12879 1464 aa26.65■■□□□ 1.86
ITGBL1-202ENST00000376180 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.63■■□□□ 1.85
ITGBL1-202ENST00000376180 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
ITGBL1-202ENST00000376180 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
ITGBL1-202ENST00000376180 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
ITGBL1-202ENST00000376180 PZPP20742 1482 aa26.61■■□□□ 1.85
ITGBL1-202ENST00000376180 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.6■■□□□ 1.85
ITGBL1-202ENST00000376180 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.59■■□□□ 1.85
ITGBL1-202ENST00000376180 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
ITGBL1-202ENST00000376180 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.57■■□□□ 1.84
ITGBL1-202ENST00000376180 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.56■■□□□ 1.84
ITGBL1-202ENST00000376180 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.56■■□□□ 1.84
ITGBL1-202ENST00000376180 MRS2Q9HD23 443 aa26.55■■□□□ 1.84
ITGBL1-202ENST00000376180 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
ITGBL1-202ENST00000376180 KIF14Q15058 1648 aa26.55■■□□□ 1.84
ITGBL1-202ENST00000376180 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.54■■□□□ 1.84
ITGBL1-202ENST00000376180 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.54■■□□□ 1.84
ITGBL1-202ENST00000376180 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
ITGBL1-202ENST00000376180 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.51■■□□□ 1.84
ITGBL1-202ENST00000376180 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.51■■□□□ 1.83
ITGBL1-202ENST00000376180 CEP170Q5SW79 1584 aa26.5■■□□□ 1.83
ITGBL1-202ENST00000376180 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.5■■□□□ 1.83
ITGBL1-202ENST00000376180 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
ITGBL1-202ENST00000376180 MBD5Q9P267 1494 aa26.49■■□□□ 1.83
ITGBL1-202ENST00000376180 ADGRL2O95490 1459 aa26.48■■□□□ 1.83
ITGBL1-202ENST00000376180 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.47■■□□□ 1.83
ITGBL1-202ENST00000376180 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.47■■□□□ 1.83
ITGBL1-202ENST00000376180 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.46■■□□□ 1.83
ITGBL1-202ENST00000376180 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.44■■□□□ 1.82
ITGBL1-202ENST00000376180 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
ITGBL1-202ENST00000376180 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
ITGBL1-202ENST00000376180 PKD2Q13563 968 aa26.42■■□□□ 1.82
ITGBL1-202ENST00000376180 SYNJ2O15056 1496 aa26.4■■□□□ 1.82
ITGBL1-202ENST00000376180 USP47Q96K76 1375 aa26.4■■□□□ 1.82
ITGBL1-202ENST00000376180 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
ITGBL1-202ENST00000376180 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.4■■□□□ 1.82
ITGBL1-202ENST00000376180 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
ITGBL1-202ENST00000376180 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.38■■□□□ 1.81
ITGBL1-202ENST00000376180 FBLN2P98095 1184 aa26.37■■□□□ 1.81
ITGBL1-202ENST00000376180 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.37■■□□□ 1.81
ITGBL1-202ENST00000376180 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.37■■□□□ 1.81
ITGBL1-202ENST00000376180 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
ITGBL1-202ENST00000376180 KDM5CP41229 1560 aa26.36■■□□□ 1.81
ITGBL1-202ENST00000376180 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.34■■□□□ 1.81
ITGBL1-202ENST00000376180 JPH4Q96JJ6 628 aa26.34■■□□□ 1.81
ITGBL1-202ENST00000376180 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.34■■□□□ 1.81
ITGBL1-202ENST00000376180 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
ITGBL1-202ENST00000376180 NUP160Q12769 1436 aa26.31■■□□□ 1.8
ITGBL1-202ENST00000376180 ERCC6Q03468 1493 aa26.3■■□□□ 1.8
ITGBL1-202ENST00000376180 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.3■■□□□ 1.8
ITGBL1-202ENST00000376180 NUP155O75694 1391 aa26.28■■□□□ 1.8
ITGBL1-202ENST00000376180 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.28■■□□□ 1.8
ITGBL1-202ENST00000376180 ABCA8O94911 1581 aa26.28■■□□□ 1.8
ITGBL1-202ENST00000376180 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.27■■□□□ 1.8
ITGBL1-202ENST00000376180 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.27■■□□□ 1.8
ITGBL1-202ENST00000376180 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.27■■□□□ 1.8
ITGBL1-202ENST00000376180 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
ITGBL1-202ENST00000376180 ATP10BO94823 1461 aa26.25■■□□□ 1.79
ITGBL1-202ENST00000376180 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.25■■□□□ 1.79
ITGBL1-202ENST00000376180 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
ITGBL1-202ENST00000376180 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
ITGBL1-202ENST00000376180 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.21■■□□□ 1.79
ITGBL1-202ENST00000376180 NBR1Q14596 966 aa26.21■■□□□ 1.79
ITGBL1-202ENST00000376180 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.2■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.2■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 TSPY4P0CV99 314 aa26.17■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 TSPY10P0CW01 314 aa26.17■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.16■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 KIF15Q9NS87 1388 aa26.16■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 NUDCQ9Y266 331 aa26.15■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 PTPRGP23470 1445 aa26.14■■□□□ 1.77
ITGBL1-202ENST00000376180 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms