RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376180.7

ITGBL1-202, Transcript of integrin subunit beta like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGBL1, Length 2,494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGBL1-202ENST00000376180 KIAA0556O60303 1618 aa26.81■■□□□ 1.88
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ITGBL1-202ENST00000376180 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
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ITGBL1-202ENST00000376180 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.74■■□□□ 1.87
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ITGBL1-202ENST00000376180 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.56■■□□□ 1.84
ITGBL1-202ENST00000376180 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.56■■□□□ 1.84
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ITGBL1-202ENST00000376180 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.54■■□□□ 1.84
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ITGBL1-202ENST00000376180 CEP170Q5SW79 1584 aa26.5■■□□□ 1.83
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ITGBL1-202ENST00000376180 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.3■■□□□ 1.8
ITGBL1-202ENST00000376180 NUP155O75694 1391 aa26.28■■□□□ 1.8
ITGBL1-202ENST00000376180 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.28■■□□□ 1.8
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ITGBL1-202ENST00000376180 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.27■■□□□ 1.8
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ITGBL1-202ENST00000376180 TSPY4P0CV99 314 aa26.17■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 TSPY10P0CW01 314 aa26.17■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.16■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
ITGBL1-202ENST00000376180 KIF15Q9NS87 1388 aa26.16■■□□□ 1.78
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ITGBL1-202ENST00000376180 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.14■■□□□ 1.77
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