RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356924.8

ABCD4-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCD4, Length 3,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-201ENST00000356924 ABCC5O15440 1437 aa16.44■□□□□ 0.22
ABCD4-201ENST00000356924 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.44■□□□□ 0.22
ABCD4-201ENST00000356924 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.44■□□□□ 0.22
ABCD4-201ENST00000356924 NAIPQ13075 1403 aa16.43■□□□□ 0.22
ABCD4-201ENST00000356924 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.43■□□□□ 0.22
ABCD4-201ENST00000356924 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.43■□□□□ 0.22
ABCD4-201ENST00000356924 PREX2Q70Z35 1606 aa16.43■□□□□ 0.22
ABCD4-201ENST00000356924 AKNAQ7Z591 1439 aa16.42■□□□□ 0.22
ABCD4-201ENST00000356924 CROCC2H7BZ55 1655 aa16.41■□□□□ 0.22
ABCD4-201ENST00000356924 CLSPNQ9HAW4 1339 aa16.4■□□□□ 0.22
ABCD4-201ENST00000356924 CHIC2Q9UKJ5 165 aa16.39■□□□□ 0.21
ABCD4-201ENST00000356924 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.38■□□□□ 0.21
ABCD4-201ENST00000356924 MAPKBP1O60336 1514 aa16.38■□□□□ 0.21
ABCD4-201ENST00000356924 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.37■□□□□ 0.21
ABCD4-201ENST00000356924 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ABCD4-201ENST00000356924 ROCK1Q13464 1354 aa16.37■□□□□ 0.21
ABCD4-201ENST00000356924 KDM6BO15054 1643 aa16.36■□□□□ 0.21
ABCD4-201ENST00000356924 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.36■□□□□ 0.21
ABCD4-201ENST00000356924 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa16.36■□□□□ 0.21
ABCD4-201ENST00000356924 KCNH8Q96L42 1107 aa16.34■□□□□ 0.21
ABCD4-201ENST00000356924 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.34■□□□□ 0.21
ABCD4-201ENST00000356924 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.34■□□□□ 0.21
ABCD4-201ENST00000356924 ADGRL2O95490 1459 aa16.33■□□□□ 0.2
ABCD4-201ENST00000356924 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.32■□□□□ 0.2
ABCD4-201ENST00000356924 MBD5Q9P267 1494 aa16.32■□□□□ 0.2
ABCD4-201ENST00000356924 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.31■□□□□ 0.2
ABCD4-201ENST00000356924 PLCH2O75038 1416 aa16.31■□□□□ 0.2
ABCD4-201ENST00000356924 ASXL2Q76L83 1435 aa16.3■□□□□ 0.2
ABCD4-201ENST00000356924 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
ABCD4-201ENST00000356924 NCOA1Q15788 1441 aa16.29■□□□□ 0.2
ABCD4-201ENST00000356924 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.29■□□□□ 0.2
ABCD4-201ENST00000356924 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.29■□□□□ 0.2
ABCD4-201ENST00000356924 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.29■□□□□ 0.2
ABCD4-201ENST00000356924 ABCA9Q8IUA7 1624 aa16.28■□□□□ 0.2
ABCD4-201ENST00000356924 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.27■□□□□ 0.2
ABCD4-201ENST00000356924 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.27■□□□□ 0.2
ABCD4-201ENST00000356924 ARAP3Q8WWN8 1544 aa16.27■□□□□ 0.19
ABCD4-201ENST00000356924 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.26■□□□□ 0.19
ABCD4-201ENST00000356924 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.26■□□□□ 0.19
ABCD4-201ENST00000356924 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.25■□□□□ 0.19
ABCD4-201ENST00000356924 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.25■□□□□ 0.19
ABCD4-201ENST00000356924 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.24■□□□□ 0.19
ABCD4-201ENST00000356924 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.24■□□□□ 0.19
ABCD4-201ENST00000356924 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.23■□□□□ 0.19
ABCD4-201ENST00000356924 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
ABCD4-201ENST00000356924 ABCC1P33527 1531 aa16.23■□□□□ 0.19
ABCD4-201ENST00000356924 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
ABCD4-201ENST00000356924 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.21■□□□□ 0.19
ABCD4-201ENST00000356924 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16.21■□□□□ 0.18
ABCD4-201ENST00000356924 NEUROD1Q13562 356 aa16.2■□□□□ 0.18
ABCD4-201ENST00000356924 TSPY4P0CV99 314 aa16.2■□□□□ 0.18
ABCD4-201ENST00000356924 TSPY10P0CW01 314 aa16.2■□□□□ 0.18
ABCD4-201ENST00000356924 SIN3AQ96ST3 1273 aa16.18■□□□□ 0.18
ABCD4-201ENST00000356924 TRIM52Q96A61 297 aa16.18■□□□□ 0.18
ABCD4-201ENST00000356924 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.16■□□□□ 0.18
ABCD4-201ENST00000356924 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.16■□□□□ 0.18
ABCD4-201ENST00000356924 PLXNC1O60486 1568 aa16.16■□□□□ 0.18
ABCD4-201ENST00000356924 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.16■□□□□ 0.18
ABCD4-201ENST00000356924 FANCAO15360 1455 aa16.15■□□□□ 0.18
ABCD4-201ENST00000356924 KIF15Q9NS87 1388 aa16.15■□□□□ 0.18
ABCD4-201ENST00000356924 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.15■□□□□ 0.18
ABCD4-201ENST00000356924 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.15■□□□□ 0.18
ABCD4-201ENST00000356924 PZPP20742 1482 aa16.14■□□□□ 0.17
ABCD4-201ENST00000356924 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
ABCD4-201ENST00000356924 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.1■□□□□ 0.17
ABCD4-201ENST00000356924 CD109Q6YHK3 1445 aa16.1■□□□□ 0.17
ABCD4-201ENST00000356924 ADGRL1O94910 1474 aa16.09■□□□□ 0.17
ABCD4-201ENST00000356924 CFAP74Q9C0B2 1584 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa16.08■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 DUOX2Q9NRD8 1548 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 SCAPERQ9BY12 1400 aa16.07■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 AFAP1Q8N556 730 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 UNC13BO14795 1591 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 GLI2P10070 1586 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 FOXD1Q16676 465 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.06■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 ATP7AQ04656 1500 aa16.03■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 NUP155O75694 1391 aa16.03■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 ERBINQ96RT1 1412 aa16.03■□□□□ 0.16
ABCD4-201ENST00000356924 DIP2BQ9P265 1576 aa16.01■□□□□ 0.15
ABCD4-201ENST00000356924 TONSLQ96HA7 1378 aa16.01■□□□□ 0.15
ABCD4-201ENST00000356924 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ABCD4-201ENST00000356924 NEO1Q92859 1461 aa16■□□□□ 0.15
ABCD4-201ENST00000356924 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16■□□□□ 0.15
ABCD4-201ENST00000356924 MAGI2Q86UL8 1455 aa16■□□□□ 0.15
ABCD4-201ENST00000356924 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16■□□□□ 0.15
ABCD4-201ENST00000356924 KDM5CP41229 1560 aa15.99■□□□□ 0.15
ABCD4-201ENST00000356924 PKD2Q13563 968 aa15.99■□□□□ 0.15
ABCD4-201ENST00000356924 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.99■□□□□ 0.15
ABCD4-201ENST00000356924 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ABCD4-201ENST00000356924 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.98■□□□□ 0.15
ABCD4-201ENST00000356924 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.98■□□□□ 0.15
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