RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356575.8

MEGF6-202, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 5,455 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-202ENST00000356575 STK26Q9P289 416 aa26.37■■□□□ 1.81
MEGF6-202ENST00000356575 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
MEGF6-202ENST00000356575 PKD2Q13563 968 aa26.35■■□□□ 1.81
MEGF6-202ENST00000356575 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
MEGF6-202ENST00000356575 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
MEGF6-202ENST00000356575 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
MEGF6-202ENST00000356575 CFAP44Q96MT7 982 aa26.32■■□□□ 1.8
MEGF6-202ENST00000356575 CCER2I3L3R5 266 aa26.31■■□□□ 1.8
MEGF6-202ENST00000356575 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
MEGF6-202ENST00000356575 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.3■■□□□ 1.8
MEGF6-202ENST00000356575 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
MEGF6-202ENST00000356575 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.27■■□□□ 1.8
MEGF6-202ENST00000356575 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
MEGF6-202ENST00000356575 APBB1O00213 710 aa26.24■■□□□ 1.79
MEGF6-202ENST00000356575 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
MEGF6-202ENST00000356575 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
MEGF6-202ENST00000356575 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
MEGF6-202ENST00000356575 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
MEGF6-202ENST00000356575 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.23■■□□□ 1.79
MEGF6-202ENST00000356575 SOGA1O94964 1423 aa26.23■■□□□ 1.79
MEGF6-202ENST00000356575 FOXD1Q16676 465 aa26.23■■□□□ 1.79
MEGF6-202ENST00000356575 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.21■■□□□ 1.79
MEGF6-202ENST00000356575 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.21■■□□□ 1.79
MEGF6-202ENST00000356575 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.2■■□□□ 1.79
MEGF6-202ENST00000356575 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
MEGF6-202ENST00000356575 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
MEGF6-202ENST00000356575 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.18■■□□□ 1.78
MEGF6-202ENST00000356575 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
MEGF6-202ENST00000356575 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
MEGF6-202ENST00000356575 CLSTN1O94985 981 aa26.16■■□□□ 1.78
MEGF6-202ENST00000356575 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
MEGF6-202ENST00000356575 NUP155O75694 1391 aa26.16■■□□□ 1.78
MEGF6-202ENST00000356575 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.14■■□□□ 1.78
MEGF6-202ENST00000356575 RALBP1Q15311 655 aa26.14■■□□□ 1.77
MEGF6-202ENST00000356575 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.13■■□□□ 1.77
MEGF6-202ENST00000356575 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.13■■□□□ 1.77
MEGF6-202ENST00000356575 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.13■■□□□ 1.77
MEGF6-202ENST00000356575 DRC7Q8IY82 874 aa26.13■■□□□ 1.77
MEGF6-202ENST00000356575 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
MEGF6-202ENST00000356575 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
MEGF6-202ENST00000356575 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.12■■□□□ 1.77
MEGF6-202ENST00000356575 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.11■■□□□ 1.77
MEGF6-202ENST00000356575 MSNP26038 577 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
MEGF6-202ENST00000356575 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
MEGF6-202ENST00000356575 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.1■■□□□ 1.77
MEGF6-202ENST00000356575 STK31Q9BXU1 1019 aa26.08■■□□□ 1.77
MEGF6-202ENST00000356575 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
MEGF6-202ENST00000356575 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
MEGF6-202ENST00000356575 KIF3BO15066 747 aa26.05■■□□□ 1.76
MEGF6-202ENST00000356575 FMN1Q68DA7 1419 aa26.04■■□□□ 1.76
MEGF6-202ENST00000356575 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.04■■□□□ 1.76
MEGF6-202ENST00000356575 GBP4Q96PP9 640 aa26.03■■□□□ 1.76
MEGF6-202ENST00000356575 GORABQ5T7V8 394 aa26.01■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.01■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.01■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.99■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.99■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.98■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 PTMSP20962 102 aa25.97■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.97■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 EID1Q9Y6B2 187 aa25.97■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 HMMRO75330 724 aa25.96■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.95■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 GPATCH3Q96I76 525 aa25.95■■□□□ 1.75
MEGF6-202ENST00000356575 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
MEGF6-202ENST00000356575 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
MEGF6-202ENST00000356575 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.744e-8■■■□□ 17.4
MEGF6-202ENST00000356575 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
MEGF6-202ENST00000356575 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.91■■□□□ 1.74
MEGF6-202ENST00000356575 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.91■■□□□ 1.74
MEGF6-202ENST00000356575 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.9■■□□□ 1.74
MEGF6-202ENST00000356575 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.9■■□□□ 1.74
MEGF6-202ENST00000356575 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
MEGF6-202ENST00000356575 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.89■■□□□ 1.74
MEGF6-202ENST00000356575 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.89■■□□□ 1.74
MEGF6-202ENST00000356575 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.89■■□□□ 1.73
MEGF6-202ENST00000356575 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.89■■□□□ 1.73
MEGF6-202ENST00000356575 AMPHP49418 695 aa25.89■■□□□ 1.73
MEGF6-202ENST00000356575 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
MEGF6-202ENST00000356575 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
MEGF6-202ENST00000356575 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
MEGF6-202ENST00000356575 NLRP13Q86W25 1043 aa25.88■■□□□ 1.73
MEGF6-202ENST00000356575 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.88■■□□□ 1.73
MEGF6-202ENST00000356575 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.87■■□□□ 1.73
MEGF6-202ENST00000356575 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
MEGF6-202ENST00000356575 ABCC8Q09428 1581 aa25.84■■□□□ 1.73
MEGF6-202ENST00000356575 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
MEGF6-202ENST00000356575 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.84■■□□□ 1.73
MEGF6-202ENST00000356575 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
MEGF6-202ENST00000356575 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
MEGF6-202ENST00000356575 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
MEGF6-202ENST00000356575 TPM4P67936 248 aa25.8■■□□□ 1.72
MEGF6-202ENST00000356575 PDE3BQ13370 1112 aa25.8■■□□□ 1.72
MEGF6-202ENST00000356575 NUTM2FA1L443 756 aa25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms