RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 HSCBQ8IWL3 235 aa28.61■■■□□ 2.17
PTPRM-201ENST00000332175 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.61■■■□□ 2.17
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa28.6■■■□□ 2.17
PTPRM-201ENST00000332175 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.59■■■□□ 2.17
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
PTPRM-201ENST00000332175 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
PTPRM-201ENST00000332175 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PTPRM-201ENST00000332175 NACADO15069 1562 aa28.57■■■□□ 2.16
PTPRM-201ENST00000332175 PKD2Q13563 968 aa28.55■■■□□ 2.16
PTPRM-201ENST00000332175 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
PTPRM-201ENST00000332175 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.53■■■□□ 2.16
PTPRM-201ENST00000332175 MCCP23508 829 aa28.53■■■□□ 2.16
PTPRM-201ENST00000332175 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.5■■■□□ 2.15
PTPRM-201ENST00000332175 SOGA1O94964 1423 aa28.48■■■□□ 2.15
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.46■■■□□ 2.15
PTPRM-201ENST00000332175 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
PTPRM-201ENST00000332175 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
PTPRM-201ENST00000332175 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
PTPRM-201ENST00000332175 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.44■■■□□ 2.14
PTPRM-201ENST00000332175 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
PTPRM-201ENST00000332175 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRM-201ENST00000332175 DRC7Q8IY82 874 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRM-201ENST00000332175 NRDCO43847 1150 aa28.42■■■□□ 2.14
PTPRM-201ENST00000332175 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRM-201ENST00000332175 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
PTPRM-201ENST00000332175 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRM-201ENST00000332175 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
PTPRM-201ENST00000332175 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
PTPRM-201ENST00000332175 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRM-201ENST00000332175 CHMP3Q9Y3E7 222 aa28.33■■■□□ 2.13
PTPRM-201ENST00000332175 NUP155O75694 1391 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRM-201ENST00000332175 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRM-201ENST00000332175 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRM-201ENST00000332175 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
PTPRM-201ENST00000332175 CCER2I3L3R5 266 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRM-201ENST00000332175 MSNP26038 577 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PTPRM-201ENST00000332175 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.12
PTPRM-201ENST00000332175 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.26■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 KIF3BO15066 747 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 ABCC8Q09428 1581 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 GORABQ5T7V8 394 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.111e-6■■■■■ 30.4
PTPRM-201ENST00000332175 NUTM2FA1L443 756 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 CFAP44Q96MT7 982 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 TAF7LQ5H9L4 462 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 STK31Q9BXU1 1019 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
PTPRM-201ENST00000332175 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.2■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 RALBP1Q15311 655 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.17■■■□□ 2.11e-6■■□□□ 13.3
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRM-201ENST00000332175 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.14■■■□□ 2.09
PTPRM-201ENST00000332175 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
PTPRM-201ENST00000332175 EID1Q9Y6B2 187 aa28.12■■■□□ 2.09
PTPRM-201ENST00000332175 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
PTPRM-201ENST00000332175 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.1■■■□□ 2.09
PTPRM-201ENST00000332175 DEKP35659 375 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PTPRM-201ENST00000332175 AMPHP49418 695 aa28.1■■■□□ 2.09
PTPRM-201ENST00000332175 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.09■■■□□ 2.09
PTPRM-201ENST00000332175 GBP4Q96PP9 640 aa28.09■■■□□ 2.09
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.09■■■□□ 2.09
PTPRM-201ENST00000332175 GPATCH3Q96I76 525 aa28.09■■■□□ 2.09
PTPRM-201ENST00000332175 G3V3G9 751 aa28.09■■■□□ 2.09
PTPRM-201ENST00000332175 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.09■■■□□ 2.09
PTPRM-201ENST00000332175 FOXD4L1Q9NU39 408 aa28.09■■■□□ 2.09
PTPRM-201ENST00000332175 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.08■■■□□ 2.08
PTPRM-201ENST00000332175 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.06■■■□□ 2.08
PTPRM-201ENST00000332175 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.04■■■□□ 2.08
PTPRM-201ENST00000332175 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.04■■■□□ 2.08
PTPRM-201ENST00000332175 FMN1Q68DA7 1419 aa28.03■■■□□ 2.08
PTPRM-201ENST00000332175 ARID3AQ99856 593 aa28.02■■■□□ 2.08
PTPRM-201ENST00000332175 PDE4CQ08493 712 aa28.01■■■□□ 2.07
PTPRM-201ENST00000332175 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
PTPRM-201ENST00000332175 L3MBTL2Q969R5 705 aa28■■■□□ 2.07
PTPRM-201ENST00000332175 TOMM22Q9NS69 142 aa28■■■□□ 2.07
PTPRM-201ENST00000332175 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PTPRM-201ENST00000332175 HMMRO75330 724 aa27.99■■■□□ 2.07
PTPRM-201ENST00000332175 CREBRFQ8IUR6 639 aa27.98■■■□□ 2.07
PTPRM-201ENST00000332175 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
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