RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325139.9

CYTH2-201, Transcript of cytohesin 2, humanhuman

TSL 2

Gene CYTH2, Length 1,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH2-201ENST00000325139 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
CYTH2-201ENST00000325139 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.52■■■■■ 4.08
CYTH2-201ENST00000325139 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.5■■■■■ 4.07
CYTH2-201ENST00000325139 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.48■■■■■ 4.07
CYTH2-201ENST00000325139 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.48■■■■■ 4.07
CYTH2-201ENST00000325139 KDM5CP41229 1560 aa40.45■■■■■ 4.07
CYTH2-201ENST00000325139 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.43■■■■■ 4.06
CYTH2-201ENST00000325139 ABCC1P33527 1531 aa40.43■■■■■ 4.06
CYTH2-201ENST00000325139 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.43■■■■■ 4.06
CYTH2-201ENST00000325139 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.42■■■■■ 4.06
CYTH2-201ENST00000325139 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.4■■■■■ 4.06
CYTH2-201ENST00000325139 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.39■■■■■ 4.06
CYTH2-201ENST00000325139 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.39■■■■■ 4.06
CYTH2-201ENST00000325139 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.38■■■■■ 4.06
CYTH2-201ENST00000325139 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.37■■■■■ 4.05
CYTH2-201ENST00000325139 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.36■■■■■ 4.05
CYTH2-201ENST00000325139 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.36■■■■■ 4.05
CYTH2-201ENST00000325139 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.35■■■■■ 4.05
CYTH2-201ENST00000325139 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
CYTH2-201ENST00000325139 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.33■■■■■ 4.05
CYTH2-201ENST00000325139 TIAM1Q13009 1591 aa40.31■■■■■ 4.04
CYTH2-201ENST00000325139 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.31■■■■■ 4.04
CYTH2-201ENST00000325139 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.27■■■■■ 4.04
CYTH2-201ENST00000325139 MADDQ8WXG6 1647 aa40.23■■■■■ 4.03
CYTH2-201ENST00000325139 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.22■■■■■ 4.03
CYTH2-201ENST00000325139 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.21■■■■■ 4.03
CYTH2-201ENST00000325139 ABCA6Q8N139 1617 aa40.2■■■■■ 4.03
CYTH2-201ENST00000325139 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.2■■■■■ 4.03
CYTH2-201ENST00000325139 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.17■■■■■ 4.02
CYTH2-201ENST00000325139 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.16■■■■■ 4.02
CYTH2-201ENST00000325139 REREQ9P2R6 1566 aa40.16■■■■■ 4.02
CYTH2-201ENST00000325139 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.16■■■■■ 4.02
CYTH2-201ENST00000325139 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
CYTH2-201ENST00000325139 MAP3K1Q13233 1512 aa40.14■■■■■ 4.02
CYTH2-201ENST00000325139 ATP10AO60312 1499 aa40.11■■■■■ 4.01
CYTH2-201ENST00000325139 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.09■■■■■ 4.01
CYTH2-201ENST00000325139 AFAP1Q8N556 730 aa40.09■■■■■ 4.01
CYTH2-201ENST00000325139 NCOA2Q15596 1464 aa40.07■■■■■ 4.01
CYTH2-201ENST00000325139 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.07■■■■■ 4
CYTH2-201ENST00000325139 PTPRMP28827 1452 aa40.07■■■■■ 4
CYTH2-201ENST00000325139 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
CYTH2-201ENST00000325139 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.06■■■■■ 4
CYTH2-201ENST00000325139 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.06■■■■■ 4
CYTH2-201ENST00000325139 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
CYTH2-201ENST00000325139 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.01■■■■■ 4
CYTH2-201ENST00000325139 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.01■■■■■ 4
CYTH2-201ENST00000325139 MBD5Q9P267 1494 aa39.95■■■■□ 3.99
CYTH2-201ENST00000325139 AGLP35573 1532 aa39.94■■■■□ 3.98
CYTH2-201ENST00000325139 ATP7AQ04656 1500 aa39.92■■■■□ 3.98
CYTH2-201ENST00000325139 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
CYTH2-201ENST00000325139 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
CYTH2-201ENST00000325139 PLXNC1O60486 1568 aa39.89■■■■□ 3.98
CYTH2-201ENST00000325139 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
CYTH2-201ENST00000325139 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa39.86■■■■□ 3.97
CYTH2-201ENST00000325139 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
CYTH2-201ENST00000325139 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.83■■■■□ 3.97
CYTH2-201ENST00000325139 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
CYTH2-201ENST00000325139 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.79■■■■□ 3.96
CYTH2-201ENST00000325139 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.78■■■■□ 3.96
CYTH2-201ENST00000325139 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.71■■■■□ 3.95
CYTH2-201ENST00000325139 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.71■■■■□ 3.95
CYTH2-201ENST00000325139 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.68■■■■□ 3.94
CYTH2-201ENST00000325139 MYOM3Q5VTT5 1437 aa39.68■■■■□ 3.94
CYTH2-201ENST00000325139 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.68■■■■□ 3.94
CYTH2-201ENST00000325139 MLECQ14165 292 aa39.66■■■■□ 3.94
CYTH2-201ENST00000325139 C3P01024 1663 aa39.65■■■■□ 3.94
CYTH2-201ENST00000325139 A2MP01023 1474 aa39.64■■■■□ 3.94
CYTH2-201ENST00000325139 MIA2Q96PC5 1412 aa39.64■■■■□ 3.94
CYTH2-201ENST00000325139 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.62■■■■□ 3.93
CYTH2-201ENST00000325139 MROH2AA6NES4 1674 aa39.6■■■■□ 3.93
CYTH2-201ENST00000325139 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.59■■■■□ 3.93
CYTH2-201ENST00000325139 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.55■■■■□ 3.92
CYTH2-201ENST00000325139 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.55■■■■□ 3.92
CYTH2-201ENST00000325139 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.52■■■■□ 3.92
CYTH2-201ENST00000325139 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
CYTH2-201ENST00000325139 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
CYTH2-201ENST00000325139 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.45■■■■□ 3.91
CYTH2-201ENST00000325139 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.45■■■■□ 3.91
CYTH2-201ENST00000325139 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.42■■■■□ 3.9
CYTH2-201ENST00000325139 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.42■■■■□ 3.9
CYTH2-201ENST00000325139 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
CYTH2-201ENST00000325139 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
CYTH2-201ENST00000325139 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
CYTH2-201ENST00000325139 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.37■■■■□ 3.89
CYTH2-201ENST00000325139 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
CYTH2-201ENST00000325139 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.34■■■■□ 3.89
CYTH2-201ENST00000325139 APLP2Q06481 763 aa39.34■■■■□ 3.89
CYTH2-201ENST00000325139 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.34■■■■□ 3.89
CYTH2-201ENST00000325139 ABCC5O15440 1437 aa39.31■■■■□ 3.88
CYTH2-201ENST00000325139 MROH1Q8NDA8 1641 aa39.29■■■■□ 3.88
CYTH2-201ENST00000325139 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.28■■■■□ 3.88
CYTH2-201ENST00000325139 DAPK1P53355 1430 aa39.25■■■■□ 3.87
CYTH2-201ENST00000325139 NPATQ14207 1427 aa39.25■■■■□ 3.87
CYTH2-201ENST00000325139 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.23■■■■□ 3.87
CYTH2-201ENST00000325139 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
CYTH2-201ENST00000325139 ZMYM3Q14202 1370 aa39.22■■■■□ 3.87
CYTH2-201ENST00000325139 STRCQ7RTU9 1775 aa39.22■■■■□ 3.87
CYTH2-201ENST00000325139 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.21■■■■□ 3.87
CYTH2-201ENST00000325139 PTPRKQ15262 1439 aa39.2■■■■□ 3.87
CYTH2-201ENST00000325139 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.2■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.3 ms