RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
HOXD8-201ENST00000313173 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.28■■■■□ 3.88
HOXD8-201ENST00000313173 ROCK1Q13464 1354 aa39.28■■■■□ 3.88
HOXD8-201ENST00000313173 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.25■■■■□ 3.87
HOXD8-201ENST00000313173 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.19■■■■□ 3.86
HOXD8-201ENST00000313173 KDM5BQ9UGL1 1544 aa39.18■■■■□ 3.86
HOXD8-201ENST00000313173 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP39.14■■■■□ 3.86
HOXD8-201ENST00000313173 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.14■■■■□ 3.86
HOXD8-201ENST00000313173 KDM6BO15054 1643 aa39.14■■■■□ 3.86
HOXD8-201ENST00000313173 PREX2Q70Z35 1606 aa39.14■■■■□ 3.86
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
HOXD8-201ENST00000313173 ADGRL2O95490 1459 aa39.08■■■■□ 3.85
HOXD8-201ENST00000313173 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.07■■■■□ 3.85
HOXD8-201ENST00000313173 TTC37Q6PGP7 1564 aa39.07■■■■□ 3.84
HOXD8-201ENST00000313173 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.06■■■■□ 3.84
HOXD8-201ENST00000313173 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
HOXD8-201ENST00000313173 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.04■■■■□ 3.84
HOXD8-201ENST00000313173 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.04■■■■□ 3.84
HOXD8-201ENST00000313173 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.04■■■■□ 3.84
HOXD8-201ENST00000313173 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.03■■■■□ 3.84
HOXD8-201ENST00000313173 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.01■■■■□ 3.83
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGEF5Q12774 1597 aa39■■■■□ 3.83
HOXD8-201ENST00000313173 NCOA1Q15788 1441 aa38.99■■■■□ 3.83
HOXD8-201ENST00000313173 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa38.99■■■■□ 3.83
HOXD8-201ENST00000313173 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa38.98■■■■□ 3.83
HOXD8-201ENST00000313173 MYO5CQ9NQX4 1742 aa38.97■■■■□ 3.83
HOXD8-201ENST00000313173 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.94■■■■□ 3.82
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.93■■■■□ 3.82
HOXD8-201ENST00000313173 NEUROD1Q13562 356 aa38.93■■■■□ 3.82
HOXD8-201ENST00000313173 KCNH8Q96L42 1107 aa38.93■■■■□ 3.82
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM52Q96A61 297 aa38.91■■■■□ 3.82
HOXD8-201ENST00000313173 MBD5Q9P267 1494 aa38.91■■■■□ 3.82
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.91■■■■□ 3.82
HOXD8-201ENST00000313173 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
HOXD8-201ENST00000313173 C9orf84Q5VXU9 1444 aa38.89■■■■□ 3.82
HOXD8-201ENST00000313173 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
HOXD8-201ENST00000313173 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.89■■■■□ 3.82
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC141Q6ZP82 1450 aa38.85■■■■□ 3.81
HOXD8-201ENST00000313173 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.83■■■■□ 3.81
HOXD8-201ENST00000313173 ASXL2Q76L83 1435 aa38.81■■■■□ 3.8
HOXD8-201ENST00000313173 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.81■■■■□ 3.8
HOXD8-201ENST00000313173 MPHOSPH9Q99550 1183 aa38.81■■■■□ 3.8
HOXD8-201ENST00000313173 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.8■■■■□ 3.8
HOXD8-201ENST00000313173 RSPH4AQ5TD94 716 aa38.79■■■■□ 3.8
HOXD8-201ENST00000313173 SYCP2Q9BX26 1530 aa38.79■■■■□ 3.8
HOXD8-201ENST00000313173 PLCH2O75038 1416 aa38.79■■■■□ 3.8
HOXD8-201ENST00000313173 TSPY4P0CV99 314 aa38.79■■■■□ 3.8
HOXD8-201ENST00000313173 TSPY10P0CW01 314 aa38.79■■■■□ 3.8
HOXD8-201ENST00000313173 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa38.76■■■■□ 3.79
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa38.74■■■■□ 3.79
HOXD8-201ENST00000313173 TONSLQ96HA7 1378 aa38.73■■■■□ 3.79
HOXD8-201ENST00000313173 MAST1Q9Y2H9 1570 aa38.73■■■■□ 3.79
HOXD8-201ENST00000313173 ARAP3Q8WWN8 1544 aa38.71■■■■□ 3.79
HOXD8-201ENST00000313173 PZPP20742 1482 aa38.68■■■■□ 3.78
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP38.66■■■■□ 3.78
HOXD8-201ENST00000313173 KIF15Q9NS87 1388 aa38.66■■■■□ 3.78
HOXD8-201ENST00000313173 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.63■■■■□ 3.78
HOXD8-201ENST00000313173 ABCC1P33527 1531 aa38.62■■■■□ 3.77
HOXD8-201ENST00000313173 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.62■■■■□ 3.77
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa38.6■■■■□ 3.77
HOXD8-201ENST00000313173 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa38.58■■■■□ 3.77
HOXD8-201ENST00000313173 PLXNC1O60486 1568 aa38.57■■■■□ 3.77
HOXD8-201ENST00000313173 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.56■■■■□ 3.76
HOXD8-201ENST00000313173 FOXD1Q16676 465 aa38.52■■■■□ 3.76
HOXD8-201ENST00000313173 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
HOXD8-201ENST00000313173 NUP155O75694 1391 aa38.44■■■■□ 3.74
HOXD8-201ENST00000313173 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa38.42■■■■□ 3.74
HOXD8-201ENST00000313173 FANCAO15360 1455 aa38.41■■■■□ 3.74
HOXD8-201ENST00000313173 DUOX2Q9NRD8 1548 aa38.4■■■■□ 3.74
HOXD8-201ENST00000313173 UNC13BO14795 1591 aa38.38■■■■□ 3.73
HOXD8-201ENST00000313173 PKD2Q13563 968 aa38.36■■■■□ 3.73
HOXD8-201ENST00000313173 CD109Q6YHK3 1445 aa38.34■■■■□ 3.73
HOXD8-201ENST00000313173 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.33■■■■□ 3.73
HOXD8-201ENST00000313173 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa38.32■■■■□ 3.72
HOXD8-201ENST00000313173 ERBINQ96RT1 1412 aa38.32■■■■□ 3.72
HOXD8-201ENST00000313173 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.3■■■■□ 3.72
HOXD8-201ENST00000313173 FAM135AQ9P2D6 1515 aa38.29■■■■□ 3.72
HOXD8-201ENST00000313173 L3MBTL2Q969R5 705 aa38.28■■■■□ 3.72
HOXD8-201ENST00000313173 ADGRL1O94910 1474 aa38.27■■■■□ 3.72
HOXD8-201ENST00000313173 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.25■■■■□ 3.71
HOXD8-201ENST00000313173 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.23■■■■□ 3.71
HOXD8-201ENST00000313173 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.22■■■■□ 3.71
HOXD8-201ENST00000313173 GLI2P10070 1586 aa38.22■■■■□ 3.71
HOXD8-201ENST00000313173 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.22■■■■□ 3.71
HOXD8-201ENST00000313173 CFAP74Q9C0B2 1584 aa38.21■■■■□ 3.71
HOXD8-201ENST00000313173 AFAP1Q8N556 730 aa38.2■■■■□ 3.71
HOXD8-201ENST00000313173 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.19■■■■□ 3.7
HOXD8-201ENST00000313173 DIP2BQ9P265 1576 aa38.19■■■■□ 3.7
HOXD8-201ENST00000313173 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.19■■■■□ 3.7
HOXD8-201ENST00000313173 MIER1Q8N108 512 aa38.19■■■■□ 3.7
HOXD8-201ENST00000313173 ATP7AQ04656 1500 aa38.18■■■■□ 3.7
HOXD8-201ENST00000313173 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.17■■■■□ 3.7
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.09■■■■□ 3.69
HOXD8-201ENST00000313173 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.05■■■■□ 3.68
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa38.04■■■■□ 3.68
HOXD8-201ENST00000313173 NEO1Q92859 1461 aa38.04■■■■□ 3.68
HOXD8-201ENST00000313173 DEPDC5O75140 1603 aa38.02■■■■□ 3.68
HOXD8-201ENST00000313173 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
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