RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 NCOA1Q15788 1441 aa23.94■■□□□ 1.42
PDE4A-201ENST00000293683 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.94■■□□□ 1.42
PDE4A-201ENST00000293683 PBRM1Q86U86 1689 aa23.93■■□□□ 1.42
PDE4A-201ENST00000293683 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PDE4A-201ENST00000293683 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.9■■□□□ 1.42
PDE4A-201ENST00000293683 DAPK1P53355 1430 aa23.89■■□□□ 1.41
PDE4A-201ENST00000293683 MRS2Q9HD23 443 aa23.89■■□□□ 1.41
PDE4A-201ENST00000293683 ADAMTS12P58397 1594 aa23.88■■□□□ 1.41
PDE4A-201ENST00000293683 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.88■■□□□ 1.41
PDE4A-201ENST00000293683 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PDE4A-201ENST00000293683 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PDE4A-201ENST00000293683 ABCC5O15440 1437 aa23.86■■□□□ 1.41
PDE4A-201ENST00000293683 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.85■■□□□ 1.41
PDE4A-201ENST00000293683 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PDE4A-201ENST00000293683 ROCK1Q13464 1354 aa23.81■■□□□ 1.4
PDE4A-201ENST00000293683 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.8■■□□□ 1.4
PDE4A-201ENST00000293683 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
PDE4A-201ENST00000293683 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
PDE4A-201ENST00000293683 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.78■■□□□ 1.4
PDE4A-201ENST00000293683 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.78■■□□□ 1.4
PDE4A-201ENST00000293683 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PDE4A-201ENST00000293683 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.77■■□□□ 1.4
PDE4A-201ENST00000293683 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.75■■□□□ 1.39
PDE4A-201ENST00000293683 DISP1Q96F81 1524 aa23.74■■□□□ 1.39
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PDE4A-201ENST00000293683 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.72■■□□□ 1.39
PDE4A-201ENST00000293683 KIAA0556O60303 1618 aa23.72■■□□□ 1.39
PDE4A-201ENST00000293683 PZPP20742 1482 aa23.72■■□□□ 1.39
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PDE4A-201ENST00000293683 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.71■■□□□ 1.39
PDE4A-201ENST00000293683 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.69■■□□□ 1.38
PDE4A-201ENST00000293683 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PDE4A-201ENST00000293683 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PDE4A-201ENST00000293683 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.67■■□□□ 1.38
PDE4A-201ENST00000293683 BCL11AQ9H165 835 aa23.67■■□□□ 1.38
PDE4A-201ENST00000293683 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.66■■□□□ 1.38
PDE4A-201ENST00000293683 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
PDE4A-201ENST00000293683 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.65■■□□□ 1.38
PDE4A-201ENST00000293683 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.65■■□□□ 1.38
PDE4A-201ENST00000293683 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.64■■□□□ 1.37
PDE4A-201ENST00000293683 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
PDE4A-201ENST00000293683 USP47Q96K76 1375 aa23.63■■□□□ 1.37
PDE4A-201ENST00000293683 MBD5Q9P267 1494 aa23.63■■□□□ 1.37
PDE4A-201ENST00000293683 PKD2Q13563 968 aa23.6■■□□□ 1.37
PDE4A-201ENST00000293683 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.59■■□□□ 1.37
PDE4A-201ENST00000293683 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
PDE4A-201ENST00000293683 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.58■■□□□ 1.37
PDE4A-201ENST00000293683 KIF14Q15058 1648 aa23.58■■□□□ 1.37
PDE4A-201ENST00000293683 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.57■■□□□ 1.36
PDE4A-201ENST00000293683 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PDE4A-201ENST00000293683 GRIN2AQ12879 1464 aa23.55■■□□□ 1.36
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PDE4A-201ENST00000293683 IFT140Q96RY7 1462 aa23.54■■□□□ 1.36
PDE4A-201ENST00000293683 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.54■■□□□ 1.36
PDE4A-201ENST00000293683 KDM5CP41229 1560 aa23.52■■□□□ 1.36
PDE4A-201ENST00000293683 NUDCQ9Y266 331 aa23.51■■□□□ 1.35
PDE4A-201ENST00000293683 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.5■■□□□ 1.35
PDE4A-201ENST00000293683 ADGRL2O95490 1459 aa23.49■■□□□ 1.35
PDE4A-201ENST00000293683 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.49■■□□□ 1.35
PDE4A-201ENST00000293683 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.48■■□□□ 1.35
PDE4A-201ENST00000293683 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PDE4A-201ENST00000293683 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.47■■□□□ 1.35
PDE4A-201ENST00000293683 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PDE4A-201ENST00000293683 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.45■■□□□ 1.34
PDE4A-201ENST00000293683 NUP155O75694 1391 aa23.44■■□□□ 1.34
PDE4A-201ENST00000293683 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.44■■□□□ 1.34
PDE4A-201ENST00000293683 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.43■■□□□ 1.34
PDE4A-201ENST00000293683 FBLN2P98095 1184 aa23.43■■□□□ 1.34
PDE4A-201ENST00000293683 CEP170Q5SW79 1584 aa23.42■■□□□ 1.34
PDE4A-201ENST00000293683 TMC1Q8TDI8 760 aa23.42■■□□□ 1.34
PDE4A-201ENST00000293683 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.42■■□□□ 1.34
PDE4A-201ENST00000293683 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.42■■□□□ 1.34
PDE4A-201ENST00000293683 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.41■■□□□ 1.34
PDE4A-201ENST00000293683 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PDE4A-201ENST00000293683 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.4■■□□□ 1.34
PDE4A-201ENST00000293683 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.4■■□□□ 1.34
PDE4A-201ENST00000293683 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PDE4A-201ENST00000293683 ERCC6Q03468 1493 aa23.39■■□□□ 1.33
PDE4A-201ENST00000293683 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.37■■□□□ 1.33
PDE4A-201ENST00000293683 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.37■■□□□ 1.33
PDE4A-201ENST00000293683 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PDE4A-201ENST00000293683 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PDE4A-201ENST00000293683 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.35■■□□□ 1.33
PDE4A-201ENST00000293683 KIF15Q9NS87 1388 aa23.34■■□□□ 1.33
PDE4A-201ENST00000293683 JPH4Q96JJ6 628 aa23.33■■□□□ 1.33
PDE4A-201ENST00000293683 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.31■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.31■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.31■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 SYNJ2O15056 1496 aa23.3■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.29■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.28■■□□□ 1.32
PDE4A-201ENST00000293683 TSPY4P0CV99 314 aa23.28■■□□□ 1.32
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