RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.64■■□□□ 1.22
TRPC1-201ENST00000273482 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.64■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.63■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 OSCARQ8IYS5 282 aa22.63■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 SLC24A1O60721 1099 aa22.62■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 KIF3BO15066 747 aa22.61■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.61■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 IFT140Q96RY7 1462 aa22.61■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.6■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.6■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.59■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 NEFMP07197 916 aa22.58■■□□□ 1.21
TRPC1-201ENST00000273482 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.57■■□□□ 1.2
TRPC1-201ENST00000273482 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TRPC1-201ENST00000273482 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
TRPC1-201ENST00000273482 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.53■■□□□ 1.2
TRPC1-201ENST00000273482 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.53■■□□□ 1.2
TRPC1-201ENST00000273482 PRDM2Q13029 1718 aa22.53■■□□□ 1.2
TRPC1-201ENST00000273482 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
TRPC1-201ENST00000273482 KANK1Q14678 1352 aa22.52■■□□□ 1.2
TRPC1-201ENST00000273482 NCOA2Q15596 1464 aa22.51■■□□□ 1.19
TRPC1-201ENST00000273482 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.49■■□□□ 1.19
TRPC1-201ENST00000273482 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TRPC1-201ENST00000273482 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TRPC1-201ENST00000273482 ARXQ96QS3 562 aa22.48■■□□□ 1.19
TRPC1-201ENST00000273482 PLEKHG5O94827 1062 aa22.48■■□□□ 1.19
TRPC1-201ENST00000273482 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.48■■□□□ 1.19
TRPC1-201ENST00000273482 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TRPC1-201ENST00000273482 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.46■■□□□ 1.19
TRPC1-201ENST00000273482 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.196e-6■■■□□ 18.1
TRPC1-201ENST00000273482 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.46■■□□□ 1.19
TRPC1-201ENST00000273482 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TRPC1-201ENST00000273482 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TRPC1-201ENST00000273482 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.4■■□□□ 1.18
TRPC1-201ENST00000273482 CDCA8Q53HL2 280 aa22.4■■□□□ 1.18
TRPC1-201ENST00000273482 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
TRPC1-201ENST00000273482 POGKQ9P215 609 aa22.39■■□□□ 1.18
TRPC1-201ENST00000273482 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.39■■□□□ 1.17
TRPC1-201ENST00000273482 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
TRPC1-201ENST00000273482 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
TRPC1-201ENST00000273482 TMF1P82094 1093 aa22.36■■□□□ 1.17
TRPC1-201ENST00000273482 STK26Q9P289 416 aa22.36■■□□□ 1.17
TRPC1-201ENST00000273482 AFAP1Q8N556 730 aa22.35■■□□□ 1.17
TRPC1-201ENST00000273482 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.35■■□□□ 1.17
TRPC1-201ENST00000273482 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.34■■□□□ 1.17
TRPC1-201ENST00000273482 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TRPC1-201ENST00000273482 TIAM1Q13009 1591 aa22.34■■□□□ 1.17
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.34■■□□□ 1.17
TRPC1-201ENST00000273482 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRPC1-201ENST00000273482 KIF15Q9NS87 1388 aa22.3■■□□□ 1.16
TRPC1-201ENST00000273482 C14orf37Q86TY3 774 aa22.3■■□□□ 1.16
TRPC1-201ENST00000273482 NUDCQ9Y266 331 aa22.29■■□□□ 1.16
TRPC1-201ENST00000273482 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TRPC1-201ENST00000273482 NEUROD2Q15784 382 aa22.29■■□□□ 1.16
TRPC1-201ENST00000273482 RGS3P49796 1198 aa22.28■■□□□ 1.16
TRPC1-201ENST00000273482 SYNJ2O15056 1496 aa22.26■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.26■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 BECN1Q14457 450 aa22.25■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 IQGAP2Q13576 1575 aa22.25■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 UACAQ9BZF9 1416 aa22.25■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.24■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.24■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.24■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.23■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 GRIN2AQ12879 1464 aa22.23■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.22■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 CUL7Q14999 1698 aa22.21■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.2■■□□□ 1.15
TRPC1-201ENST00000273482 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.2■■□□□ 1.14
TRPC1-201ENST00000273482 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TRPC1-201ENST00000273482 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.16■■□□□ 1.14
TRPC1-201ENST00000273482 CFAP53Q96M91 514 aa22.15■■□□□ 1.14
TRPC1-201ENST00000273482 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.15■■□□□ 1.14
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.14■■□□□ 1.13
TRPC1-201ENST00000273482 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TRPC1-201ENST00000273482 HECW1Q76N89 1606 aa22.12■■□□□ 1.13
TRPC1-201ENST00000273482 SOX12O15370 315 aa22.12■■□□□ 1.13
TRPC1-201ENST00000273482 MIA2Q96PC5 1412 aa22.11■■□□□ 1.13
TRPC1-201ENST00000273482 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TRPC1-201ENST00000273482 MSH5O43196 834 aa22.09■■□□□ 1.13
TRPC1-201ENST00000273482 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.09■■□□□ 1.13
TRPC1-201ENST00000273482 HFM1A2PYH4 1435 aa22.08■■□□□ 1.13
TRPC1-201ENST00000273482 USP47Q96K76 1375 aa22.07■■□□□ 1.12
TRPC1-201ENST00000273482 MORC1Q86VD1 984 aa22.07■■□□□ 1.12
TRPC1-201ENST00000273482 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.05■■□□□ 1.12
TRPC1-201ENST00000273482 PDE4AP27815 886 aa22.05■■□□□ 1.12
TRPC1-201ENST00000273482 ARHGEF11O15085 1522 aa22.05■■□□□ 1.12
TRPC1-201ENST00000273482 NAIPQ13075 1403 aa22.05■■□□□ 1.12
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