RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262982.2

CSE1L-201, Transcript of chromosome segregation 1 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSE1L, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1L-201ENST00000262982 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CSE1L-201ENST00000262982 TRIM52Q96A61 297 aa16.32■□□□□ 0.2
CSE1L-201ENST00000262982 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CSE1L-201ENST00000262982 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.31■□□□□ 0.2
CSE1L-201ENST00000262982 KIF14Q15058 1648 aa16.3■□□□□ 0.2
CSE1L-201ENST00000262982 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
CSE1L-201ENST00000262982 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
CSE1L-201ENST00000262982 FOXD1Q16676 465 aa16.27■□□□□ 0.2
CSE1L-201ENST00000262982 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
CSE1L-201ENST00000262982 CCER2I3L3R5 266 aa16.27■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 JPH4Q96JJ6 628 aa16.27■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.27■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.26■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.26■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 ABCA8O94911 1581 aa16.24■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 FBLN2P98095 1184 aa16.24■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 CROCC2H7BZ55 1655 aa16.24■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.23■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.23■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.23■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 ANP32CO43423 234 aa16.22■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 NCOA1Q15788 1441 aa16.21■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 PZPP20742 1482 aa16.21■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.21■□□□□ 0.19
CSE1L-201ENST00000262982 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.2■□□□□ 0.18
CSE1L-201ENST00000262982 ADGRL2O95490 1459 aa16.2■□□□□ 0.18
CSE1L-201ENST00000262982 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CSE1L-201ENST00000262982 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.2■□□□□ 0.18
CSE1L-201ENST00000262982 ATP10BO94823 1461 aa16.19■□□□□ 0.18
CSE1L-201ENST00000262982 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.19■□□□□ 0.18
CSE1L-201ENST00000262982 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.17■□□□□ 0.18
CSE1L-201ENST00000262982 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CSE1L-201ENST00000262982 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
CSE1L-201ENST00000262982 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CSE1L-201ENST00000262982 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CSE1L-201ENST00000262982 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa16.12■□□□□ 0.17
CSE1L-201ENST00000262982 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.11■□□□□ 0.17
CSE1L-201ENST00000262982 MBD5Q9P267 1494 aa16.1■□□□□ 0.17
CSE1L-201ENST00000262982 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.09■□□□□ 0.17
CSE1L-201ENST00000262982 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.09■□□□□ 0.17
CSE1L-201ENST00000262982 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.09■□□□□ 0.17
CSE1L-201ENST00000262982 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CSE1L-201ENST00000262982 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.08■□□□□ 0.17
CSE1L-201ENST00000262982 CCDC7Q96M83 1385 aa16.08■□□□□ 0.17
CSE1L-201ENST00000262982 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.07■□□□□ 0.16
CSE1L-201ENST00000262982 CHD1O14646 1710 aa16.07■□□□□ 0.16
CSE1L-201ENST00000262982 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.06■□□□□ 0.16
CSE1L-201ENST00000262982 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.05■□□□□ 0.16
CSE1L-201ENST00000262982 PTPRGP23470 1445 aa16.05■□□□□ 0.16
CSE1L-201ENST00000262982 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.04■□□□□ 0.16
CSE1L-201ENST00000262982 PKD2Q13563 968 aa16.04■□□□□ 0.16
CSE1L-201ENST00000262982 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.03■□□□□ 0.16
CSE1L-201ENST00000262982 SHROOM2Q13796 1616 aa16.03■□□□□ 0.16
CSE1L-201ENST00000262982 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.02■□□□□ 0.16
CSE1L-201ENST00000262982 PREX2Q70Z35 1606 aa16.01■□□□□ 0.15
CSE1L-201ENST00000262982 FKBP8Q14318 412 aa16.01■□□□□ 0.15
CSE1L-201ENST00000262982 CCDC184Q52MB2 194 aa16.01■□□□□ 0.15
CSE1L-201ENST00000262982 KIF7Q2M1P5 1343 aa16.01■□□□□ 0.15
CSE1L-201ENST00000262982 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
CSE1L-201ENST00000262982 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16■□□□□ 0.15
CSE1L-201ENST00000262982 NUP155O75694 1391 aa15.98■□□□□ 0.15
CSE1L-201ENST00000262982 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
CSE1L-201ENST00000262982 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.97■□□□□ 0.15
CSE1L-201ENST00000262982 KDM5CP41229 1560 aa15.97■□□□□ 0.15
CSE1L-201ENST00000262982 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.97■□□□□ 0.15
CSE1L-201ENST00000262982 KIF15Q9NS87 1388 aa15.96■□□□□ 0.15
CSE1L-201ENST00000262982 BCANQ96GW7 911 aa15.96■□□□□ 0.15
CSE1L-201ENST00000262982 TSPY4P0CV99 314 aa15.96■□□□□ 0.14
CSE1L-201ENST00000262982 TSPY10P0CW01 314 aa15.96■□□□□ 0.14
CSE1L-201ENST00000262982 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.96■□□□□ 0.14
CSE1L-201ENST00000262982 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.95■□□□□ 0.14
CSE1L-201ENST00000262982 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.95■□□□□ 0.14
CSE1L-201ENST00000262982 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
CSE1L-201ENST00000262982 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.143e-7■■■■□ 25.2
CSE1L-201ENST00000262982 USP47Q96K76 1375 aa15.93■□□□□ 0.14
CSE1L-201ENST00000262982 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.93■□□□□ 0.14
CSE1L-201ENST00000262982 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.92■□□□□ 0.14
CSE1L-201ENST00000262982 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.91■□□□□ 0.14
CSE1L-201ENST00000262982 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CSE1L-201ENST00000262982 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.91■□□□□ 0.14
CSE1L-201ENST00000262982 ABCC2Q92887 1545 aa15.9■□□□□ 0.14
CSE1L-201ENST00000262982 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.9■□□□□ 0.14
CSE1L-201ENST00000262982 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CSE1L-201ENST00000262982 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.88■□□□□ 0.13
CSE1L-201ENST00000262982 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.88■□□□□ 0.13
CSE1L-201ENST00000262982 UNC13BO14795 1591 aa15.88■□□□□ 0.13
CSE1L-201ENST00000262982 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.87■□□□□ 0.13
CSE1L-201ENST00000262982 NEFLP07196 543 aa15.87■□□□□ 0.13
CSE1L-201ENST00000262982 MRS2Q9HD23 443 aa15.85■□□□□ 0.13
CSE1L-201ENST00000262982 PLXNC1O60486 1568 aa15.84■□□□□ 0.13
CSE1L-201ENST00000262982 PLA2R1Q13018 1463 aa15.84■□□□□ 0.13
CSE1L-201ENST00000262982 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CSE1L-201ENST00000262982 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.84■□□□□ 0.13
CSE1L-201ENST00000262982 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.83■□□□□ 0.12
CSE1L-201ENST00000262982 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CSE1L-201ENST00000262982 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.81■□□□□ 0.12
CSE1L-201ENST00000262982 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.81■□□□□ 0.12
CSE1L-201ENST00000262982 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.5 ms