RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258098.6

RAB11FIP5-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP5, Length 4,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB11FIP5-201ENST00000258098 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
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RAB11FIP5-201ENST00000258098 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.66■■□□□ 1.7
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.66■■□□□ 1.7
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RAB11FIP5-201ENST00000258098 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.62■■□□□ 1.69
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RAB11FIP5-201ENST00000258098 CDCA8Q53HL2 280 aa25.58■■□□□ 1.69
RAB11FIP5-201ENST00000258098 IQGAP2Q13576 1575 aa25.58■■□□□ 1.69
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RAB11FIP5-201ENST00000258098 PLEKHG5O94827 1062 aa25.49■■□□□ 1.67
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ABCC5O15440 1437 aa25.49■■□□□ 1.67
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RAB11FIP5-201ENST00000258098 ARHGEF11O15085 1522 aa25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP5-201ENST00000258098 POGKQ9P215 609 aa25.42■■□□□ 1.66
RAB11FIP5-201ENST00000258098 GRIN2AQ12879 1464 aa25.4■■□□□ 1.66
RAB11FIP5-201ENST00000258098 MORC1Q86VD1 984 aa25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP5-201ENST00000258098 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.39■■□□□ 1.66
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
RAB11FIP5-201ENST00000258098 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.37■■□□□ 1.65
RAB11FIP5-201ENST00000258098 CFAP53Q96M91 514 aa25.34■■□□□ 1.65
RAB11FIP5-201ENST00000258098 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
RAB11FIP5-201ENST00000258098 SYNJ2O15056 1496 aa25.33■■□□□ 1.65
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