RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.69■■■□□ 2.98
CITED1-201ENST00000246139 PLCH2O75038 1416 aa33.69■■■□□ 2.98
CITED1-201ENST00000246139 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
CITED1-201ENST00000246139 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.67■■■□□ 2.98
CITED1-201ENST00000246139 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.66■■■□□ 2.98
CITED1-201ENST00000246139 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.65■■■□□ 2.98
CITED1-201ENST00000246139 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.65■■■□□ 2.98
CITED1-201ENST00000246139 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.64■■■□□ 2.98
CITED1-201ENST00000246139 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.62■■■□□ 2.97
CITED1-201ENST00000246139 KIF14Q15058 1648 aa33.61■■■□□ 2.97
CITED1-201ENST00000246139 CEP162Q5TB80 1403 aa33.61■■■□□ 2.97
CITED1-201ENST00000246139 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.6■■■□□ 2.97
CITED1-201ENST00000246139 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.59■■■□□ 2.97
CITED1-201ENST00000246139 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.58■■■□□ 2.97
CITED1-201ENST00000246139 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.58■■■□□ 2.97
CITED1-201ENST00000246139 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.54■■■□□ 2.96
CITED1-201ENST00000246139 MLECQ14165 292 aa33.53■■■□□ 2.96
CITED1-201ENST00000246139 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.49■■■□□ 2.95
CITED1-201ENST00000246139 HSPA2P54652 639 aa33.46■■■□□ 2.95
CITED1-201ENST00000246139 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.46■■■□□ 2.95
CITED1-201ENST00000246139 ATP10AO60312 1499 aa33.45■■■□□ 2.95
CITED1-201ENST00000246139 FBXO41Q8TF61 875 aa33.42■■■□□ 2.94
CITED1-201ENST00000246139 AFAP1Q8N556 730 aa33.41■■■□□ 2.94
CITED1-201ENST00000246139 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.41■■■□□ 2.94
CITED1-201ENST00000246139 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.4■■■□□ 2.94
CITED1-201ENST00000246139 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.39■■■□□ 2.94
CITED1-201ENST00000246139 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.39■■■□□ 2.94
CITED1-201ENST00000246139 KDM5CP41229 1560 aa33.37■■■□□ 2.93
CITED1-201ENST00000246139 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33.37■■■□□ 2.93
CITED1-201ENST00000246139 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
CITED1-201ENST00000246139 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.34■■■□□ 2.93
CITED1-201ENST00000246139 PREX2Q70Z35 1606 aa33.31■■■□□ 2.92
CITED1-201ENST00000246139 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
CITED1-201ENST00000246139 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa33.3■■■□□ 2.92
CITED1-201ENST00000246139 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.26■■■□□ 2.91
CITED1-201ENST00000246139 ABCA6Q8N139 1617 aa33.25■■■□□ 2.91
CITED1-201ENST00000246139 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.25■■■□□ 2.91
CITED1-201ENST00000246139 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.24■■■□□ 2.91
CITED1-201ENST00000246139 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
CITED1-201ENST00000246139 ABCC1P33527 1531 aa33.23■■■□□ 2.91
CITED1-201ENST00000246139 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
CITED1-201ENST00000246139 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.22■■■□□ 2.91
CITED1-201ENST00000246139 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.22■■■□□ 2.91
CITED1-201ENST00000246139 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.2■■■□□ 2.91
CITED1-201ENST00000246139 PREX1Q8TCU6 1659 aa33.2■■■□□ 2.9
CITED1-201ENST00000246139 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.19■■■□□ 2.9
CITED1-201ENST00000246139 REREQ9P2R6 1566 aa33.18■■■□□ 2.9
CITED1-201ENST00000246139 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.17■■■□□ 2.9
CITED1-201ENST00000246139 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.14■■■□□ 2.9
CITED1-201ENST00000246139 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.1■■■□□ 2.89
CITED1-201ENST00000246139 AGLP35573 1532 aa33.1■■■□□ 2.89
CITED1-201ENST00000246139 TIAM1Q13009 1591 aa33.09■■■□□ 2.89
CITED1-201ENST00000246139 C3P01024 1663 aa33.08■■■□□ 2.89
CITED1-201ENST00000246139 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
CITED1-201ENST00000246139 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
CITED1-201ENST00000246139 STRCQ7RTU9 1775 aa33.07■■■□□ 2.88
CITED1-201ENST00000246139 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.05■■■□□ 2.88
CITED1-201ENST00000246139 CERKQ8TCT0 537 aa33.05■■■□□ 2.88
CITED1-201ENST00000246139 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.05■■■□□ 2.88
CITED1-201ENST00000246139 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.04■■■□□ 2.88
CITED1-201ENST00000246139 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
CITED1-201ENST00000246139 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.02■■■□□ 2.88
CITED1-201ENST00000246139 NCOA2Q15596 1464 aa33.01■■■□□ 2.88
CITED1-201ENST00000246139 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
CITED1-201ENST00000246139 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.99■■■□□ 2.87
CITED1-201ENST00000246139 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
CITED1-201ENST00000246139 MAP3K1Q13233 1512 aa32.96■■■□□ 2.87
CITED1-201ENST00000246139 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.87
CITED1-201ENST00000246139 APLP2Q06481 763 aa32.9■■■□□ 2.86
CITED1-201ENST00000246139 ATP7AQ04656 1500 aa32.87■■■□□ 2.85
CITED1-201ENST00000246139 MBD5Q9P267 1494 aa32.86■■■□□ 2.85
CITED1-201ENST00000246139 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.86■■■□□ 2.85
CITED1-201ENST00000246139 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.86■■■□□ 2.85
CITED1-201ENST00000246139 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
CITED1-201ENST00000246139 MROH2AA6NES4 1674 aa32.82■■■□□ 2.84
CITED1-201ENST00000246139 PLXNC1O60486 1568 aa32.82■■■□□ 2.84
CITED1-201ENST00000246139 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.81■■■□□ 2.84
CITED1-201ENST00000246139 ZMYM3Q14202 1370 aa32.81■■■□□ 2.84
CITED1-201ENST00000246139 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.8■■■□□ 2.84
CITED1-201ENST00000246139 A2MP01023 1474 aa32.8■■■□□ 2.84
CITED1-201ENST00000246139 PTPRTO14522 1441 aa32.79■■■□□ 2.84
CITED1-201ENST00000246139 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
CITED1-201ENST00000246139 GGT6Q6P531 493 aa32.76■■■□□ 2.83
CITED1-201ENST00000246139 NPATQ14207 1427 aa32.76■■■□□ 2.83
CITED1-201ENST00000246139 NCOA1Q15788 1441 aa32.75■■■□□ 2.83
CITED1-201ENST00000246139 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.74■■■□□ 2.83
CITED1-201ENST00000246139 CCDC141Q6ZP82 1450 aa32.74■■■□□ 2.83
CITED1-201ENST00000246139 TSPY4P0CV99 314 aa32.73■■■□□ 2.83
CITED1-201ENST00000246139 TSPY10P0CW01 314 aa32.73■■■□□ 2.83
CITED1-201ENST00000246139 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.71■■■□□ 2.83
CITED1-201ENST00000246139 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.7■■■□□ 2.83
CITED1-201ENST00000246139 LTBP4Q8N2S1 1624 aa32.69■■■□□ 2.82
CITED1-201ENST00000246139 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.69■■■□□ 2.82
CITED1-201ENST00000246139 MIA2Q96PC5 1412 aa32.68■■■□□ 2.82
CITED1-201ENST00000246139 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
CITED1-201ENST00000246139 PTPRKQ15262 1439 aa32.66■■■□□ 2.82
CITED1-201ENST00000246139 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.65■■■□□ 2.82
CITED1-201ENST00000246139 MYO3AQ8NEV4 1616 aa32.63■■■□□ 2.81
CITED1-201ENST00000246139 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa32.62■■■□□ 2.81
CITED1-201ENST00000246139 KIF3BO15066 747 aa32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms