RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227667.7

APOC3-201, Transcript of apolipoprotein C3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOC3, Length 550 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3-201ENST00000227667 PTPRTO14522 1441 aa18.36■□□□□ 0.53
APOC3-201ENST00000227667 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.36■□□□□ 0.53
APOC3-201ENST00000227667 CFAP74Q9C0B2 1584 aa18.35■□□□□ 0.53
APOC3-201ENST00000227667 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.35■□□□□ 0.53
APOC3-201ENST00000227667 STRCQ7RTU9 1775 aa18.35■□□□□ 0.53
APOC3-201ENST00000227667 ATP10AO60312 1499 aa18.34■□□□□ 0.53
APOC3-201ENST00000227667 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.34■□□□□ 0.53
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APOC3-201ENST00000227667 LTBP4Q8N2S1 1624 aa18.28■□□□□ 0.52
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APOC3-201ENST00000227667 SHANK2Q9UPX8 1470 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC3-201ENST00000227667 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC3-201ENST00000227667 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa17.84■□□□□ 0.45
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APOC3-201ENST00000227667 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.82■□□□□ 0.44
APOC3-201ENST00000227667 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.44
APOC3-201ENST00000227667 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC3-201ENST00000227667 A2ML1A8K2U0 1454 aa17.8■□□□□ 0.44
APOC3-201ENST00000227667 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
APOC3-201ENST00000227667 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.79■□□□□ 0.44
APOC3-201ENST00000227667 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
APOC3-201ENST00000227667 PREX2Q70Z35 1606 aa17.79■□□□□ 0.44
APOC3-201ENST00000227667 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa17.78■□□□□ 0.44
APOC3-201ENST00000227667 ANKLE2Q86XL3 938 aa17.78■□□□□ 0.44
APOC3-201ENST00000227667 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
APOC3-201ENST00000227667 A2MP01023 1474 aa17.76■□□□□ 0.43
APOC3-201ENST00000227667 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
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APOC3-201ENST00000227667 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.43
APOC3-201ENST00000227667 ALKQ9UM73 1620 aa17.72■□□□□ 0.43
APOC3-201ENST00000227667 ATP7AQ04656 1500 aa17.72■□□□□ 0.43
APOC3-201ENST00000227667 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.72■□□□□ 0.43
APOC3-201ENST00000227667 NEURL4Q96JN8 1562 aa17.71■□□□□ 0.43
APOC3-201ENST00000227667 PLXNC1O60486 1568 aa17.7■□□□□ 0.42
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APOC3-201ENST00000227667 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
APOC3-201ENST00000227667 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
APOC3-201ENST00000227667 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.68■□□□□ 0.42
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