RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000006015.3

HOXA11-201, Transcript of homeobox A11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA11, Length 2,295 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11-201ENST00000006015 UACAQ9BZF9 1416 aa27.14■■□□□ 1.94
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HOXA11-201ENST00000006015 CEP170Q5SW79 1584 aa27.03■■□□□ 1.92
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HOXA11-201ENST00000006015 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.98■■□□□ 1.91
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HOXA11-201ENST00000006015 ROCK1Q13464 1354 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXA11-201ENST00000006015 MRS2Q9HD23 443 aa26.76■■□□□ 1.87
HOXA11-201ENST00000006015 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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HOXA11-201ENST00000006015 CCDC7Q96M83 1385 aa26.74■■□□□ 1.87
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HOXA11-201ENST00000006015 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.7■■□□□ 1.87
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HOXA11-201ENST00000006015 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXA11-201ENST00000006015 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXA11-201ENST00000006015 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.59■■□□□ 1.85
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HOXA11-201ENST00000006015 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.57■■□□□ 1.84
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HOXA11-201ENST00000006015 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
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HOXA11-201ENST00000006015 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.54■■□□□ 1.84
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HOXA11-201ENST00000006015 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.51■■□□□ 1.84
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HOXA11-201ENST00000006015 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 PKD2Q13563 968 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 ADGRL2O95490 1459 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.47■■□□□ 1.83
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HOXA11-201ENST00000006015 CHD1O14646 1710 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXA11-201ENST00000006015 TSPY4P0CV99 314 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXA11-201ENST00000006015 TSPY10P0CW01 314 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXA11-201ENST00000006015 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXA11-201ENST00000006015 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXA11-201ENST00000006015 NUP155O75694 1391 aa26.41■■□□□ 1.82
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HOXA11-201ENST00000006015 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
HOXA11-201ENST00000006015 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.39■■□□□ 1.81
HOXA11-201ENST00000006015 USP35Q9P2H5 1018 aa26.35■■□□□ 1.81
HOXA11-201ENST00000006015 KIF15Q9NS87 1388 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXA11-201ENST00000006015 MBD5Q9P267 1494 aa26.34■■□□□ 1.81
HOXA11-201ENST00000006015 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.32■■□□□ 1.8
HOXA11-201ENST00000006015 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
HOXA11-201ENST00000006015 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.29■■□□□ 1.8
HOXA11-201ENST00000006015 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
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