RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000115302.1

Cldn16-201, Transcript of Claudin-16, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cldn16, Length 950 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Hmx1O70218 332 aa13.54□□□□□ -0.24
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Irx5Q9JKQ4 484 aa13.54□□□□□ -0.24
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa13.51□□□□□ -0.25
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Sgip1Q8VD37 806 aa13.48□□□□□ -0.25
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Dnm1lQ8K1M6 742 aa13.47□□□□□ -0.25
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Kdm2aP59997 1161 aa13.45□□□□□ -0.26
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Neurod1Q60867 357 aa13.44□□□□□ -0.26
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gga1Q8R0H9 635 aa13.44□□□□□ -0.26
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ubl4bQ9CQ84 188 aa13.44□□□□□ -0.26
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Mrc2Q64449 1479 aa13.4□□□□□ -0.26
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Mnx1Q9QZW9 404 aa13.39□□□□□ -0.27
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Sptlc1O35704 473 aa13.38□□□□□ -0.27
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Skap1Q3UUV5 355 aa13.38□□□□□ -0.27
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Lce6aD3YV94 81 aa13.35□□□□□ -0.27
Cldn16-201ENSMUST00000115302 P3h3Q8CG70 732 aa13.35□□□□□ -0.27
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Dnajc5P60904 198 aa13.34□□□□□ -0.27
Cldn16-201ENSMUST00000115302 1700006A11RikB9EHI3 544 aa13.31□□□□□ -0.28
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Onecut3Q8K557 490 aa13.3□□□□□ -0.28
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa13.29□□□□□ -0.28
Cldn16-201ENSMUST00000115302 ElnP54320 860 aa13.28□□□□□ -0.28
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Pcdhb20Q91XZ9 799 aa13.27□□□□□ -0.29
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Lrrc14bQ3UJB3 510 aa13.26□□□□□ -0.29
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Lamc3Q9R0B6 1581 aa13.26□□□□□ -0.29
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Speer2E9Q9U2 264 aa13.24□□□□□ -0.29
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Hoxa2P31245 372 aa13.24□□□□□ -0.29
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Sall2Q9QX96 1004 aa13.24□□□□□ -0.29
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Kif15Q6P9L6 1387 aa13.23□□□□□ -0.29
Cldn16-201ENSMUST00000115302 GcgrQ61606 485 aa13.23□□□□□ -0.29
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Cux2P70298 1426 aa13.21□□□□□ -0.3
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Zeb1Q64318 1117 aa13.2□□□□□ -0.3
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Skiv2lQ6NZR5 1244 aa13.2□□□□□ -0.3
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Top2bQ64511 1612 aa13.19□□□□□ -0.3
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Golga3P55937 1487 aa13.18□□□□□ -0.3
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Thap8E9Q695 213 aa13.18□□□□□ -0.3
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Inpp5dQ9ES52 1191 aa13.18□□□□□ -0.3
Cldn16-201ENSMUST00000115302 IncenpQ9WU62 880 aa13.15□□□□□ -0.3
Cldn16-201ENSMUST00000115302 TnnQ80Z71 1560 aa13.15□□□□□ -0.3
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Smpd1Q04519 627 aa13.13□□□□□ -0.31
Cldn16-201ENSMUST00000115302 RragcQ99K70 398 aa13.12□□□□□ -0.31
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Kif21aQ9QXL2 1672 aa13.11□□□□□ -0.31
Cldn16-201ENSMUST00000115302 ZyxQ62523 564 aa13.1□□□□□ -0.31
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa13.09□□□□□ -0.31
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Pdia6Q922R8 440 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Setdb2Q8C267 713 aa13.07□□□□□ -0.32
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Crim1Q9JLL0 1037 aa13.07□□□□□ -0.32
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Cep164Q5DU05 1446 aa13.06□□□□□ -0.32
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Lhx6Q9R1R0 363 aa13.06□□□□□ -0.32
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Fmr1nbQ80ZA7 238 aa13.05□□□□□ -0.32
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ccdc18Q640L5 1455 aa13.04□□□□□ -0.32
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Fmn1Q05860 1466 aa13.04□□□□□ -0.32
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Pbx2O35984 430 aa13.03□□□□□ -0.32
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Eya1P97767 591 aa13.03□□□□□ -0.32
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Camsap1A2AHC3 1581 aa13.02□□□□□ -0.33
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Cngb1E1AZ71 1325 aa13.01□□□□□ -0.33
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm13695A2AK44 830 aa13□□□□□ -0.33
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ffar3Q3UFD7 319 aa12.99□□□□□ -0.33
Cldn16-201ENSMUST00000115302 JmyQ9QXM1 983 aa12.99□□□□□ -0.33
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Klra4Q60651 263 aa12.98□□□□□ -0.33
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Pdcd7Q9WTY1 482 aa12.97□□□□□ -0.33
Cldn16-201ENSMUST00000115302 LipiF6YQT7 476 aa12.96□□□□□ -0.33
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ddx11Q6AXC6 880 aa12.96□□□□□ -0.33
Cldn16-201ENSMUST00000115302 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Masp1P98064 704 aa12.95□□□□□ -0.34
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Myt1lP97500 1187 aa12.94□□□□□ -0.34
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Slc12a5Q91V14 1138 aa12.93□□□□□ -0.34
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Znf354bQ9QXT9 601 aa12.93□□□□□ -0.34
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Rnf166Q3U9F6 237 aa12.92□□□□□ -0.34
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Crocc2F6XLV1 1638 aa12.91□□□□□ -0.34
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gpr37l1Q99JG2 481 aa12.9□□□□□ -0.34
Cldn16-201ENSMUST00000115302 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Plb1Q3TTY0 1478 aa12.88□□□□□ -0.35
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gm11939A2A592 99 aa12.87□□□□□ -0.35
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Prrt3Q6PE13 971 aa12.87□□□□□ -0.35
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Il27Q8K3I6 234 aa12.87□□□□□ -0.35
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Mkrn3Q60764 544 aa12.86□□□□□ -0.35
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Cnksr2Q80YA9 1032 aa12.86□□□□□ -0.35
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Lrfn2Q80TG9 788 aa12.85□□□□□ -0.35
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Grin2bQ01097 1482 aa12.85□□□□□ -0.35
Cldn16-201ENSMUST00000115302 ChgaP26339 463 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Dnajc5gQ8C632 165 aa12.84□□□□□ -0.35
Cldn16-201ENSMUST00000115302 OscarQ8VBT3 265 aa12.84□□□□□ -0.35
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Duox2A2AQ99 1517 aa12.83□□□□□ -0.36
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ift140E9PY46 1464 aa12.82□□□□□ -0.36
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Erbb3Q61526 1339 aa12.82□□□□□ -0.36
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa12.8□□□□□ -0.36
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa12.78□□□□□ -0.36
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Efcab5A0JP43 1406 aa12.78□□□□□ -0.36
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Gabbr2Q80T41 940 aa12.77□□□□□ -0.37
Cldn16-201ENSMUST00000115302 Shroom2A2ALU4 1481 aa12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.2 ms