Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
Mkrn3Q60764 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Mkrn3Q60764 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Mkrn3Q60764 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Mkrn3Q60764 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Mkrn3Q60764 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Mkrn3Q60764 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Mkrn3Q60764 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Mkrn3Q60764 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Mkrn3Q60764 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Mkrn3Q60764 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Mkrn3Q60764 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Mkrn3Q60764 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Mkrn3Q60764 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Mkrn3Q60764 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Mkrn3Q60764 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Mkrn3Q60764 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Mkrn3Q60764 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Mkrn3Q60764 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Mkrn3Q60764 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Mkrn3Q60764 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Mkrn3Q60764 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Mkrn3Q60764 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Mkrn3Q60764 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Mkrn3Q60764 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Mkrn3Q60764 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Mkrn3Q60764 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Mkrn3Q60764 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Mkrn3Q60764 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Mkrn3Q60764 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Mkrn3Q60764 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Mkrn3Q60764 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Mkrn3Q60764 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Mkrn3Q60764 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Mkrn3Q60764 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Mkrn3Q60764 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Mkrn3Q60764 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Mkrn3Q60764 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Mkrn3Q60764 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Mkrn3Q60764 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Mkrn3Q60764 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Mkrn3Q60764 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Mkrn3Q60764 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Mkrn3Q60764 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Mkrn3Q60764 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Mkrn3Q60764 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Mkrn3Q60764 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Mkrn3Q60764 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Mkrn3Q60764 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Mkrn3Q60764 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Mkrn3Q60764 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Mkrn3Q60764 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Mkrn3Q60764 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Mkrn3Q60764 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Mkrn3Q60764 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Mkrn3Q60764 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Mkrn3Q60764 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Mkrn3Q60764 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Mkrn3Q60764 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Mkrn3Q60764 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Mkrn3Q60764 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Mkrn3Q60764 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Mkrn3Q60764 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Mkrn3Q60764 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Mkrn3Q60764 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Mkrn3Q60764 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Mkrn3Q60764 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Mkrn3Q60764 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Mkrn3Q60764 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Mkrn3Q60764 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Mkrn3Q60764 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Mkrn3Q60764 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Mkrn3Q60764 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Mkrn3Q60764 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Mkrn3Q60764 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Mkrn3Q60764 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Mkrn3Q60764 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Mkrn3Q60764 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Mkrn3Q60764 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Mkrn3Q60764 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Mkrn3Q60764 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Mkrn3Q60764 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Mkrn3Q60764 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Mkrn3Q60764 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Mkrn3Q60764 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Mkrn3Q60764 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
Mkrn3Q60764 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Mkrn3Q60764 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Mkrn3Q60764 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Mkrn3Q60764 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Mkrn3Q60764 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Mkrn3Q60764 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Mkrn3Q60764 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Mkrn3Q60764 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Mkrn3Q60764 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Mkrn3Q60764 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Mkrn3Q60764 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Mkrn3Q60764 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Mkrn3Q60764 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Mkrn3Q60764 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.4 ms