RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam71e1A1L3C1 212 aa30.76■■■□□ 2.51
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pkd2O35245 966 aa30.75■■■□□ 2.51
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa30.75■■■□□ 2.51
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp47Q8BY87 1376 aa30.74■■■□□ 2.51
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abca16E9PWJ7 1678 aa30.74■■■□□ 2.51
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa30.72■■■□□ 2.51
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plekhh2Q8C115 1491 aa30.71■■■□□ 2.51
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa30.65■■■□□ 2.5
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Calr4Q3TQS0 420 aa30.64■■■□□ 2.49
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ncoa1P70365 1447 aa30.62■■■□□ 2.49
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myt1Q8CFC2 1127 aa30.62■■■□□ 2.49
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mtus2Q3UHD3 1353 aa30.59■■■□□ 2.49
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adcy10Q8C0T9 1614 aa30.57■■■□□ 2.48
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa30.57■■■□□ 2.48
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa30.56■■■□□ 2.48
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgef11Q68FM7 1552 aa30.55■■■□□ 2.48
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa30.54■■■□□ 2.48
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mrs2Q5NCE8 434 aa30.53■■■□□ 2.48
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Anp32aO35381 247 aa30.52■■■□□ 2.48
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa30.51■■■□□ 2.48
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pik3c2gO70167 1506 aa30.5■■■□□ 2.47
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa30.49■■■□□ 2.47
Trafd1-201ENSMUST00000042312 AlkP97793 1621 aa30.48■■■□□ 2.47
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abcc2Q8VI47 1543 aa30.48■■■□□ 2.47
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Shroom2A2ALU4 1481 aa30.47■■■□□ 2.47
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il16O54824 1322 aa30.47■■■□□ 2.47
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif21bQ9QXL1 1668 aa30.44■■■□□ 2.46
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa30.44■■■□□ 2.46
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa30.43■■■□□ 2.46
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm13695A2AK44 830 aa30.42■■■□□ 2.46
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Exoc6Q8R313 802 aa30.42■■■□□ 2.46
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa30.41■■■□□ 2.46
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rgl3Q3UYI5 709 aa30.39■■■□□ 2.46
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ttll5Q8CHB8 1328 aa30.36■■■□□ 2.45
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trak1Q6PD31 939 aa30.31■■■□□ 2.44
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NrdcQ8BHG1 1161 aa30.3■■■□□ 2.44
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Magi1Q6RHR9 1471 aa30.3■■■□□ 2.44
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dapk1Q80YE7 1442 aa30.29■■■□□ 2.44
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prex2Q3LAC4 1598 aa30.29■■■□□ 2.44
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mroh2aD3Z750 1679 aa30.28■■■□□ 2.44
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Washc2Q6PGL7 1334 aa30.28■■■□□ 2.44
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mbd5B1AYB6 1498 aa30.27■■■□□ 2.44
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rundc1Q0VDN7 615 aa30.26■■■□□ 2.43
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tdrd9Q14BI7 1383 aa30.26■■■□□ 2.43
Trafd1-201ENSMUST00000042312 P3h3Q8CG70 732 aa30.26■■■□□ 2.43
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa30.24■■■□□ 2.43
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Map3k4O08648 1597 aa30.24■■■□□ 2.43
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mug2P28666 1451 aa30.22■■■□□ 2.43
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam163aQ8CAA5 168 aa30.22■■■□□ 2.43
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa30.22■■■□□ 2.43
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plekhg5Q66T02 1073 aa30.19■■■□□ 2.42
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr7Q920I9 1489 aa30.18■■■□□ 2.42
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa30.17■■■□□ 2.42
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa30.16■■■□□ 2.42
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Card11Q8CIS0 1159 aa30.16■■■□□ 2.42
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trpm2Q91YD4 1506 aa30.14■■■□□ 2.42
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Naip6Q9JIB6 1403 aa30.14■■■□□ 2.42
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa30.12■■■□□ 2.41
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Map4P27546 1125 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Supt16hQ920B9 1047 aa30.07■■■□□ 2.4
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myom3A2ABU4 1439 aa30.06■■■□□ 2.4
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Caskin1Q6P9K8 1431 aa30.05■■■□□ 2.4
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa30.03■■■□□ 2.4
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Neo1P97798 1493 aa30■■■□□ 2.39
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Jph4Q80WT0 628 aa29.98■■■□□ 2.39
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ofd1Q80Z25 1017 aa29.98■■■□□ 2.39
Trafd1-201ENSMUST00000042312 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa29.97■■■□□ 2.39
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fmn2Q9JL04 1578 aa29.97■■■□□ 2.39
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dot1lQ6XZL8 1540 aa29.93■■■□□ 2.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rusc2Q80U22 1514 aa29.9■■■□□ 2.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Asxl1P59598 1514 aa29.89■■■□□ 2.38
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zbtb4Q5F293 982 aa29.88■■■□□ 2.37
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Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fancd2Q80V62 1450 aa29.88■■■□□ 2.37
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