RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029047.11

Snx16-201, Transcript of Sorting nexin-16, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Snx16, Length 2,288 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16-201ENSMUST00000029047 Slc24a1Q91WD8 1130 aa23.04■■□□□ 1.28
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Snx16-201ENSMUST00000029047 Plb1Q3TTY0 1478 aa23.02■■□□□ 1.28
Snx16-201ENSMUST00000029047 Setd1bQ8CFT2 1985 aa23.01■■□□□ 1.27
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Snx16-201ENSMUST00000029047 Rock2P70336 1388 aa22.5■■□□□ 1.19
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Snx16-201ENSMUST00000029047 Map4P27546 1125 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
Snx16-201ENSMUST00000029047 Dot1lQ6XZL8 1540 aa22.47■■□□□ 1.19
Snx16-201ENSMUST00000029047 Asxl1P59598 1514 aa22.45■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 Polr3aB2RXC6 1390 aa22.44■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa22.43■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa22.42■■□□□ 1.18
Snx16-201ENSMUST00000029047 Liat1Q810M6 228 aa22.41■■□□□ 1.18
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Snx16-201ENSMUST00000029047 PtprgQ05909 1442 aa22.41■■□□□ 1.18
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