RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026474.4

Gli1-201, Transcript of Zinc finger protein GLI1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gli1, Length 4,057 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1-201ENSMUST00000026474 Clstn2Q9ER65 966 aa20.72■□□□□ 0.91
Gli1-201ENSMUST00000026474 Arhgap5P97393 1501 aa20.72■□□□□ 0.91
Gli1-201ENSMUST00000026474 Atp10dQ8K2X1 1416 aa20.71■□□□□ 0.91
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa20.7■□□□□ 0.9
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm13697A2AK42 830 aa20.7■□□□□ 0.9
Gli1-201ENSMUST00000026474 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fancd2Q80V62 1450 aa20.69■□□□□ 0.9
Gli1-201ENSMUST00000026474 Prex2Q3LAC4 1598 aa20.68■□□□□ 0.9
Gli1-201ENSMUST00000026474 UacaQ8CGB3 1411 aa20.66■□□□□ 0.9
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Gli1-201ENSMUST00000026474 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa20.64■□□□□ 0.89
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Gli1-201ENSMUST00000026474 A2mQ6GQT1 1474 aa20.63■□□□□ 0.89
Gli1-201ENSMUST00000026474 Peg3Q3URU2 1571 aa20.6■□□□□ 0.89
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mphosph9A6H5Y1 991 aa20.6■□□□□ 0.89
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zfp644E9QA22 1323 aa20.59■□□□□ 0.89
Gli1-201ENSMUST00000026474 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kif3bQ61771 747 aa20.59■□□□□ 0.89
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trak1Q6PD31 939 aa20.59■□□□□ 0.89
Gli1-201ENSMUST00000026474 PtprtQ99M80 1454 aa20.58■□□□□ 0.88
Gli1-201ENSMUST00000026474 Abcc5Q9R1X5 1436 aa20.58■□□□□ 0.88
Gli1-201ENSMUST00000026474 Map3k5O35099 1380 aa20.57■□□□□ 0.88
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Gli1-201ENSMUST00000026474 Arhgef11Q68FM7 1552 aa20.56■□□□□ 0.88
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pkd2O35245 966 aa20.55■□□□□ 0.88
Gli1-201ENSMUST00000026474 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fhad1A6PWD2 1420 aa20.55■□□□□ 0.88
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rgl3Q3UYI5 709 aa20.54■□□□□ 0.88
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Gli1-201ENSMUST00000026474 Slc24a1Q91WD8 1130 aa20.53■□□□□ 0.88
Gli1-201ENSMUST00000026474 Wdr7Q920I9 1489 aa20.53■□□□□ 0.88
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mlh3A0A1Y7VMP7 1443 aa20.53■□□□□ 0.88
Gli1-201ENSMUST00000026474 Adgrl3Q80TS3 1537 aa20.52■□□□□ 0.88
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cep170Q6A065 1588 aa20.52■□□□□ 0.88
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zbtb4Q5F293 982 aa20.52■□□□□ 0.87
Gli1-201ENSMUST00000026474 Naip2Q9QUK4 1447 aa20.51■□□□□ 0.87
Gli1-201ENSMUST00000026474 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa20.5■□□□□ 0.87
Gli1-201ENSMUST00000026474 Znf608Q56A10 1511 aa20.5■□□□□ 0.87
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kdm5bQ80Y84 1544 aa20.49■□□□□ 0.87
Gli1-201ENSMUST00000026474 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa20.49■□□□□ 0.87
Gli1-201ENSMUST00000026474 AI481877A2ALV5 1481 aa20.49■□□□□ 0.87
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trappc8E9PWG2 1437 aa20.48■□□□□ 0.87
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vps8Q0P5W1 1427 aa20.48■□□□□ 0.87
Gli1-201ENSMUST00000026474 Caskin1Q6P9K8 1431 aa20.46■□□□□ 0.87
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mroh2aD3Z750 1679 aa20.45■□□□□ 0.86
Gli1-201ENSMUST00000026474 Il16O54824 1322 aa20.44■□□□□ 0.86
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa20.44■□□□□ 0.86
Gli1-201ENSMUST00000026474 Atp1b4Q99ME6 356 aa20.44■□□□□ 0.86
Gli1-201ENSMUST00000026474 Adcy10Q8C0T9 1614 aa20.44■□□□□ 0.86
Gli1-201ENSMUST00000026474 Prdm16A2A935 1275 aa20.41■□□□□ 0.86
Gli1-201ENSMUST00000026474 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Gli1-201ENSMUST00000026474 Chd1P40201 1711 aa20.41■□□□□ 0.86
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Gli1-201ENSMUST00000026474 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa20.37■□□□□ 0.85
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa20.35■□□□□ 0.85
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pde4cQ3UEI1 686 aa20.34■□□□□ 0.85
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ttll5Q8CHB8 1328 aa20.33■□□□□ 0.85
Gli1-201ENSMUST00000026474 MyclP10166 368 aa20.33■□□□□ 0.84
Gli1-201ENSMUST00000026474 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gcc2Q8CHG3 1679 aa20.32■□□□□ 0.84
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm13695A2AK44 830 aa20.32■□□□□ 0.84
Gli1-201ENSMUST00000026474 P3h3Q8CG70 732 aa20.29■□□□□ 0.84
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kdm2aP59997 1161 aa20.29■□□□□ 0.84
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa20.29■□□□□ 0.84
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa20.28■□□□□ 0.84
Gli1-201ENSMUST00000026474 OvosQ3UU35 1456 aa20.28■□□□□ 0.84
Gli1-201ENSMUST00000026474 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Gli1-201ENSMUST00000026474 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa20.26■□□□□ 0.83
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa20.25■□□□□ 0.83
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rfx7F8VPJ6 1459 aa20.25■□□□□ 0.83
Gli1-201ENSMUST00000026474 Usp47Q8BY87 1376 aa20.25■□□□□ 0.83
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pcgf6Q99NA9 353 aa20.24■□□□□ 0.83
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sall2Q9QX96 1004 aa20.22■□□□□ 0.83
Gli1-201ENSMUST00000026474 NhsB1AV60 1647 aa20.22■□□□□ 0.83
Gli1-201ENSMUST00000026474 ClspnQ80YR7 1315 aa20.21■□□□□ 0.83
Gli1-201ENSMUST00000026474 Col17a1Q07563 1470 aa20.21■□□□□ 0.83
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Gli1-201ENSMUST00000026474 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa20.2■□□□□ 0.82
Gli1-201ENSMUST00000026474 Depdc5P61460 1591 aa20.19■□□□□ 0.82
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Gli1-201ENSMUST00000026474 Cd109Q8R422 1442 aa20.18■□□□□ 0.82
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cfap74Q3UY96 1578 aa20.18■□□□□ 0.82
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa20.17■□□□□ 0.82
Gli1-201ENSMUST00000026474 Dnajc5P60904 198 aa20.17■□□□□ 0.82
Gli1-201ENSMUST00000026474 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa20.16■□□□□ 0.82
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ak9G3UYQ4 1894 aa20.15■□□□□ 0.82
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ssh2Q5SW75 1423 aa20.13■□□□□ 0.81
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nsd2Q8BVE8 1365 aa20.12■□□□□ 0.81
Gli1-201ENSMUST00000026474 Card11Q8CIS0 1159 aa20.12■□□□□ 0.81
Gli1-201ENSMUST00000026474 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm20521D3Z5F7 333 aa20.11■□□□□ 0.81
Gli1-201ENSMUST00000026474 Abca8bQ8K440 1620 aa20.1■□□□□ 0.81
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ptch1Q61115 1434 aa20.1■□□□□ 0.81
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
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