RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plb1Q3TTY0 1478 aa23.78■■□□□ 1.4
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ncoa1P70365 1447 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrc2Q64449 1479 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Calr4Q3TQS0 420 aa23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Usp47Q8BY87 1376 aa23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ncoa3O09000 1398 aa23.75■■□□□ 1.39
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif21bQ9QXL1 1668 aa23.73■■□□□ 1.39
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pkd2O35245 966 aa23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plekhh2Q8C115 1491 aa23.71■■□□□ 1.39
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa23.71■■□□□ 1.39
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AlkP97793 1621 aa23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm13695A2AK44 830 aa23.56■■□□□ 1.36
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Il16O54824 1322 aa23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mbd5B1AYB6 1498 aa23.53■■□□□ 1.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Exoc6Q8R313 802 aa23.52■■□□□ 1.36
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Shroom2A2ALU4 1481 aa23.51■■□□□ 1.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Map3k4O08648 1597 aa23.48■■□□□ 1.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgap27A2AB59 869 aa23.47■■□□□ 1.35
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa23.45■■□□□ 1.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mroh2aD3Z750 1679 aa23.44■■□□□ 1.34
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mug2P28666 1451 aa23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dapk1Q80YE7 1442 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttll5Q8CHB8 1328 aa23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa23.41■■□□□ 1.34
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rgl3Q3UYI5 709 aa23.39■■□□□ 1.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trpm2Q91YD4 1506 aa23.39■■□□□ 1.34
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Supt16hQ920B9 1047 aa23.39■■□□□ 1.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Naip6Q9JIB6 1403 aa23.39■■□□□ 1.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 P3h3Q8CG70 732 aa23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NrdcQ8BHG1 1161 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Magi1Q6RHR9 1471 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plekhg5Q66T02 1073 aa23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr7Q920I9 1489 aa23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Myom3A2ABU4 1439 aa23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rundc1Q0VDN7 615 aa23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trak1Q6PD31 939 aa23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa23.33■■□□□ 1.33
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tdrd9Q14BI7 1383 aa23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam163aQ8CAA5 168 aa23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa23.26■■□□□ 1.31
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Card11Q8CIS0 1159 aa23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fmn2Q9JL04 1578 aa23.23■■□□□ 1.31
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Caskin1Q6P9K8 1431 aa23.21■■□□□ 1.31
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Liat1Q810M6 228 aa23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Asxl1P59598 1514 aa23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ofd1Q80Z25 1017 aa23.17■■□□□ 1.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rtl5Q5DTT4 599 aa23.16■■□□□ 1.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Map4P27546 1125 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 L3mbtl2P59178 703 aa23.15■■□□□ 1.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pak3Q61036 559 aa23.13■■□□□ 1.29
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrc9Q8CDN9 1456 aa23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Polr3aB2RXC6 1390 aa23.11■■□□□ 1.29
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