RNA–Protein interactions for RNA: YOR068C

VAM10, Transcript of Protein involved in vacuole morphogenesis, yeast

Gene VAM10, Length 345 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAM10	YOR068C	MSP1	P28737	362 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	AGP2	P38090	596 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	REG2	P38232	338 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	SMF2	P38778	549 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	YDR089W	P38966	869 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	AFG3	P39925	761 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	OPT1	P40897	799 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	TAX4	P47030	604 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	YJL043W	P47053	257 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	ESBP6	P53918	673 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	SMA1	Q02651	245 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	PLM2	Q04383	521 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	ECM18	Q04623	453 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	IVY1	Q04934	453 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	YLR345W	Q06137	509 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	SKG3	Q06315	1026 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	OSW1	Q08692	278 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	NMD4	Q12129	218 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	PSY3	Q12318	242 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	RTN2	Q12443	393 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	TUS1	Q06412	1307 aa		3.41	□□□□□ -1.86
VAM10	YOR068C	GPA1	P08539	472 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SEC63	P14906	663 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YPK2	P18961	677 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	ADK2	P26364	225 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SRB5	P32585	307 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	COT1	P32798	439 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	PEX2	P32800	271 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SSO1	P32867	290 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	RPC34	P32910	317 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SRB2	P34162	210 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	GCS1	P35197	352 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	MNL1	P38888	796 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	PSD1	P39006	500 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	NPR2	P39923	615 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YTA12	P40341	825 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	NAS2	P40555	220 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	IAH1	P41734	238 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	IME4	P41833	600 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SSU1	P41930	458 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SNX4	P47057	423 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	NPA3	P47122	385 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	KAP114	P53067	1004 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SGF73	P53165	657 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	CUL3	P53202	744 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	VPS75	P53853	264 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	PGA2	P53903	129 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SPO19	Q03029	223 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	ATC1	Q04005	294 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YDR109C	Q04585	715 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YLR413W	Q06689	675 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	GRS2	Q06817	618 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	BAG7	Q12128	409 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	GRX6	Q12438	231 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		3.4	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SGS1	P35187	1447 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	STE2	D6VTK4	431 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	COX1	P00401	534 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	STE3	P06783	470 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YML003W	P0CF16	290 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	CBS1	P14066	229 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YAK1	P14680	807 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	VMA16	P23968	213 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	GSY2	P27472	705 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SUA5	P32579	426 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	HOT13	P36078	116 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YKR015C	P36111	568 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	NUP133	P36161	1157 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	GEX2	P36173	615 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	MAL33	P38157	468 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	VMA22	P38784	181 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	SUR2	P38992	349 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	MRX1	P40050	688 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	LTP1	P40347	161 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	ALG5	P40350	334 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	GLO1	P50107	326 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	DSD1	P53095	428 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YGR066C	P53242	292 aa		3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
VAM10	YOR068C	YNL146W	P53906	100 aa		3.39	□□□□□ -1.87

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