RNA–Protein interactions for RNA: YNL143C

YNL143C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YNL143C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL143C	YNL143C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	IRC7	P43623	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	SNG1	P46950	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	COS5	P47187	383 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	ATP23	P53722	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	DUG3	P53871	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	SKO1	Q02100	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	ACL4	Q03771	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	COS7	Q07788	383 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	THP1	Q08231	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	RAV1	P47104	1357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	SPS4	P09937	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	URA4	P20051	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	SHP1	P34223	423 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	YHR210C	P38893	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	URB2	P47108	1174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	UBP8	P50102	471 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	BUD32	P53323	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	HOT1	Q03213	719 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	DCI1	Q08558	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	OSW1	Q08692	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	VPS54	Q12071	889 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	RRD2	Q12461	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	PPZ2	P33329	710 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	NIP100	P33420	868 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	FLO10	P36170	1169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	STV1	P37296	890 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	ROT2	P38138	954 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	ECM27	P47144	725 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
YNL143C	YNL143C	SKS1	Q12505	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	EDE1	P34216	1381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	BNR1	P40450	1375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	CLN1	P20437	546 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	CNA1	P23287	553 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	COQ3	P27680	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
YNL143C	YNL143C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	MSN2	P33748	704 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	ARA1	P38115	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	PHO90	P39535	881 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	ARP10	Q04549	284 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	VAM3	Q12241	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	RRI1	Q12468	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL143C	YNL143C	RHO2	P06781	192 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	MBR1	P23493	339 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	SWH1	P35845	1188 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	BNA4	P38169	460 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	LEU5	P38702	357 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	SOL4	P53315	255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	EOS1	P53938	366 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	SHR3	Q02774	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	CAC2	Q04199	468 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
YNL143C	YNL143C	RDR1	Q08904	546 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	PEP5	P12868	1029 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	RPB8	P20436	146 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	GEX1	P25596	615 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	BRF1	P29056	596 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	HIR2	P32480	875 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	NMD5	P46970	1048 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	YJL132W	P47014	750 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	RSC9	Q03124	581 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	MCP2	Q06567	569 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	RIP1	P08067	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	SPO7	P18410	259 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	ATP10	P18496	279 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	MSP1	P28737	362 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL143C	YNL143C	ATP11	P32453	318 aa		4.81	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 64.8 ms