RNA–Protein interactions for RNA: YKR049C

FMP46, Transcript of Putative redox protein containing a thioredoxin fold, yeast

Gene FMP46, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FMP46	YKR049C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	HXT7	P39004	570 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	CEM1	P39525	442 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	FRT2	P39734	528 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	MNT3	P40549	630 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	COS4	P43542	379 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YGL176C	P46945	554 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YJR154W	P47181	346 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	MPS1	P54199	764 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	SDH1	Q00711	640 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	IRC15	Q02733	499 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	GLO2	Q05584	274 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YEH2	Q07950	538 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	UAF30	Q08747	228 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	RGT2	Q12300	763 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	GPR1	Q12361	961 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	SRN2	Q99176	213 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	FMP27	Q06179	2628 aa		4.13	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	TRP3	P00937	484 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	HTA2	P04912	132 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	SNF5	P18480	905 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	MRPL32	P25348	183 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	OCA4	P25366	362 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	RNQ1	P25367	405 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	SPS22	P25380	463 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	PHO91	P27514	894 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	MEI5	P32489	222 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	TOA1	P32773	286 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	SFC1	P33303	322 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	DOM34	P33309	386 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	CAF4	P36130	643 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	FTH1	P38310	465 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	TSC10	P38342	320 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	RFC3	P38629	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	RGA1	P39083	1007 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	LTP1	P40347	161 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	APQ12	P40532	138 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	IAH1	P41734	238 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	HXT16	P47185	567 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	SGF73	P53165	657 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	BNI4	P53858	892 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	HXT15	P54854	567 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	UBP2	Q01476	1272 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	ECM11	Q04110	302 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	SPC24	Q04477	213 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	BNA5	Q05979	453 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	ESA1	Q08649	445 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	DIN7	Q12086	430 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	NMD4	Q12129	218 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.12	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	GAL7	P08431	366 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	CMP2	P14747	604 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
FMP46	YKR049C	BUB3	P26449	341 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	RAD14	P28519	371 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	STE14	P32584	239 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	SKN1	P33336	771 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	EMC3	P36039	253 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	ERP5	P38819	212 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.11	□□□□□ -1.75	not detected
FMP46	YKR049C	FAA3	P39002	694 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	LRO1	P40345	661 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	YJL049W	P47048	450 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	GTO1	P48239	356 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	IMA1	P53051	589 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	KXD1	P53158	218 aa		4.11	□□□□□ -1.75
FMP46	YKR049C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75

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