RNA–Protein interactions for RNA: YHR149C

SKG6, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene SKG6, Length 2,205 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKG6	YHR149C	ULA1	Q12059	462 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	CHS2	P14180	963 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	AMD2	P22580	549 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	PGS1	P25578	521 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	MGT1	P26188	188 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	NGG1	P32494	702 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	VPS17	P32913	551 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	MRPL3	P36516	390 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	STV1	P37296	890 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	CTP1	P38152	299 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SEA4	P38164	1038 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	BMT2	P38278	337 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	LYS9	P38999	446 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SLM1	P40485	686 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SER2	P42941	309 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	ABM1	P47146	123 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	IMA1	P53051	589 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	AIM14	P53109	570 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SLD3	P53135	668 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	IMO32	P53219	342 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	RSM27	P53305	110 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	PLM2	Q04383	521 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	APC4	Q04601	652 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	MFB1	Q04922	465 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	PSF3	Q12146	194 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SKG6	YHR149C	FOB1	O13329	566 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MET2	P08465	486 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PCK1	P10963	549 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YCK1	P23291	538 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	GUT2	P32191	649 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	GSH1	P32477	678 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SRB2	P34162	210 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ELF1	P36053	145 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	GPX2	P38143	162 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YBR259W	P38338	688 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	BIG1	P38813	335 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	XDJ1	P39102	459 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MNN1	P39106	762 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YEL020C	P39994	560 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	LSB6	P42951	607 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	BIO3	P50277	480 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	NCS6	P53088	359 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PEX8	P53248	589 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	GPI1	P53306	609 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SPC98	P53540	846 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	FOL1	P53848	824 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.74	not detected
SKG6	YHR149C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	TFC6	Q06339	672 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	HDA3	Q06623	655 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SVS1	Q12254	260 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	GPM3	Q12326	303 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SAS5	Q99314	248 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	TPK1	P06244	397 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RAD7	P06779	565 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	BAR1	P12630	587 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MIP1	P15801	1254 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	FPS1	P23900	669 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ADP1	P25371	1049 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	CHS3	P29465	1165 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	MRPL37	P36532	105 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	BZZ1	P38822	633 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	FHL1	P39521	936 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	SAW1	P39735	261 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	CHS6	P40955	746 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	THI6	P41835	540 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YJL043W	P47053	257 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	YJR030C	P47101	745 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ECM27	P47144	725 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	CPR8	P53728	308 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	TVP15	Q03860	143 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	RUB1	Q03919	77 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	AKR2	Q12013	749 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	AIM7	Q12156	149 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	GLO4	Q12320	285 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SKG6	YHR149C	TRP3	P00937	484 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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