RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	MRP20	P32387	263 aa		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	SDH3	P33421	198 aa		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	UTH1	P36135	365 aa		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	YGR127W	P53275	312 aa		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	MSC1	Q03104	513 aa		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	YOR365C	Q08844	703 aa		2.81	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	NUP133	P36161	1157 aa		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	YHR210C	P38893	341 aa		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	YGR126W	P53274	230 aa		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	EFM6	P53970	246 aa		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	TSA2	Q04120	196 aa		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	PHO92	Q06390	306 aa		2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	MRP21	P38175	177 aa		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	ICS2	P38284	255 aa		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	TMA108	P40462	946 aa		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	IGO1	P53897	168 aa		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	HAL1	Q01766	294 aa		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	TRM8	Q12009	286 aa		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	NYV1	Q12255	253 aa		2.79	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	HCS1	P34243	683 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	PIM1	P36775	1133 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	FAR3	P46671	204 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	AAD10	P47182	288 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	TOF1	P53840	1238 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	YDL057W	Q07379	328 aa		2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
VAR1	Q0140	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	PET123	P17558	318 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	PCL1	P24867	279 aa		2.77	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	IMG1	P25626	169 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	PAH1	P32567	862 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	MID2	P36027	376 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	NAT2	P37293	288 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	FAU1	P40099	211 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	GPI1	P53306	609 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	YLR108C	Q12259	485 aa		2.76	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	BNA1	P47096	177 aa		2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	CIN4	P39110	191 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	VID22	Q05934	901 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	TCO89	Q08921	799 aa		2.74	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	GCD10	P41814	478 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	RRT5	P43607	289 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	AVT4	P50944	713 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	IBD2	P53892	351 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	NBP2	Q12163	236 aa		2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	NDI1	P32340	513 aa		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	PAN6	P40459	309 aa		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	RSN1	Q03516	953 aa		2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
VAR1	Q0140	DAL2	P25335	343 aa		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	YBR144C	P34215	104 aa		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	DUG2	P38149	878 aa		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	GOR1	P53839	350 aa		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	YOL087C	Q99247	1116 aa		2.71	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	BSC5	P53755	489 aa		2.7	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.69	□□□□□ -1.98	not detected
VAR1	Q0140	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	DBF20	P32328	564 aa		2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	SHP1	P34223	423 aa		2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	FRE2	P36033	711 aa		2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	RSM22	P36056	628 aa		2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	PEX25	Q02969	394 aa		2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	BNA4	P38169	460 aa		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	YER010C	P40011	234 aa		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	UBX4	P54730	416 aa		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	SNO4	Q04902	237 aa		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	THP1	Q08231	455 aa		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	YPL272C	Q08984	517 aa		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	HSP32	Q08992	237 aa		2.68	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
VAR1	Q0140	MAL33	P38157	468 aa		2.67	□□□□□ -1.98

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