RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP33.91■■■■□ 3.02
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ECHS1-201ENST00000368547 MMP19Q99542 508 aa33.91■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHA4Q9UN74 947 aa33.91■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa33.91■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 H3BQV1 296 aa33.9■■■■□ 3.02
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ECHS1-201ENST00000368547 STX6O43752 255 aa33.9■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 CTGFP29279 349 aa33.9■■■■□ 3.02
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ECHS1-201ENST00000368547 UBE2SQ16763 222 aa33.9■■■■□ 3.02
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC30A10Q6XR72 485 aa33.9■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 GLT8D2Q9H1C3 349 aa33.9■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 CYP39A1Q9NYL5 469 aa33.9■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 POLR2MP0CAP2 368 aa33.9■■■■□ 3.02
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ECHS1-201ENST00000368547 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 GALNT17Q6IS24 598 aa33.9■■■■□ 3.02
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa33.9■■■■□ 3.02
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ECHS1-201ENST00000368547 STRNO43815 780 aa33.89■■■■□ 3.02
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ECHS1-201ENST00000368547 PFASO15067 1338 aa33.88■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 DOCK3Q8IZD9 2030 aa33.88■■■■□ 3.01
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ECHS1-201ENST00000368547 PSMC4P43686 418 aa33.88■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 KIF22Q14807 665 aa33.88■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 NFKBIBQ15653 356 aa33.88■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
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ECHS1-201ENST00000368547 ABRAQ8N0Z2 381 aa33.87■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
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ECHS1-201ENST00000368547 GBP4Q96PP9 640 aa33.87■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 MAF1Q9H063 256 aa33.87■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 LCTP09848 1927 aa33.87■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 FKTNO75072 461 aa33.86■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 KRT2P35908 639 aa33.86■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP33.86■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 OXER1Q8TDS5 423 aa33.86■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM47Q96LD4 638 aa33.86■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 BRMS1Q9HCU9 246 aa33.86■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 CLK2P49760 499 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
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ECHS1-201ENST00000368547 CD99L2Q8TCZ2 262 aa33.86■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 RASGRP4Q8TDF6 673 aa33.86■■■■□ 3.01
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ECHS1-201ENST00000368547 PGK2P07205 417 aa33.85■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 ADORA2AP29274 412 aa33.85■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 CAP1Q01518 475 aa33.85■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 FCHSD1Q86WN1 690 aa33.85■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 SLC15A5A6NIM6 579 aa33.84■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 BTBD18B2RXH4 712 aa33.84■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 M0R2N6 131 aa33.84■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa33.84■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 NR5A1Q13285 461 aa33.83■■■■□ 3.01
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ECHS1-201ENST00000368547 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa33.83■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa33.83■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa33.82■■■■□ 3.01
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ECHS1-201ENST00000368547 MORN1Q5T089 497 aa33.82■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 MCTP1Q6DN14 999 aa33.82■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 ERO1AQ96HE7 468 aa33.82■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 MTMR6Q9Y217 621 aa33.82■■■■□ 3.01
ECHS1-201ENST00000368547 POTEB2H3BUK9 544 aa33.82■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 SPDYE3A6NKU9 549 aa33.81■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 PGBD1Q96JS3 809 aa33.81■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 TAAR1Q96RJ0 339 aa33.81■■■■□ 3
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ECHS1-201ENST00000368547 AP3B2Q13367 1082 aa33.8■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 FAM133AQ8N9E0 248 aa33.8■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 NUDT12Q9BQG2 462 aa33.8■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 FOXN1O15353 648 aa33.79■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 DPP9Q86TI2 863 aa33.79■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 TNFRSF25Q93038 417 aa33.79■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
ECHS1-201ENST00000368547 GJD2Q9UKL4 321 aa33.79■■■■□ 3
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