RNA–Protein interactions for RNA: YML113W

DAT1, Transcript of DNA binding protein that recognizes oligo(dA).oligo(dT) tracts, yeast

Gene DAT1, Length 747 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DAT1	YML113W	YKL100C	P34248	587 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	10.12	□□□□□ -0.79	RIP-Chip
DAT1	YML113W	SSN3	P39073	555 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YAL037W	P39728	267 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	HXT16	P47185	567 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	SLM2	P53955	656 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	HXT15	P54854	567 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YPL109C	Q02981	657 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	FMN1	Q03778	218 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	TRM12	Q04235	462 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	GTB1	Q04924	702 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YOR012W	Q12351	137 aa		10.12	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	PMR1	P13586	950 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	TEC1	P18412	486 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	RAD14	P28519	371 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	PIM1	P36775	1133 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	CTP1	P38152	299 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YHL008C	P38750	627 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	CEM1	P39525	442 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YEL073C	P39974	107 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	TY4A-J	P47023	414 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YJR154W	P47181	346 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	USE1	P53146	245 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	GTR2	P53290	341 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YOL019W	Q08157	551 aa		10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	TRP3	P00937	484 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	RSC6	P25632	483 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	MLS1	P30952	554 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	PDR3	P33200	976 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	THI80	P35202	319 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	VRP1	P37370	817 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	SSU1	P41930	458 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	TIS11	P47977	285 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	SHY1	P53266	389 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YOL087C	Q99247	1116 aa		10.1	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	CDC21	P06785	304 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	COS2	P0CX12	379 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	COS3	P0CX13	379 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YAR066W	P0CX18	203 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YHR214W	P0CX19	203 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	RSR1	P13856	272 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	ATP11	P32453	318 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	FZO1	P38297	855 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YHR045W	P38775	560 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	MEP1	P40260	492 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	COS4	P43542	379 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	ZRG17	P53735	605 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	ECM9	Q02202	377 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YML131W	Q03102	365 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YET2	Q04210	160 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	PFA4	Q12006	378 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	YDR056C	Q12025	205 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	MCD1	Q12158	566 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	ATG34	Q12292	412 aa		10.09	□□□□□ -0.79
DAT1	YML113W	RNQ1	P25367	405 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	PTC1	P35182	281 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	LRG1	P35688	1017 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	MRPL37	P36532	105 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	HSE1	P38753	452 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	HST3	P53687	447 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	BCH1	Q05029	724 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	ESA1	Q08649	445 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	YLR049C	Q12110	428 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	SKM1	Q12469	655 aa		10.08	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	PHO5	P00635	467 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	DGR2	P32330	852 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	COX13	P32799	129 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	SDH3	P33421	198 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	GAT1	P43574	510 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	FAR10	Q06001	478 aa		10.07	□□□□□ -0.8
DAT1	YML113W	OSW1	Q08692	278 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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